; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G5699 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G5699
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationctg1402:869064..871393
RNA-Seq ExpressionCucsat.G5699
SyntenyCucsat.G5699
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
GO:0009543 - chloroplast thylakoid lumen (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004138481.2 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucumis sativus]6.42e-12099.45Show/hide
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XP_008441390.1 PREDICTED: thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucumis melo]8.43e-11796.13Show/hide
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XP_022133545.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]6.03e-10877.78Show/hide
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XP_022991097.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita maxima]8.56e-10889.19Show/hide
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XP_038883977.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Benincasa hispida]4.54e-11293.01Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA71 Uncharacterized protein1.20e-12099.45Show/hide
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A0A1S3B3C6 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic4.08e-11796.13Show/hide
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A0A5A7TDC5 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 14.08e-11796.13Show/hide
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A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X12.92e-10877.78Show/hide
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        GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGA LLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTI GADFTDVPLREDQR
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X24.14e-10889.19Show/hide
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        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS INGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr322.5e-1443.65Show/hide
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        L G+DFSGK+L    F  + L  +NF  A+L GA F  + L GADL  ADL      L +   A+L+NA L  A+    T F  + I GADF+   L   
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Query:  QREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC
        + + LC  ADGVNP TG +TRE+L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic4.0e-7381.71Show/hide
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        R+ V SLG+     +  A VSASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSGKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGA LLGASFFDADLTGADLS+ADLR
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Query:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLCD
        GADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR YLCKVADGVN TTGNATR+TLLC+
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P73709 Uncharacterized protein slr18196.5e-0737.93Show/hide
Query:  GQDLSGKDFSGKTL---------IKQDFK-------TSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTS
        G DL G D SG TL         ++Q+ K        +IL +A+ +GAN+ G     ADL+ A+L +A+LR  D     + KA+LS ANL+GAL T + +
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Query:  FRGSTINGADFTDVPL
          G+ +NGAD  +  L
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Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic2.4e-0933.33Show/hide
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        G +G G        DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+
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         I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP27.7e-0838.74Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G NL  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A  
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Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein1.7e-1033.33Show/hide
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        G +G G        DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+
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Query:  TINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC
         I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein1.7e-1033.33Show/hide
Query:  GPYGAGVTR---GQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS
        G +G G        DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+
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Query:  TINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC
         I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein7.3e-5480.43Show/hide
Query:  RNFVLSLGQP----TFLAFVSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLR
        R+ V SLG+     +  A VSASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSGKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGA LLGASFFDADLTGADLS+ADLR
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Query:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGA
        GADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.8e-7481.71Show/hide
Query:  RNFVLSLGQP----TFLAFVSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLR
        R+ V SLG+     +  A VSASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSGKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGA LLGASFFDADLTGADLS+ADLR
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Query:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLCD
        GADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR YLCKVADGVN TTGNATR+TLLC+
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein5.4e-0938.74Show/hide
Query:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGADF
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G NL  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A  
Subjt:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGADF

Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
Subjt:  TDVPLREDQRE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AATGGGGGTTCGGTCGGTGGTGACATTATCGGTTATCCAATTCGAAAACGAAAACAAACTTTTGAATTTCAGCTTTCCGGAAATGGCTCTGCTCAATGCTTCATTATGTT
GTTCCACTCCCAAAATTCCTTCAAGATCTCACCTCCTTCTTCCTCCCTCCATTTCCCTCCATTCTACTTCTCAGGTAACCTCCCCTTCTCCCTTCCCACTCCCATTTTCT
TCTCCTTTATCTTCCAATGCTTTCATTTTACCCACTATATGAAGGTATTCAACCAACAACTTCAAGCTACAAGGAATTTCGTTCTTTCCCTTGGACAACCCACTTTCCTC
GCTTTCGTTTCTGCCTCTTTGTTCCTCGCCGATCCTGCCCTAGCTTTTAAGGGCGGAGGTCCTTACGGAGCTGGGGTCACTAGAGGTCAGGATCTCTCTGGGAAAGATTT
CAGTGGGAAGACCTTAATCAAGCAAGATTTCAAAACGTCTATTTTACGGCAAGCTAATTTTAAAGGTGCCAACTTATTAGGTGCTAGCTTCTTCGATGCTGATTTAACAG
GGGCGGATCTTTCAGATGCTGATCTCAGAGGTGCAGATTTTTCTCTTGCCAATGTTACCAAGGCAAATTTAAGCAATGCCAACCTTGAAGGTGCACTGGCCACGGGAAAT
ACCTCTTTCCGTGGTTCAACAATAAACGGCGCTGACTTCACTGACGTGCCATTGAGAGAGGATCAGCGGGAATACCTTTGCAAAGTTGCAGATGGGGTAAACCCAACTAC
TGGAAATGCAACCCGAGAGACCTTGCTCTGTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATGGGGGTTCGGTCGGTGGTGACATTATCGGTTATCCAATTCGAAAACGAAAACAAACTTTTGAATTTCAGCTTTCCGGAAATGGCTCTGCTCAATGCTTCATTATGTT
GTTCCACTCCCAAAATTCCTTCAAGATCTCACCTCCTTCTTCCTCCCTCCATTTCCCTCCATTCTACTTCTCAGGTAACCTCCCCTTCTCCCTTCCCACTCCCATTTTCT
TCTCCTTTATCTTCCAATGCTTTCATTTTACCCACTATATGAAGGTATTCAACCAACAACTTCAAGCTACAAGGAATTTCGTTCTTTCCCTTGGACAACCCACTTTCCTC
GCTTTCGTTTCTGCCTCTTTGTTCCTCGCCGATCCTGCCCTAGCTTTTAAGGGCGGAGGTCCTTACGGAGCTGGGGTCACTAGAGGTCAGGATCTCTCTGGGAAAGATTT
CAGTGGGAAGACCTTAATCAAGCAAGATTTCAAAACGTCTATTTTACGGCAAGCTAATTTTAAAGGTGCCAACTTATTAGGTGCTAGCTTCTTCGATGCTGATTTAACAG
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ACCTCTTTCCGTGGTTCAACAATAAACGGCGCTGACTTCACTGACGTGCCATTGAGAGAGGATCAGCGGGAATACCTTTGCAAAGTTGCAGATGGGGTAAACCCAACTAC
TGGAAATGCAACCCGAGAGACCTTGCTCTGTGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NGGSVGGDIIGYPIRKRKQTFEFQLSGNGSAQCFIMLFHSQNSFKISPPSSSLHFPPFYFSGNLPFSLPTPIFFSFIFQCFHFTHYMKVFNQQLQATRNFVLSLGQPTFL
AFVSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGANLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGN
TSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLCD