; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G6504 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G6504
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionCollagen alpha chain
Genome locationctg1450:409404..410738
RNA-Seq ExpressionCucsat.G6504
SyntenyCucsat.G6504
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB4124396.1 Collagen triple helix repeat, partial [uncultured Caudovirales phage]4.94e-2441.36Show/hide
Query:  GILGT-GILGRGGKSVDGIEGTIG--GIVVGGT--ILGMNGIEDNEGTLGIMG----GRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMG-GRLG
        G LGT G +G  G    G +GTIG  G +  GT   +G  G+   +GT+G  G    G  GTIG +G  GT G +G + G+ G++   G  G +G G  G
Subjt:  GILGT-GILGRGGKSVDGIEGTIG--GIVVGGT--ILGMNGIEDNEGTLGIMG----GRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMG-GRLG

Query:  TIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGN
        TIG +G  G+ G+ G     G  GT+GS+G  GT G +G     G  GTIG++G  GT G++G     G  GT+G +G  GT G +G  G  GT GS G+
Subjt:  TIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGN

Query:  EGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGT
        +GT+G   G  GTIG +G  GT     G  GTIGS+G  GT     G  GTIGS+G  G+ G+ G   G IGS+G  G      G IG++G  GT
Subjt:  EGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGT

NXF00478.1 CRA1B protein [Menura novaehollandiae]3.33e-2941.86Show/hide
Query:  GIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMG--------GRL
        G  GT+G     G  LG  G     GT G  GG LG++G  G  GT G  G  LG  GS    G LG  GG LGT+G  G  G+PG +G        G L
Subjt:  GIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMG--------GRL

Query:  GTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGT------PGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNE------GTLGIMGGRL
        GT GS G  G+PG  G  G LGT+GS G+ GT      PG +G     G LGT+G  G  G+PG +G     G LGT+GS G +      GTLG  G + 
Subjt:  GTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGT------PGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNE------GTLGIMGGRL

Query:  GTIGGEGNEGTPGIMG-GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----------GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERS--GMIGNEGNEGT
        G +G  G+ GT G    G LGT+GS G  GT+G +G           G  GT+GS G+ GTPG +G  G LGA+GS G  G  G     G +G+ G  G+
Subjt:  GTIGGEGNEGTPGIMG-GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----------GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERS--GMIGNEGNEGT

Query:  P
        P
Subjt:  P

QTV80239.1 hypothetical protein KAE78_04210 [Microbacterium sp. NIBRBAC000506063]6.01e-2539.57Show/hide
Query:  GIEGTIGGIVVGGTI--LGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGMVGSECNEGILGIMG--GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--
        G EG++G +   G++  LG  G   + G+LG +G  LG++G  G+EG+ G +G     G LG VGS  + G +G +G  G LG++G  G+ G+ G +G  
Subjt:  GIEGTIGGIVVGGTI--LGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGMVGSECNEGILGIMG--GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--

Query:  ---GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTP
           G LG++GS G+ G+ G +G  G +G++GS G+EG+ G +G  G  G++G  G+ G+ G +G  G LG++GS G+ G++G +G  LG++G  G+ G+ 
Subjt:  ---GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTP

Query:  GIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERS--GMIGNEGNEGT
        G +G  G LG++GS G+ G+LG +G  G LG++GS G+EG+ G +G  +G++GSEG  G +G     G +G+ G+EG+
Subjt:  GIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERS--GMIGNEGNEGT

WP_149249425.1 trigger factor [Labrys sp. KNU-23]1.45e-2742.54Show/hide
Query:  GKSVDGIEGTIGGI--------VVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNE-GTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEG-TP
        G +V G+ G IGGI        VVGG    + GIE + G  G++GG  G IGG G E G  GI+GG  G VG +   G+ G++GG  G IGG G +G   
Subjt:  GKSVDGIEGTIGGI--------VVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNE-GTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEG-TP

Query:  GIMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGGKGNE-GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEG-TPG
        G++GG  G IG  G +G   GV+GG  G IG  G +G   GV+GG  G IGG G E G  GI+GG  G +G +G  G  G++GG  G IGG G +G   G
Subjt:  GIMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGGKGNE-GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEG-TPG

Query:  IMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEG-IFGIMGERSGMIGNEG
        ++GG  G IG +G       +GG +G +G E  +G  GI+GG  G +G +G + G++G  +G IG  G
Subjt:  IMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEG-IFGIMGERSGMIGNEG

XP_031739036.1 collagen alpha-1(IV) chain [Cucumis sativus]6.76e-18088.2Show/hide
Query:  MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNE
        MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNE
Subjt:  MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNE

Query:  GT--------------------------------------PGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGI
        GT                                      PGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGI
Subjt:  GT--------------------------------------PGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGI

Query:  MGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMI
        MGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMI
Subjt:  MGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMI

Query:  GNEGNEGTPEITDGMEGNNCGR
        GNEGNEGTPEITDGMEGNNCGR
Subjt:  GNEGNEGTPEITDGMEGNNCGR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LY65 Uncharacterized protein2.37e-17389.11Show/hide
Query:  MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNE
        MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIG EGNEGTPG+MGGRLG +GSE NEG  G+MGGRLGTIGGKGNE
Subjt:  MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNE

Query:  GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGI
        GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIG +GNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIG +GNEGTLGIMGGRLGTIGG+GNEGTPGI
Subjt:  GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGI

Query:  MGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLG-------------------AIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEITDGMEGNN
        MGGRLGTIGSEGNEGT GIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLG                   AIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEITDGMEGNN
Subjt:  MGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLG-------------------AIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEITDGMEGNN

Query:  CGR
        CGR
Subjt:  CGR

A0A5C1WAB6 Trigger factor7.03e-2842.54Show/hide
Query:  GKSVDGIEGTIGGI--------VVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNE-GTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEG-TP
        G +V G+ G IGGI        VVGG    + GIE + G  G++GG  G IGG G E G  GI+GG  G VG +   G+ G++GG  G IGG G +G   
Subjt:  GKSVDGIEGTIGGI--------VVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNE-GTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEG-TP

Query:  GIMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGGKGNE-GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEG-TPG
        G++GG  G IG  G +G   GV+GG  G IG  G +G   GV+GG  G IGG G E G  GI+GG  G +G +G  G  G++GG  G IGG G +G   G
Subjt:  GIMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGSEGNEG-TPGVMGGRLGTIGGKGNE-GTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEG-TPG

Query:  IMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEG-IFGIMGERSGMIGNEG
        ++GG  G IG +G       +GG +G +G E  +G  GI+GG  G +G +G + G++G  +G IG  G
Subjt:  IMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEG-IFGIMGERSGMIGNEG

A0A671U558 Uncharacterized protein1.79e-2440.6Show/hide
Query:  GIEGTIGGIVVGGTI-----LGMNGIEDNEGTLGIMG-----GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--------GRLGMVGSECNEGILGIMG-----GRLGTIG
        G  GT+G +   GT+     LG  G     GT+G +G     G +GT+G  G  GT G +G        G LG VG+    G LG +G     G LGT+G
Subjt:  GIEGTIGGIVVGGTI-----LGMNGIEDNEGTLGIMG-----GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--------GRLGMVGSECNEGILGIMG-----GRLGTIG

Query:  GKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-
          G  G  G +G  G LGT+G+ G  GT G +G  G LGT+G+ G  GT G +G     G LGT+G  G  G  G +G  G +GT+G+ G  GT+G +G 
Subjt:  GKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-

Query:  -GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTP
         G +GT+G  G  GT G +G  G +GT+G+ G  GTLG +G     G LGT+G+ G  GTPG +G  G +GA+G+ G  G +G   G  G  G  GTP
Subjt:  -GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTP

A0A6J5KP70 Collagen triple helix repeat (Fragment)3.34e-2640.85Show/hide
Query:  GILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGI----MGGRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG--GRLGTIGGKGN
        G  G G +   G +GT G    G T  G  G    +G+ G       G  GT+G +G  GT G++G  G +G  G    +G +G  G  G  GTIG +G 
Subjt:  GILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGI----MGGRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG--GRLGTIGGKGN

Query:  EGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----G
         GT G +G     G  GTIGS+G  GT G +G     G  GTIGS+G  GT G +G   GTIG +G  GT G +G   GTIGS+G  GT G +G     G
Subjt:  EGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----G

Query:  RLGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--------GRLGAIGSEGIFGIMGE--RSGMIGN
          GTIG +G  GT G +G     G  GTIGS+G  GT G +G     G  GTIGS+G  GT G +G        G  G IG++G+ GI G     G  G 
Subjt:  RLGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--------GRLGAIGSEGIFGIMGE--RSGMIGN

Query:  EGNEGT
        +GN+GT
Subjt:  EGNEGT

A0A6J5KT28 Collagen triple helix repeat2.39e-2441.36Show/hide
Query:  GILGT-GILGRGGKSVDGIEGTIG--GIVVGGT--ILGMNGIEDNEGTLGIMG----GRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMG-GRLG
        G LGT G +G  G    G +GTIG  G +  GT   +G  G+   +GT+G  G    G  GTIG +G  GT G +G + G+ G++   G  G +G G  G
Subjt:  GILGT-GILGRGGKSVDGIEGTIG--GIVVGGT--ILGMNGIEDNEGTLGIMG----GRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMG-GRLG

Query:  TIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGN
        TIG +G  G+ G+ G     G  GT+GS+G  GT G +G     G  GTIG++G  GT G++G     G  GT+G +G  GT G +G  G  GT GS G+
Subjt:  TIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGN

Query:  EGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGT
        +GT+G   G  GTIG +G  GT     G  GTIGS+G  GT     G  GTIGS+G  G+ G+ G   G IGS+G  G      G IG++G  GT
Subjt:  EGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
C0HJN4 Collagen alpha-2(I) chain (Fragments)1.3e-1335.31Show/hide
Query:  GRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTI-----LGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTP
        G G     G +G++G +   G I      G  G    +G +G +G  G  G  G  G  G PG+     G +G   N G  GI G + G  G  G  G P
Subjt:  GRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTI-----LGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTP

Query:  GIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--------------GRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGR
        GI G  G  G +G+ G  G  G++G  G  G+ G  GN+G PG  G              G  G  G  G  G PGI  G +G  GS G+ G  G+    
Subjt:  GIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--------------GRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGR

Query:  LGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--------GRLGAIGSEGIFGIMGERS--GMIGNEGNE
         G  G  G  G PGIMG     G  G +G  G EG +GI G  GR G +G  G  G PG +G        G  G IG +G  GI G R   G  GN G +
Subjt:  LGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--------GRLGAIGSEGIFGIMGERS--GMIGNEGNE

Query:  GTP
        G P
Subjt:  GTP

C7DZK3 Collagen alpha-1(XXVII) chain A1.9e-1236.51Show/hide
Query:  TGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG--GRLGTIGGKGNE
        TG+ G  GKS  G  G  G         G+ G + N G LG  G  G++G IG  G +G+ G +G  G  G +G + + GI G  G  G  G IG  G +
Subjt:  TGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG--GRLGTIGGKGNE

Query:  GTPGIMG------------GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIM
        G  G  G            G  G +G  G+ G PG  G  G+ G  G  G  G PG+ G  G  GT G KG++G  G  G  G+ G  GS G+ G +G+ 
Subjt:  GTPGIMG------------GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGGKGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIM

Query:  GGRLGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGIMG-----GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGN
        G R GT+G EG EG PG  G     G  GT G +G++G  G+ G     G++G IG  G +G+ G  G     G  G  G  G  G MG   G  G+ G+
Subjt:  GGRLGTIGGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTPGIMG-----GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGN

Query:  EGTP
        +G P
Subjt:  EGTP

P20849 Collagen alpha-1(IX) chain9.3e-1235.84Show/hide
Query:  TGILG-RGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG-----GRLGTIGG
        TGI+G +G K   G++G  G         G+ G   ++G  G  G  G  G  G EG  G PG+ G  G  G+ G +  +GI G+ G     G+ G  G 
Subjt:  TGILG-RGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG-----GRLGTIGG

Query:  KGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTI
         G +G PG+ G  G  G  G +G+ G PG   G++G  G  G +G P       G +G +G +G PG   G LG +GS G  G LG +G     G  G  
Subjt:  KGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----GRLGTI

Query:  GGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEI
        G  G +G  G++G     G  G  G EG  G  G +G  G  G  GS GN G PG+ G  G  G  G EG  G  G R G+ G +G  G P +
Subjt:  GGEGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEI

Q05722 Collagen alpha-1(IX) chain5.4e-1238.54Show/hide
Query:  TGILG-RGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG-----GRLGTIGG
        TGI+G +G K   G +G  G         G+ G   ++G  G  G  G  G  G +G+ G PG  G  G  G+ G +  +GI G+ G     G+ G  G 
Subjt:  TGILG-RGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMG-----GRLGTIGG

Query:  KGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTI
         G +G PG+ G  G  G  G +GN G PG   G+LG+ G  G +G PG +G     G  G+ G  G EG+PGI  G+LG++GS G  G  G   G  G  
Subjt:  KGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMG-----GRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTI

Query:  GGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEI
        G  G  G PG  G + G  G EG  G  G +G  G+ G  GS GN G PG+ G  G  G  G EG  G  G R GM G +G  G P I
Subjt:  GGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMG--GRLGTIGSEGNEGTPGIMG--GRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEI

Q96P44 Collagen alpha-1(XXI) chain9.9e-1435.29Show/hide
Query:  GRGGK-SVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTPGI
        G+ GK    GI GT G       + G  GI+   G  G  G  GR G  G  G  G PG+ G  G  G +G++ ++G  G   G+ G  G KGN G PG+
Subjt:  GRGGK-SVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMG--GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTPGI

Query:  MG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--------------GRLGTIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIM
         G  G  G  G +G  G+PG  G  G  G  G +G  G PG+ G              G  G  G KG  G PG+MG     G+ GT GS+G++G  GI 
Subjt:  MG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--GRLGTIGSEGNEGTPGVMG--------------GRLGTIGGKGNEGTPGIMG-----GRLGTIGSEGNEGTLGIM

Query:  G-----GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----------------GRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGER
        G     G  G  G  G+ G PG MG  G  G  G +GN+G  GI G                 G  G  G  G +G PG+ G  +G+ G  G+ G+MG  
Subjt:  G-----GRLGTIGGEGNEGTPGIMG--GRLGTIGSEGNEGTLGIMG-----------------GRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGER

Query:  --SGMIGNEGNEGTPEITDGMEG
           G  G+ G +G P + DG  G
Subjt:  --SGMIGNEGNEGTPEITDGMEG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G01985.1 unknown protein3.5e-0635.05Show/hide
Query:  GILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIV-----VGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGK
        G +G G  GRGGKS  G  G +GG V      GG++    GI    G     GGR G+ G  G  GT G  GGR G  G+    G+ G  GG  G   G 
Subjt:  GILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIV-----VGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGK

Query:  GNEGTPGI-----MGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGE
        G  G+ G+      GG +G  G  G     GV GG  G++G        G +GG  G   G G  G+ G  GG  G   S G  G++G  GG  G +GG 
Subjt:  GNEGTPGI-----MGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGE

Query:  GNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEITDGMEGNNCG
           G  G +GG +G  G+ G  G +G  GG  G++G  G  G+ G  GG  G        G  G  SG +G  G  G      G  G   G
Subjt:  GNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEITDGMEGNNCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCGGGATATTAGGGACTGGAATATTAGGAAGGGGAGGCAAATCGGTGGATGGAATAGAAGGAACGATCGGCGGGATAGTAGTAGGTGGAACAATATTAGGGATGAA
TGGAATCGAAGACAATGAAGGAACTCTCGGGATAATGGGTGGAAGGTTAGGGACGATTGGAGGTGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGA
TGGTTGGAAGCGAATGCAATGAAGGAATTCTCGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGACGATTGGAGGCAAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTA
GGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGGTAATGGGTGGAAGATTAGGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGGTAATGGGTGGAAG
ATTAGGGACGATTGGAGGCAAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCTCGGGATAATGGGTG
GAAGATTAGGGACGATTGGAGGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCTCGGGATAATG
GGTGGAAGATTAGGGACGATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCCGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGGCGATTGGAAGTGAAGGAATTTTTGGGATAATGGGTGA
AAGGTCGGGGATGATTGGAAATGAAGGCAATGAAGGAACTCCCGAGATAACAGATGGAATGGAAGGAAATAATTGTGGGAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCGGGATATTAGGGACTGGAATATTAGGAAGGGGAGGCAAATCGGTGGATGGAATAGAAGGAACGATCGGCGGGATAGTAGTAGGTGGAACAATATTAGGGATGAA
TGGAATCGAAGACAATGAAGGAACTCTCGGGATAATGGGTGGAAGGTTAGGGACGATTGGAGGTGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGA
TGGTTGGAAGCGAATGCAATGAAGGAATTCTCGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGACGATTGGAGGCAAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTA
GGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGGTAATGGGTGGAAGATTAGGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGGTAATGGGTGGAAG
ATTAGGGACGATTGGAGGCAAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCTCGGGATAATGGGTG
GAAGATTAGGGACGATTGGAGGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCTGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGACTATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCTCGGGATAATG
GGTGGAAGATTAGGGACGATTGGAAGCGAAGGCAATGAAGGAACTCCCGGGATAATGGGTGGAAGATTAGGGGCGATTGGAAGTGAAGGAATTTTTGGGATAATGGGTGA
AAGGTCGGGGATGATTGGAAATGAAGGCAATGAAGGAACTCCCGAGATAACAGATGGAATGGAAGGAAATAATTGTGGGAGATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFGILGTGILGRGGKSVDGIEGTIGGIVVGGTILGMNGIEDNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGMVGSECNEGILGIMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRL
GTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGSEGNEGTPGVMGGRLGTIGGKGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIMGGRLGTIGGEGNEGTPGIMGGRLGTIGSEGNEGTLGIM
GGRLGTIGSEGNEGTPGIMGGRLGAIGSEGIFGIMGERSGMIGNEGNEGTPEITDGMEGNNCGR