; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G6171 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G6171
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationctg1425:702327..708378
RNA-Seq ExpressionCucsat.G6171
SyntenyCucsat.G6171
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023550435.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.56e-21689.94Show/hide
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XP_038885313.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]1.41e-22289.55Show/hide
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XP_038885315.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]6.32e-22590.57Show/hide
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A0A0A0KE83 Uncharacterized protein8.03e-251100Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X14.51e-23996.03Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic3.29e-21387.75Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic8.80e-21689.94Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic2.52e-21589.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P69935 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase YdfG4.3e-2032.74Show/hide
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        ED   ++ TN  GL+   R  +  M+ + R GHI NI G+ +   P      YGATK  V   + +L+ +L    V+   V ++ PG+V     + +   
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        G D K  K + N  A  PE + E
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic1.6e-5444.06Show/hide
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        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL  GD VVI SRS E V  ++  L E   E                +V GT CDV + EDVK LV F +  L  +DIWI
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        NNAG+N   F+PLV  SDED+ ++V+TN +G ++C REA+ +M +Q +GGH+FN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     SL  E R      V VH
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          SPGMV TDLL+SG+  +  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      I +LT  +    + + +    RR R+F E+
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic1.3e-13081.65Show/hide
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        S+KPLVE SDE L+EV+TTN LGLMICCREAI MM NQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+M +V NV+VHNLSPGMVT
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Query:  TDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED
        TDLLMSGA TKQAKFFIN+LAEP  VVA+YLVPNIR+IPTN S +PTYIRFLTGLKAYS+IFSR+AFGARRN+Y  ED
Subjt:  TDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED

Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic4.0e-13574.39Show/hide
Query:  FISPPSQSRLSLHKFRSFSLSIPPSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPEEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ
        F+SP  + RL   +F   ++ +           N  V  +S + +     ++EPM PPYN+LITGSTKGIGYALAR+FLK GDNVVICSRSAERVE++VQ
Subjt:  FISPPSQSRLSLHKFRSFSLSIPPSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPEEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ

Query:  SLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA
        SL+EEFGE  VWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QKNLKY+DIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGA
Subjt:  SLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA

Query:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIR
        GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIR
Subjt:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIR

Query:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED
        FLTG+KAY++IFSR+A GAR+NRY  E+
Subjt:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic8.9e-5040.64Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL  GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  + +V G  CDV + EDV+ L  F  K L  ++IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYF
          SPGMV T+LL+SG+  K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      + +LT  +    + + +    RR R+F
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein9.5e-1530.2Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L        +     DV+    V+ +   + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +ML + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.4e-1328.51Show/hide
Query:  TNSVVNSNSVSTK--PEEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVA
        + SVV + + +T+  P E  QK   V    V+ITG+++GIG A+A    K G  V++  +RSA+  E   + + E  G+   +G   DV +  DV  ++ 
Subjt:  TNSVVNSNSVSTK--PEEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVA

Query:  FLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTK
                +D+ +NNAG    +   L+        EV+  N  G+ +C + A+K+M+ + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K
Subjt:  FLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTK

Query:  SLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL
        +   E      +N+ V+ + PG + +D+
Subjt:  SLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.3e-5140.64Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL  GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  + +V G  CDV + EDV+ L  F  K L  ++IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYF
          SPGMV T+LL+SG+  K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      + +LT  +    + + +    RR R+F
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYF

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.9e-4839.93Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALAR+FL  GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  + +V G  CDV + EDV+ L  F  K L  ++IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYF
          SPGMV T+LL+SG+  K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      + +LT  +    + + +    RR R+F
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYF

AT5G04900.1 NYC1-like2.9e-13674.39Show/hide
Query:  FISPPSQSRLSLHKFRSFSLSIPPSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPEEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ
        F+SP  + RL   +F   ++ +           N  V  +S + +     ++EPM PPYN+LITGSTKGIGYALAR+FLK GDNVVICSRSAERVE++VQ
Subjt:  FISPPSQSRLSLHKFRSFSLSIPPSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPEEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ

Query:  SLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA
        SL+EEFGE  VWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QKNLKY+DIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGA
Subjt:  SLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA

Query:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIR
        GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIR
Subjt:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIR

Query:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED
        FLTG+KAY++IFSR+A GAR+NRY  E+
Subjt:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTTGCTATACAAAATGTAAATAGTTTTACATTTTGTTATATATATATATATAAATTACCTAAATTAATCTATCTGGAAAATTTCTACCGCGCGAAAATGGCTTCTTCAAC
TTCTTCTTCTTCCTCCCTCCTCTTCACGTCTCCGTTCATCGCCCACAACCATGGCTTCTTCATCTCTCCTCCTTCTCAAAGTCGCTTATCACTCCACAAATTCAGGAGTT
TCAGTCTTTCCATACCTCCTTCGAGAAAGATTTCCAACATTCCGACGAACAGCGTCGTGAATTCCAATTCCGTATCCACAAAGCCCGAAGAATTTCAGCAGAAGGAGCCT
ATGGTTCCTCCTTACAACGTTTTGATCACTGGTTCCACTAAAGGAATAGGATATGCATTGGCCAGACAGTTTCTGAAAGAAGGTGACAATGTTGTTATCTGCTCAAGATC
AGCTGAGAGGGTTGAATCTTCTGTTCAAAGCTTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCGTGTGTGGGGTACTAAATGTGATGTGCGAGAAGGGGAGGATGTAAAGAATTTAG
TCGCATTTTTGCAGAAAAATCTTAAATATGTTGACATTTGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTTGAGGCTTCAGATGAAGATCTCATT
GAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGCGGGGGTCATATTTTCAACATTGATGGGGCTGG
TTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACGAAGTCGTTACAGGCAGAACTGCGGATGCAGGACGTGAAAA
ATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACCGATCTTCTTATGTCTGGTGCGGATACGAAGCAGGCAAAATTTTTCATCAATGTTTTGGCGGAACCACCT
GAAGTGGTGGCAGAATATCTCGTCCCAAACATAAGATCTATCCCAACCAATGGATCAACAAGGCCCACATACATTCGTTTCCTCACTGGACTAAAAGCTTATTCCCAGAT
TTTCTCAAGACTTGCTTTTGGTGCAAGAAGAAACAGATATTTTCTAGAAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTGCTATACAAAATGTAAATAGTTTTACATTTTGTTATATATATATATATAAATTACCTAAATTAATCTATCTGGAAAATTTCTACCGCGCGAAAATGGCTTCTTCAAC
TTCTTCTTCTTCCTCCCTCCTCTTCACGTCTCCGTTCATCGCCCACAACCATGGCTTCTTCATCTCTCCTCCTTCTCAAAGTCGCTTATCACTCCACAAATTCAGGAGTT
TCAGTCTTTCCATACCTCCTTCGAGAAAGATTTCCAACATTCCGACGAACAGCGTCGTGAATTCCAATTCCGTATCCACAAAGCCCGAAGAATTTCAGCAGAAGGAGCCT
ATGGTTCCTCCTTACAACGTTTTGATCACTGGTTCCACTAAAGGAATAGGATATGCATTGGCCAGACAGTTTCTGAAAGAAGGTGACAATGTTGTTATCTGCTCAAGATC
AGCTGAGAGGGTTGAATCTTCTGTTCAAAGCTTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCGTGTGTGGGGTACTAAATGTGATGTGCGAGAAGGGGAGGATGTAAAGAATTTAG
TCGCATTTTTGCAGAAAAATCTTAAATATGTTGACATTTGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTTGAGGCTTCAGATGAAGATCTCATT
GAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGCGGGGGTCATATTTTCAACATTGATGGGGCTGG
TTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACGAAGTCGTTACAGGCAGAACTGCGGATGCAGGACGTGAAAA
ATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACCGATCTTCTTATGTCTGGTGCGGATACGAAGCAGGCAAAATTTTTCATCAATGTTTTGGCGGAACCACCT
GAAGTGGTGGCAGAATATCTCGTCCCAAACATAAGATCTATCCCAACCAATGGATCAACAAGGCCCACATACATTCGTTTCCTCACTGGACTAAAAGCTTATTCCCAGAT
TTTCTCAAGACTTGCTTTTGGTGCAAGAAGAAACAGATATTTTCTAGAAGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
FAIQNVNSFTFCYIYIYKLPKLIYLENFYRAKMASSTSSSSSLLFTSPFIAHNHGFFISPPSQSRLSLHKFRSFSLSIPPSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPEEFQQKEP
MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQRVWGTKCDVREGEDVKNLVAFLQKNLKYVDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLI
EVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGADTKQAKFFINVLAEPP
EVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYFLED