; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G5739 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G5739
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionRING-H2 finger protein
Genome locationctg1402:1582733..1585427
RNA-Seq ExpressionCucsat.G5739
SyntenyCucsat.G5739
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052006.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis melo var. makuwa]1.51e-12394.21Show/hide
Query:  MESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIP
        MESNHHRPR  RLLLD DTTA PSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTA+GLKKSALRQIP
Subjt:  MESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIP

Query:  VAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
        VAVYGSETGLEIRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL+EQQSVSESA  EAGNR AGNSSASGQG
Subjt:  VAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG

XP_011656436.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis sativus]1.82e-153100Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGIEKLALMI
        IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGIEKLALMI
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGIEKLALMI

Query:  ILKLLHQQGIIPTCTNI
        ILKLLHQQGIIPTCTNI
Subjt:  ILKLLHQQGIIPTCTNI

XP_022134542.1 RING-H2 finger protein ATL74 [Momordica charantia]5.97e-11788.08Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        M M S+HHR RP R LLD D TAPPSNG+RTR+SY+NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFET GGT++RL ATGLKKSALRQ
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGI
        IPVAVYGSE+GLEIRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNH FHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS SESAV EAGNR AGNSSA GQGI
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGI

XP_023550807.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.93e-11586.98Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        M M S+HHRPRP RLLLD +TT  PSNGSRTRNSY NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRF+FETGGGTASRL ATGLKKSALR+
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
        +PV VYGSE+GL IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL EQQS SES   +AGNR AGNSSASGQG
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG

XP_038885444.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Benincasa hispida]8.19e-12091.24Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        M MESNHHRPRP RLLLD DTTA PSNGSRTRNSY+NEANFDTNMVIILAALLCALI ALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRL ATGLKKSALRQ
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGIE
        IPVAVYGSE+GL+IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS SESA  EAGN  AGNSSASGQG E
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGIE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAH2 RING-type domain-containing protein4.13e-135100Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
        IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG

A0A5D3BXT6 RING-H2 finger protein ATL727.31e-12494.21Show/hide
Query:  MESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIP
        MESNHHRPR  RLLLD DTTA PSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTA+GLKKSALRQIP
Subjt:  MESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIP

Query:  VAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
        VAVYGSETGLEIRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL+EQQSVSESA  EAGNR AGNSSASGQG
Subjt:  VAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG

A0A6J1BZW4 RING-H2 finger protein ATL742.89e-11788.08Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        M M S+HHR RP R LLD D TAPPSNG+RTR+SY+NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFET GGT++RL ATGLKKSALRQ
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGI
        IPVAVYGSE+GLEIRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNH FHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS SESAV EAGNR AGNSSA GQGI
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGI

A0A6J1FF16 RING-H2 finger protein ATL74-like3.79e-11586.46Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        M M S+HHRPRP RLLLD +TT  PSNGSRTRNSY NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCA RCSRRF+FETGGGTASRL ATGLKKSALR+
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
        +PV VYGSE+GL IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL EQQS SES   +AGNR AGNSSASGQG
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG

A0A6J1JVF4 RING-H2 finger protein ATL74-like5.39e-11586.46Show/hide
Query:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ
        M M S+HHRPRP RLLLD +TT  PSNGSRTRNSY NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRF+FETGGGTASRL ATGLKKSALR+
Subjt:  MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQ

Query:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG
        +PV VYGSE+GL IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL EQQS SES   +AGNR AGN SASGQG
Subjt:  IPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0C034 RING-H2 finger protein ATL102.0e-3047.37Show/hide
Query:  NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTAT---GLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK
        +E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF++GE+++
Subjt:  NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTAT---GLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK

Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E
Subjt:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE

Q6NQG7 RING-H2 finger protein ATL787.5e-3850.68Show/hide
Query:  YNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK
        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F+A E++K
Subjt:  YNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK

Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQ-QSVSESAVTEAGN
        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++  + +++ + T + N
Subjt:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQ-QSVSESAVTEAGN

Q9FLC6 RING-H2 finger protein ATL731.0e-4258.39Show/hide
Query:  TTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP
        T A P     + ++  N A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C 
Subjt:  TTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP

Query:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS
        ICLGDF+ GE +++LPKCNHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+
Subjt:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS

Q9LZV8 RING-H2 finger protein ATL741.0e-3954.25Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE
        RLLL+       ++GS   + Y  + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   ++
Subjt:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE

Query:  IRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        I  T+C ICLG+F  GE++++LP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
Subjt:  IRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE

Q9SG96 RING-H2 finger protein ATL721.7e-4558.9Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV
        RLLL+P   AP +   + +    N+  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
Subjt:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV

Query:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK+++LPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
Subjt:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49220.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-3147.37Show/hide
Query:  NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTAT---GLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK
        +E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF++GE+++
Subjt:  NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTAT---GLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK

Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E
Subjt:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE

AT1G49230.1 RING/U-box superfamily protein5.3e-3950.68Show/hide
Query:  YNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK
        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F+A E++K
Subjt:  YNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK

Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQ-QSVSESAVTEAGN
        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++  + +++ + T + N
Subjt:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQ-QSVSESAVTEAGN

AT3G10910.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-4658.9Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV
        RLLL+P   AP +   + +    N+  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
Subjt:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV

Query:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK+++LPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
Subjt:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ

AT5G01880.1 RING/U-box superfamily protein7.4e-4154.25Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE
        RLLL+       ++GS   + Y  + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   ++
Subjt:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE

Query:  IRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        I  T+C ICLG+F  GE++++LP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
Subjt:  IRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE

AT5G05280.1 RING/U-box superfamily protein7.2e-4458.39Show/hide
Query:  TTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP
        T A P     + ++  N A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C 
Subjt:  TTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP

Query:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS
        ICLGDF+ GE +++LPKCNHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+
Subjt:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCGCGTCCCCCTCGCCTCCTCCTCGACCCCGACACGACGGCACCACCGTCAAATGGAAGCAGAACGCGAAATTCATATAACAA
TGAAGCCAATTTCGATACAAACATGGTGATAATTCTTGCCGCGTTACTCTGCGCACTGATTTGCGCTCTAGGATTGAACTCAATCGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GACGGTTCGCCTTCGAAACAGGCGGCGGCACAGCCTCGCGTCTCACCGCTACAGGGCTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATCCCGGTCGCCGTGTATGGGTCGGAAACA
GGCCTAGAGATCCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTAGGAGATTTCATGGCCGGCGAGAAAATAAAAATACTCCCGAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCATCATGTCCGACATGTCGTCAATCACTGCTGGAACAACAATCCGTTTCGGAATCGGCGGTAACCGAGGCGGGTAATCGAGGCGCCG
GAAATTCATCGGCTAGCGGGCAAGGGATTGAGAAGTTGGCATTGATGATTATCCTCAAATTACTTCACCAACAAGGCATAATTCCTACTTGTACAAATATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCGCGTCCCCCTCGCCTCCTCCTCGACCCCGACACGACGGCACCACCGTCAAATGGAAGCAGAACGCGAAATTCATATAACAA
TGAAGCCAATTTCGATACAAACATGGTGATAATTCTTGCCGCGTTACTCTGCGCACTGATTTGCGCTCTAGGATTGAACTCAATCGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GACGGTTCGCCTTCGAAACAGGCGGCGGCACAGCCTCGCGTCTCACCGCTACAGGGCTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATCCCGGTCGCCGTGTATGGGTCGGAAACA
GGCCTAGAGATCCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTAGGAGATTTCATGGCCGGCGAGAAAATAAAAATACTCCCGAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCATCATGTCCGACATGTCGTCAATCACTGCTGGAACAACAATCCGTTTCGGAATCGGCGGTAACCGAGGCGGGTAATCGAGGCGCCG
GAAATTCATCGGCTAGCGGGCAAGGGATTGAGAAGTTGGCATTGATGATTATCCTCAAATTACTTCACCAACAAGGCATAATTCCTACTTGTACAAATATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSET
GLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGNSSASGQGIEKLALMIILKLLHQQGIIPTCTNI