; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G6861 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G6861
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionBHLH domain-containing protein
Genome locationctg1522:974616..979992
RNA-Seq ExpressionCucsat.G6861
SyntenyCucsat.G6861
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.63e-20885.83Show/hide
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XP_016899947.1 PREDICTED: transcription factor bHLH74 isoform X2 [Cucumis melo]1.18e-15682.65Show/hide
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XP_038885625.1 transcription factor bHLH74-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.32e-15970.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein1.12e-22792.64Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X12.90e-20785.56Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X25.69e-15782.65Show/hide
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        R+SANFNTK DSK+AKGGSQNVQ+PKENYI VQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA
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        +VGLESSLE EQILLTN                          NSYLSSSNVLCKRGENVND RSR  HTSPHV FQLYGT PTMP+TTSPSTF
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X11.76e-20885.83Show/hide
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        MAGSTSGFQCE MKCSFGVSSSQPLIGVDTSFSSTLGSSSTTPLCELSTASLENEGVKTISN+LHDPSTLSFDMFG+GNFSDMVGS GFLTEADHSQIAN
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                        NSYLSSSNVLCKRGENVND RSR  HTSPHV FQLYGT PTMP+TTSPSTF
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A0A6P6GAR5 transcription factor bHLH74 isoform X33.88e-5349.42Show/hide
Query:  LENEGVKTISNILHDPSTLSF-------DMFGTGNFSDMVGSFGFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDE-EMVSP----KNDAKSRPD-----CVSENQ
        LEN+G+ + S+++  PS  SF         FG+G+FS+MVGSFG    A+ S IAN  CP  Y    +   E  SP     +D +   D       S  +
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Query:  RKFVLGSNSS-SPNKNAED----NFNVEPTEIL-DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKIS
        RK  L S+S  SPNKNAE     + + E ++++ D  +K  K E   S N   K   K++K  S + +APKENYIHV+ARRG+A N+HSLAERVRREKIS
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Query:  ERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        ERM+LLQ+LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA+V  E +++ E+IL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q69WS3 Transcription factor BHLH0947.2e-2545.91Show/hide
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        P++DA    D +S+  +      G      + +A +   ++P +  DK D       R  A  ++   SK A   +   + PK++YIHV+ARRG+A ++H
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        SLAER RREKISERMK+LQ LVPGC+++ GK  VLDEIINY+QSLQ QVE LSMKL +V
Subjt:  SLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASV

Q6NKN9 Transcription factor bHLH744.7e-3257.45Show/hide
Query:  NKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG
        NK A + F  +P    D++ K  K         N +      K  SQ+ +APKENYIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITG
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Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        K V+LDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA+V  E +++ ++IL
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Q9C670 Transcription factor bHLH761.5e-2556.8Show/hide
Query:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ
        ++ DK QK E   ++N N K +S+K     Q   + K+ YIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC ++TGK V+LDEIINYVQSLQ
Subjt:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ

Query:  QQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
         Q+E LSMKL++V        E +L
Subjt:  QQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

Q9CAA9 Transcription factor bHLH495.4e-2845.76Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
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Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

Q9SRT2 Transcription factor bHLH624.2e-2550Show/hide
Query:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L +  KT+  ++  SA  ++K        D K+ K   +N        P ++YIHV+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNV
        +LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKL+SV        + +L  ++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.3e-3357.45Show/hide
Query:  NKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG
        NK A + F  +P    D++ K  K         N +      K  SQ+ +APKENYIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITG
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Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        K V+LDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA+V  E +++ ++IL
Subjt:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G26260.1 cryptochrome-interacting basic-helix-loop-helix 51.0e-2656.8Show/hide
Query:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ
        ++ DK QK E   ++N N K +S+K     Q   + K+ YIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC ++TGK V+LDEIINYVQSLQ
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Query:  QQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
         Q+E LSMKL++V        E +L
Subjt:  QQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.8e-2945.76Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
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Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.8e-2945.76Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
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Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.3e-2940.24Show/hide
Query:  FDMFGTGNFSDMV----------GSF----GFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDAKSR---PDCVSEN--------QRKFVLGSNS---
        F +F  GNFSDMV          G F    G +     S   N+  P + V +   E  V     AK        VSE+        Q+     SN+   
Subjt:  FDMFGTGNFSDMV----------GSF----GFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDAKSR---PDCVSEN--------QRKFVLGSNS---

Query:  --SSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC
          +  N  A  +   + +E     +  +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC
Subjt:  --SSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC

Query:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACATTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAACTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCATAGCCAGATCGCCAATATTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAGTGAAAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATAACTTTAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTGATAAAGCTGACAAAACACAGAAGGTTGAGCATCGATTGAGTGCAAATTTTAACACCAAACCAG
ATAGTAAAAAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCATGTTCAAGCGCGAAGGGGGCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
AGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATTAACTA
TGTACAATCACTGCAACAACAGGTGGAGTTGCTATCAATGAAACTCGCAAGTGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGGCAGAGCAGATTCTACTCACAAATGTAAGTTCTA
AGGTCATATCTTGTATGCTTCAGAACTTGATCTCTTTTAGTAATTTTGATCTGTATAAAATGATTCAGAATTCATACCTTTCGTCATCGAATGTTCTTTGTAAGAGAGGC
GAAAACGTCAACGATCCTAGATCAAGGATAATTCACACAAGTCCTCATGTCACGTTTCAACTTTATGGAACAACGCCAACCATGCCAAGAACTACATCTCCTTCAACTTT
CTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAACAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNVSSKVISCMLQNLISFSNFDLYKMIQNSYLSSSNVLCKRG
ENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSPSTF