| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004139072.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis sativus] | 5.56e-191 | 100 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_008450302.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis melo] | 3.44e-172 | 92.81 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS GR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_008450303.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Cucumis melo] | 1.54e-174 | 94.1 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDRPDSR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_038879567.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Benincasa hispida] | 1.22e-165 | 91.1 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS GR HDRRRSPPR SPRYSRSPAQR RYSRSP PRHAR+RSRSYDYAS PPKQ+AYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
PDSRERSFPRQ+SRGR SRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSPR SPRHEE YRSEPNGDRSPSQ
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_038879568.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Benincasa hispida] | 5.48e-168 | 92.36 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR HDRRRSPPR SPRYSRSPAQR RYSRSP PRHAR+RSRSYDYAS PPKQ+AYSRS+SPRDRPDSR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
ERSFPRQ+SRGR SRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSPR SPRHEE YRSEPNGDRSPSQ
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LZX6 RRM domain-containing protein | 1.97e-189 | 100 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A1S3BNX5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 1.66e-172 | 92.81 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS GR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A1S3BPL2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 7.46e-175 | 94.1 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDRPDSR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1DH06 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 3.87e-154 | 85.03 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRD--LPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRD LPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRD--LPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
Query: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPR
GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS GR+HDRRRSPPR SPRYSRSPA R RYSRSPAPRHARSRSRSYDY S PPKQRA SRS+SPR
Subjt: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS----GRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPR
Query: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSP + GSRS SP RGRS SRS SRS RSPRRSPRHEEEYRS+PNGDRSPSQ
Subjt: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1DIJ4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 1.74e-156 | 86.21 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRD--LPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRD LPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRD--LPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
Query: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPD
GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSPPR SPRYSRSPA R RYSRSPAPRHARSRSRSYDY S PPKQRA SRS+SPRDR D
Subjt: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPR---SPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPD
Query: SRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
SRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSP + GSRS SP RGRS SRS SRS RSPRRSPRHEEEYRS+PNGDRSPSQ
Subjt: SRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 1.3e-26 | 41.67 | Show/hide |
Query: TSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDR
TSL VRN++ D R EDLRR FG++G I D+Y+P D+YT PRGF +VQ+ D DA DA H++D + GR++ + FA+ +RK P+ M+A+E
Subjt: TSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDR
Query: RRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYA-------SQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRS-PRLD---GSRSRS
R+ S RY RR R SRS R +RSRS Y+Y S+P + SRS S DR R RSF R +S RS S+S P+ + SRSRS
Subjt: RRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYA-------SQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRS-PRLD---GSRSRS
Query: QSPT--------------QPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRS
S T + GSR R + RS+S+S+S RSRS+SRS
Subjt: QSPT--------------QPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRS
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.8e-30 | 42.69 | Show/hide |
Query: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
R RSY+P SPPR GY P R P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y DAA+A
Subjt: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
Query: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
M+ V+ GRE+ +VFAEENRK P +MR SGR+ D +R+ RSPR R SRSP R +R S+ R D S + R+ SRS PR+
Subjt: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
Query: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKS
+ + R+ RSPR + R +P+R R LSRSRSRS S
Subjt: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 1.6e-27 | 38.87 | Show/hide |
Query: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
R Y+P SPP RGYG RGRSP P G GR SLLVRN+ DCRPE+LR PF +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD DA
Subjt: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
Query: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSP
+A+ M+ GRE+TVV A E+RK+P +MR + R R + S RS SRS + R R R P+ +R RSRSY
Subjt: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSP
Query: RDRPDSRERSFPRQESRGRSYSR---SPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGR--SRSRSRSPRRSPR
P R R P + +YSR SP +G+ + + + G G R ++V R S SRSRS SPR
Subjt: RDRPDSRERSFPRQESRGRSYSR---SPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGR--SRSRSRSPRRSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 2.7e-75 | 62.85 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+ G R DLPTSLLVRNL HDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
Query: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG S R+ DRRRSP PRYSRSP RRGR S RSRSR Y + PP +R SRS+SP+DR +
Subjt: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
E RSYSRSP +GSR RS SP + S S SP RS+S ++RS + ++RS+S PR+S R NGDRSPSQ
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 5.0e-82 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GR+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS SP RS+SRS RS+S R+RS SPRRS R Y EP RS S
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 3.6e-83 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GR+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS SP RS+SRS RS+S R+RS SPRRS R Y EP RS S
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 4.8e-80 | 69.87 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GR+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVR
R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS SP +
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVR
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 4.1e-79 | 61.69 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDPA
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG +PRGFGFVQ++DPA
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDPA
Query: DAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRS
DAADAKHHMDG +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG G R+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS
Subjt: DAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRS
Query: LSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSE
+SPR+ R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS SP RS+SRS RS+S R+RS SPRRS R Y E
Subjt: LSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSE
Query: PNGDRSPS
P RS S
Subjt: PNGDRSPS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.9e-76 | 62.85 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+ G R DLPTSLLVRNL HDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
Query: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG S R+ DRRRSP PRYSRSP RRGR S RSRSR Y + PP +R SRS+SP+DR +
Subjt: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
E RSYSRSP +GSR RS SP + S S SP RS+S ++RS + ++RS+S PR+S R NGDRSPSQ
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVGRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 4.1e-31 | 42.69 | Show/hide |
Query: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
R RSY+P SPPR GY P R P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y DAA+A
Subjt: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
Query: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
M+ V+ GRE+ +VFAEENRK P +MR SGR+ D +R+ RSPR R SRSP R +R S+ R D S + R+ SRS PR+
Subjt: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
Query: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKS
+ + R+ RSPR + R +P+R R LSRSRSRS S
Subjt: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPSPVRGRSLSRSRSRSKS
|
|
