; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G6382 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G6382
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionExtensin
Genome locationctg1429:567514..570629
RNA-Seq ExpressionCucsat.G6382
SyntenyCucsat.G6382
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


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A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein2.31e-274100Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like1.61e-21779.01Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.2e-0433.33Show/hide
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        P        PP SLP P PP      PP  + P PP PP P   P PP PP PPV + P P  P PP  P   PP PP  P PP    SP  PS PPPPP
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        P     P    P   P   PPPPP   S PPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  +  + PP   S PP   P  P +  P I P+  PP
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Query:  PPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        PP   +  P     + PP PP
Subjt:  PPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.3e-3548.94Show/hide
Query:  ITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVP
        ITI+G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E + FS NRTT+++G+Y++ I S+D   CAD  ++ S CQASLIG    S   CN+P
Subjt:  ITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVP

Query:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK
        G RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein8.4e-0633.33Show/hide
Query:  EIPSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCI------FSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIP---DPFTSSKFFL
        E+ SV+ +N A  M              + +C +P L   +   +  + +  +C+         N L  RP +++   C +   + P     F+  +   
Subjt:  EIPSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCI------FSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIP---DPFTSSKFFL

Query:  PF------FPPYSLPFPFPP-----LPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP----SPSQPSAPPPPP
        P        PP SLP P PP      PP  + P PP PP P   P PP PP PPV + P P  P PP  P   PP PP  P PP    SP  PS PPPPP
Subjt:  PF------FPPYSLPFPFPP-----LPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP----SPSQPSAPPPPP

Query:  PFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPRIPPFFPPP
        P     P    P   P   PPPPP   S PPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  +  + PP   S PP   P  P +  P I P+  PP
Subjt:  PFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPRIPPFFPPP

Query:  PPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        PP   +  P     + PP PP
Subjt:  PPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein4.0e-4843.23Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFT-SLFGR------TAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LL L S  T    GR         +L   +RIT+VG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFT-SLFGR------TAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGSSSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKIPDPFTSSKFFLP
        P VDGI+C DG+ + S C A ++ +SS+    C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       K EK+   F  SKFF P
Subjt:  PSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGSSSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKIPDPFTSSKFFLP

Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSP
        +  PY  P+P+                    P LPPLP LPP P FPF      PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSP

Query:  FSP
        F P
Subjt:  FSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein5.4e-3747.02Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN
        I LLLLL L S   SL  + + A  +  +IT++G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN

Query:  CADGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
        CA      ++ + CQASLIG S + CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  CADGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGTTTGGCCGAACAGCTGAAGCTCTAACGTCAGTCACTCGAAT
CACAATAGTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAA
TTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGCTGAT
GGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGCAGCTCATCTGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAACGAAAGCTTATGTGGGAGTAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTTACCT
CCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTACCTCCACTTCCTCCATTGCCTCCA
CTGCCTCCACTGCCCCCACTGCCTCCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTTTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTT
ATTTCCTTCACCTCCAAGTCCATCTCAACCATCTGCACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTC
CACCGCCTCCGCCATCATCACCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGA
GACCCGAGAACCTGGATTCCTAATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCGTATTCCTCCATTTTTCCC
TCCCCCACCTCCATCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATTTCCTTCACCTCCAAGTCCATCTCAACCATCTGCACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTC
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GACCCGAGAACCTGGATTCCTAATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCGTATTCCTCCATTTTTCCC
TCCCCCACCTCCATCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPR
DPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP