CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G5930
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	Transmembrane protein, putative
Genome location	ctg1402:2605274..2607891
RNA-Seq Expression	Cucsat.G5930
Synteny	Cucsat.G5930
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAA0049627.1 putative transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]

3.07e-236

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KAG6601797.1 hypothetical protein SDJN03_07030, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_004150537.1 uncharacterized protein LOC101210554 [Cucumis sativus]

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XP_022953398.1 uncharacterized protein LOC111455963 [Cucurbita moschata]

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XP_038885654.1 uncharacterized protein LOC120075963 isoform X1 [Benincasa hispida]

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87.68

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        MA AMIASQ LL NHSFPVIKPYTLTS +SPFRF RPQQPLLSP IST TPFS SPNRR CSL+RPAARRKPT +DS   S++GDS+VRRLL++LLW  E
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KC53 Uncharacterized protein

2.76e-248

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A0A1S3BD72 uncharacterized protein LOC103488603

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A0A5D3CZV8 Putative transmembrane protein

1.49e-236

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A0A6J1GN87 uncharacterized protein LOC111455963

2.59e-197

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A0A6J1I448 uncharacterized protein LOC111470451

3.01e-196

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        M  A+IA+QPLL N+SF +IKPY  +     F+F RPQQP+LS    T T     P RRN S   PAARRKPT VDS  F+++G+S+VRR+LQ+LLW AE
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         VY+LWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSL+GLSLNFF +LPA+NSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFVIAWTLMFAPLLFTDR+RD+Y+GSLDLLWG QMF
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Query:  LTNTFLIPYMAIRLNEASEDSAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAMCIISIIWSFVGRADGNFGGVAERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPW
        LTNTFLIPYMAIRLNEAS DSAP+PQSKLG+LMT  APVVG+IGGA CIISIIWSFVGRA+GNFGG+AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLY+VFQPW
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Query:  LIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEEL
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G25805.1 unknown protein

3.0e-112

69.6

Show/hide

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        ARRKP     T      D ++RR+++ LLW +EAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLP  N+ GI  + APVLHPM+EGLFNFV
Subjt:  ARRKPTFVDSTDFSNDGDSNVRRLLQVLLWGAEAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLPAMNSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFV

Query:  IAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGLQMFLTNTFLIPYMAIRLNEASEDSAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAMCIISIIWSFVGRADGNFGGV
        IAWTLMFAPLL+TDRKR++Y  SLD+LW L MFLTNTFLIPYMA+RLN+A  D  P  +S+LG +MT GAP+VG+ G  +C+IS +WS  GRADG+FGG+
Subjt:  IAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGLQMFLTNTFLIPYMAIRLNEASEDSAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAMCIISIIWSFVGRADGNFGGV

Query:  AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEE
         +RW++LI YL SERLAYAFIWDICLY++FQPWLIGENLQNVK++KI +V  LRFVPV GL+AY LFL L++E
Subjt:  AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GGTTTGAATCAAGCAGACCAACTGGGTCCTATTAATCCAAACTTCATTCCATTTTCCAAAACAATATACATAATATACATAGAGAGAAGGCCTCCTCCCTACATAAACAA
AGCCTCGGGATTCCAAATCCAAATTTGCAGCCATAACTTTGCCACGCACAGTTATTTGGAGAGAAAAATGGCGAAGGCCATGATAGCATCTCAACCTTTACTCTCCAACC
ACTCCTTTCCGGTGATTAAACCCTACACTCTAACTTCCCCCCTCTCTCCTTTCCGTTTCTTCAGACCACAACAACCACTGCTCTCTCCTCTAATCTCCACCACCACTCCC
TTCTCACTCTCACCCAATCGCCGGAATTGTTCTCTTACCCGCCCTGCCGCTCGCAGGAAACCCACATTCGTTGATTCTACAGACTTTTCCAACGACGGTGATTCCAATGT
CCGACGGTTGCTTCAAGTTCTGCTCTGGGGTGCTGAGGCTGTTTACATTTTGTGGCTATTTCTCCTTCCTTATGCTCCGGGAGATCCTGTGTGGGCAATCAGTTCAGAAA
CTGTGAATTCTCTTCTGGGTCTTTCTCTGAATTTCTTCTTTGTATTGCCTGCTATGAACTCTGTGGGCATTCGTTTGATTGATGCTCCTGTTCTTCACCCAATGTCTGAG
GGATTGTTCAATTTTGTTATCGCATGGACGCTCATGTTTGCTCCCCTGCTGTTCACGGATCGAAAGAGGGACCAATACAGTGGTTCATTAGACTTATTGTGGGGCTTGCA
GATGTTCCTTACGAACACCTTTTTGATACCTTATATGGCTATCCGGCTTAATGAGGCTAGTGAAGACTCTGCCCCGCAACCGCAGTCGAAGCTGGGCACTTTGATGACCA
ATGGAGCTCCTGTCGTTGGCGTGATCGGTGGTGCAATGTGCATCATATCGATAATATGGTCGTTCGTTGGTCGAGCGGATGGTAACTTTGGAGGTGTAGCAGAGAGATGG
GAGTTCTTGATCCAATATCTATCTTCAGAGAGGTTAGCTTATGCTTTTATTTGGGATATTTGCCTTTACAGTGTATTCCAGCCTTGGTTGATTGGAGAAAACCTTCAAAA
TGTTAAGGAGAGCAAGATTGGAGTTGTAAGTTCCCTTAGATTTGTCCCTGTGGTTGGCTTAATTGCCTATCTTCTTTTTCTCAAACTTGATGAGGAATTATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

GLNQADQLGPINPNFIPFSKTIYIIYIERRPPPYINKASGFQIQICSHNFATHSYLERKMAKAMIASQPLLSNHSFPVIKPYTLTSPLSPFRFFRPQQPLLSPLISTTTP
FSLSPNRRNCSLTRPAARRKPTFVDSTDFSNDGDSNVRRLLQVLLWGAEAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLPAMNSVGIRLIDAPVLHPMSE
GLFNFVIAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGLQMFLTNTFLIPYMAIRLNEASEDSAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAMCIISIIWSFVGRADGNFGGVAERW
EFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEEL

Cucsat.G5930 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome