; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G6202 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G6202
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionlight-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic
Genome locationctg1425:1153549..1156646
RNA-Seq ExpressionCucsat.G6202
SyntenyCucsat.G6202
Gene Ontology termsGO:0006850 - mitochondrial pyruvate transmembrane transport (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0031305 - integral component of mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0050833 - pyruvate transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140959.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucumis sativus]5.08e-111100Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSD
        MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSD
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSD

Query:  NVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        NVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  NVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_008441491.1 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 [Cucumis melo]1.78e-9789.53Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSL----RFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQS
        MSGACS PF +IKIPSTSSSPAAT++AAS SAS SSSASSSSSL    RF SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPS TPPLKP+PP QS
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSL----RFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQS

Query:  PPS-----DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPS     DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  PPS-----DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_022939849.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita moschata]4.83e-9083.16Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS
        MSGACS PF  IKIP+TSSSPA  S +AS+++S SSS S+ SS+RFSS+KPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPS TPPLKPTPPP Q+PPS
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS

Query:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
               DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_023551626.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.69e-9083.68Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS
        MSGACS PF  IKIP+TSSSPA  S +AS+++S SSS S+ SS+RFSSSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPS TPPLKPTPPP Q+PPS
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS

Query:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
               DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_038884716.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Benincasa hispida]6.10e-9184.97Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSS---SLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSP
        MSGACS PF  IKIP  SSSPAA   A S SAS SSSASSSS   SLRFSSSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSP S TPPLKPTPPPQSP
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSS---SLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSP

Query:  PS--------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PS        DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  PS--------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBA0 Uncharacterized protein2.46e-111100Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSD
        MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSD
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSD

Query:  NVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        NVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  NVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A1S3B3J8 proline-rich receptor-like protein kinase PERK148.63e-9889.53Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSL----RFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQS
        MSGACS PF +IKIPSTSSSPAAT++AAS SAS SSSASSSSSL    RF SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPS TPPLKP+PP QS
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSL----RFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQS

Query:  PPS-----DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPS     DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  PPS-----DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A6J1FIC8 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic2.34e-9083.16Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS
        MSGACS PF  IKIP+TSSSPA  S +AS+++S SSS S+ SS+RFSS+KPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPS TPPLKPTPPP Q+PPS
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS

Query:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
               DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A6J1JS47 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic8.10e-8278.35Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPP----PQS
        MSGACSFPF  IKIP+ SSS AA S +AS+ +STSSS S+ SS+RFSSSKPF+FTIRSSQT+GP+RRP+APSLR+PSPPSPP   PPLKPTP     P S
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPP----PQS

Query:  PPS--------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
         PS        DN ITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DL+
Subjt:  PPS--------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A6J1K1U3 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic6.38e-8882.11Show/hide
Query:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS
        MSGACS PF  IKIP+ SSSPA  S +AS+++S SSS S+ SS+RFSSSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPS TPPLKPTPP  Q+PPS
Subjt:  MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPP-QSPPS

Query:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
               DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDE DQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  -------DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FEC1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic2.0e-4470.44Show/hide
Query:  ASTSSSASSSSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSLTPPLKPTPPPQ---SPPSDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKK
        +S+SSS+++SSS RFS ++KP +F IR SQTEGPLRRPSA P+LR+P    PPS PS +PP  P+PPPQ   +    +V T+EFQR KAKELQEYFKQKK
Subjt:  ASTSSSASSSSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSLTPPLKPTPPPQ---SPPSDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKK

Query:  LDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        L+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  LDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G34000.1 one-helix protein 21.4e-4570.44Show/hide
Query:  ASTSSSASSSSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSLTPPLKPTPPPQ---SPPSDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKK
        +S+SSS+++SSS RFS ++KP +F IR SQTEGPLRRPSA P+LR+P    PPS PS +PP  P+PPPQ   +    +V T+EFQR KAKELQEYFKQKK
Subjt:  ASTSSSASSSSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSLTPPLKPTPPPQ---SPPSDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKK

Query:  LDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        L+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  LDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGGGCTTGTTCATTCCCCTTCCCCAGTATCAAAATCCCCTCCACTTCCTCCTCACCGGCCGCCACCTCCGCTGCCGCTTCTTCCTCCGCCTCCACCTCCTCTTC
AGCTTCTTCTTCATCCTCCCTCCGATTCTCCTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGACCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCTCCGCTCCTTCTCTCA
GAGACCCCTCCCCGCCCTCTCCCCCTTCCCTGACGCCTCCTCTCAAGCCTACTCCTCCCCCCCAATCCCCTCCGTCGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGCGGCTC
AAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTGATCAGGGACCGTTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGC
TATGTTTGGCTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCGAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTGGGGCTTGTTCATTCCCCTTCCCCAGTATCAAAATCCCCTCCACTTCCTCCTCACCGGCCGCCACCTCCGCTGCCGCTTCTTCCTCCGCCTCCACCTCCTCTTC
AGCTTCTTCTTCATCCTCCCTCCGATTCTCCTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGACCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCTCCGCTCCTTCTCTCA
GAGACCCCTCCCCGCCCTCTCCCCCTTCCCTGACGCCTCCTCTCAAGCCTACTCCTCCCCCCCAATCCCCTCCGTCGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGCGGCTC
AAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTGATCAGGGACCGTTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGC
TATGTTTGGCTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCGAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGACSFPFPSIKIPSTSSSPAATSAAASSSASTSSSASSSSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSLTPPLKPTPPPQSPPSDNVITLEFQRL
KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE