; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G7472 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G7472
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1
Genome locationctg1528:3023829..3029127
RNA-Seq ExpressionCucsat.G7472
SyntenyCucsat.G7472
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022000.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.33e-20289.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X21.91e-20489.58Show/hide
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A0A1S4DZ49 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X15.08e-23398.81Show/hide
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A0A5A7UN79 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X25.08e-23398.81Show/hide
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A0A5D3CEN1 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X25.08e-23398.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha3.1e-1429.04Show/hide
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         P++   + Q + + +L   FL                     R  + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +        
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha1.2e-1329.18Show/hide
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        G+ GGGG G GG  +GG   GGGA GG  ++  EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I        
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        S  P++   + Q + + +L   FL                     R  + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +      
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A2.0e-1328.03Show/hide
Query:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGI-----PWFLDLFNYY--INSDDPEVFSK
        G   GG +GG GG            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E  +    + +    G+      +  D   +Y  +    PE  ++
Subjt:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGI-----PWFLDLFNYY--INSDDPEVFSK

Query:  ELQLD-------TKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINE
            D        + +L   FL                     R  + +Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S      A + +
Subjt:  ELQLD-------TKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINE

Query:  ASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGA----GFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGAD
        + +   LP Q   E  + LA L DD G     G   G +   G                   G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + 
Subjt:  ASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGA----GFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGAD

Query:  RSSIILPLSGLKQF
        R+SI +PL    +F
Subjt:  RSSIILPLSGLKQF

Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B1.5e-1328.06Show/hide
Query:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYI------NSDDPEVFSK
        G   GG +GG  G            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE  ++
Subjt:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYI------NSDDPEVFSK

Query:  ELQLD-------TKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINE
            D        + +L   FL                     R  + +Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S        + +
Subjt:  ELQLD-------TKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINE

Query:  ASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSI
        + +   LP Q   E  + LA L DD G     G    SG +                 G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI
Subjt:  ASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSI

Query:  ILPLSGLKQF
         +PL    +F
Subjt:  ILPLSGLKQF

Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 17.6e-12270.62Show/hide
Query:  MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVF
        ME NSGG     GG   GG A  GG GGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E+F
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Query:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF
        SKELQLD+K                                 VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF
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Query:  ILPNQ-ENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPL
        ++PNQ + S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPL
Subjt:  ILPNQ-ENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPL

Query:  SGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        SGLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
Subjt:  SGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32080.1 purin-rich alpha 15.4e-12370.62Show/hide
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        ME NSGG     GG   GG A  GG GGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E+F
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Query:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF
        SKELQLD+K                                 VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF
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Query:  ILPNQ-ENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPL
        ++PNQ + S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPL
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Query:  SGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        SGLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
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AT2G32080.2 purin-rich alpha 12.2e-12470.83Show/hide
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        ME NSGG     GG   GG A  GG GGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E+F
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Query:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF
        SKELQLD+K                                 VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF
Subjt:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF

Query:  ILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLS
        ++PNQ+ S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPLS
Subjt:  ILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLS

Query:  GLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        GLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
Subjt:  GLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGAAATTCCGGCGGGGGTGGAGTGGGAATTGGGGGAACGACGGCGGGTGGCGTGGCGGCGGGAGGAGGGGCTGGTGGTGGCGGAGGGAATGACGTGGAGTTGAT
GTGCAAAACACTGCAGGTGGAACACAAGCTGTTTTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGTCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGTCAACGA
TCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTGGACACAAAGGCA
TCTTTGTTTCTCTTCTTTCTCTTTTGCCTTTTAGTTTATCTCTTTGTTCTTGTTGGTCAACTTTTGCCTTTTTTGTGTACTCATCGTGCCTTTCAGGTGTTTTACTTTGA
CATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATTGTTCCTGCCGGAAGCAACCGGGATGAGGGATGGT
CTGCATTTAGAAACATCTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAACGTCTCGCCGGACTTTCGGATGAT
GTAGGAGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAATCTGGGCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGATGAAATGGGGAATCTGGG
TGTTTCAAAGGTTATCCGAGCTGATCAAAAGAGATTCTTTTTCGATCTTGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATTTCTGAGGTTGCAGGGGCAGATCGTTCTT
CAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAGGTGTGAATGTCCGAACT
GTGGATCCACCTCAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGGAAATTCCGGCGGGGGTGGAGTGGGAATTGGGGGAACGACGGCGGGTGGCGTGGCGGCGGGAGGAGGGGCTGGTGGTGGCGGAGGGAATGACGTGGAGTTGAT
GTGCAAAACACTGCAGGTGGAACACAAGCTGTTTTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGTCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGTCAACGA
TCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTGGACACAAAGGCA
TCTTTGTTTCTCTTCTTTCTCTTTTGCCTTTTAGTTTATCTCTTTGTTCTTGTTGGTCAACTTTTGCCTTTTTTGTGTACTCATCGTGCCTTTCAGGTGTTTTACTTTGA
CATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATTGTTCCTGCCGGAAGCAACCGGGATGAGGGATGGT
CTGCATTTAGAAACATCTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAACGTCTCGCCGGACTTTCGGATGAT
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CAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAGGTGTGAATGTCCGAACT
GTGGATCCACCTCAGAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVFSKELQLDTKA
SLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHRAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDD
VGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRT
VDPPQR