CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G525
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	UPF0613 protein PB24D3.06c
Genome location	ctg1:10236339..10241606
RNA-Seq Expression	Cucsat.G525
Synteny	Cucsat.G525
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR013744 - Fusarinine C esterase SidJ IPR029058 - Alpha/Beta hydrolase fold

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6597471.1 hypothetical protein SDJN03_10651, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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TYK17158.1 UPF0613 protein PB24D3.06c [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_004134156.2 UPF0613 protein PB24D3.06c [Cucumis sativus]

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XP_008438726.1 PREDICTED: UPF0613 protein PB24D3.06c [Cucumis melo]

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XP_038877710.1 UPF0613 protein PB24D3.06c [Benincasa hispida]

2.67e-147

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0L7R4 Uncharacterized protein

3.68e-162

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A0A1S3AX38 UPF0613 protein PB24D3.06c

1.86e-157

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A0A5D3D0X8 UPF0613 protein PB24D3.06c

3.32e-155

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A0A6J1FEG6 UPF0613 protein PB24D3.06c

6.30e-138

89.11

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A0A6J1IF85 UPF0613 protein PB24D3.06c

5.15e-137

88.71

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q4WF56 Fusarinine C esterase sidJ

6.1e-15

33.95

Show/hide

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        K    G L  Y    +   + T   ++   ++F+GGL DG   T YL  LA AL   +WSL  + L+SSY  +G   L +D  E+ Q + Y+        
Subjt:  KNHFRGFLFKYGPKPIQVAFKTGDYKQ--QVIFIGGLTDGFMATEYLESLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLI-------

Query:  -NKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYM-RTNAAC-------------SRAVRGAILQAPVSDRE
             S  +VL+GHSTG Q ++HY+ R N                   + GAI+QAPVSDRE
Subjt:  -NKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYM-RTNAAC-------------SRAVRGAILQAPVSDRE

Q9C0Y8 UPF0613 protein PB24D3.06c

1.2e-18

35.15

Show/hide

Query:  VIFIGGLTDGFMATEYLESLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLIN----KEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACSRA
        ++F+GGL DG +   Y++ L   LD+  WS+VQ+   SSY G+GT SL++D ++L + V Y ++       +  +VL+GHSTG Q++++Y+  +   +  
Subjt:  VIFIGGLTDGFMATEYLESLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLIN----KEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACSRA

Query:  VRGAILQAPVSDRE--YRATLPE-TAAMID-LASTMISEGRGLDLMPRE-------ADPSSPNNC
        + G I QAPVSDRE  Y+    E T  ++D + +  + +G G D++PR          P+S N C
Subjt:  VRGAILQAPVSDRE--YRATLPE-TAAMID-LASTMISEGRGLDLMPRE-------ADPSSPNNC

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G19050.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein

5.8e-93

73.12

Show/hide

Query:  MNLSLSSSSPSSVPPVSVSSSSSSSSPSYSSSSSSTTSWLSGIVRGRADRSASMKMSANTS---SGSPVGDSPGPVVKKNHFRGFLFKYGPKPIQVAFKT
        M+LSL SSS ++    + S+S SSSSP+ +SSSS+TTSW SGIVRGR D+S + K+S ++S    GS  GD  GP+  KN FRG LFKYGPK IQVAFKT
Subjt:  MNLSLSSSSPSSVPPVSVSSSSSSSSPSYSSSSSSTTSWLSGIVRGRADRSASMKMSANTS---SGSPVGDSPGPVVKKNHFRGFLFKYGPKPIQVAFKT

Query:  GDYKQQVIFIGGLTDGFMATEYLESLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLINKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACS
        G+YKQQVIFIGGLTDG +AT+YLE LAIALDKEKWSLVQ+L+SSSYSG+GTSSL+QDA+E+DQL+++LINKE+SEGVVLLGHSTGCQDIV+YM TNAACS
Subjt:  GDYKQQVIFIGGLTDGFMATEYLESLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLINKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACS

Query:  RAVRGAILQAPVSDREYRATLPETAAMIDLASTMISEGRGLDLMPREADPSSP
        RAVR AILQAPVSDREY+ATLPET AMIDLA+ MI EGRG +LMPREADP +P
Subjt:  RAVRGAILQAPVSDREYRATLPETAAMIDLASTMISEGRGLDLMPREADPSSP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATCTCTCGCTTTCTTCTTCATCTCCATCTTCAGTTCCTCCCGTCTCTGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCCTACTCCTCTTCGTCGTCCTCGACCAC
TTCATGGCTCTCCGGCATAGTTCGCGGCCGAGCTGATAGGTCTGCGAGCATGAAAATGTCGGCCAACACTTCATCCGGCTCTCCTGTTGGGGATTCCCCTGGTCCTGTCG
TTAAGAAGAATCATTTCCGTGGGTTTCTCTTCAAGTACGGTCCCAAGCCAATTCAGGTTGCATTTAAGACAGGAGATTACAAACAGCAAGTCATATTCATTGGTGGATTG
ACCGATGGCTTTATGGCAACAGAATATTTGGAATCTCTTGCAATTGCTTTGGATAAAGAAAAATGGTCACTTGTTCAGATACTTCTCTCATCATCTTATAGTGGATATGG
TACCTCCAGCTTGCAACAAGATGCCAAGGAGCTTGATCAGCTAGTAAGTTATCTGATCAATAAAGAAGACTCTGAGGGTGTTGTATTACTTGGACATAGTACTGGCTGTC
AGGATATAGTCCATTATATGCGTACAAATGCAGCTTGCTCTCGAGCAGTTCGTGGTGCCATTTTGCAGGCTCCAGTTAGTGATCGGGAGTATAGAGCAACTCTTCCTGAA
ACAGCTGCCATGATTGACTTAGCTTCAACTATGATAAGTGAAGGCAGAGGATTAGATCTTATGCCAAGAGAGGCAGATCCATCTTCTCCAAATAACTGCCACTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNLSLSSSSPSSVPPVSVSSSSSSSSPSYSSSSSSTTSWLSGIVRGRADRSASMKMSANTSSGSPVGDSPGPVVKKNHFRGFLFKYGPKPIQVAFKTGDYKQQVIFIGGL
TDGFMATEYLESLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLINKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACSRAVRGAILQAPVSDREYRATLPE
TAAMIDLASTMISEGRGLDLMPREADPSSPNNCH

Cucsat.G525 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome