; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G7493 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G7493
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionGrowth-regulating factor
Genome locationctg1528:3410203..3412309
RNA-Seq ExpressionCucsat.G7493
SyntenyCucsat.G7493
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0099402 - plant organ development (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR014977 - WRC domain
IPR014978 - Glutamine-Leucine-Glutamine, QLQ
IPR031137 - Growth-regulating factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055786.1 growth-regulating factor 4 [Cucumis melo var. makuwa]1.09e-22796.96Show/hide
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XP_022147551.1 growth-regulating factor 6 isoform X2 [Momordica charantia]6.17e-20587.43Show/hide
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XP_038878902.1 growth-regulating factor 1 [Benincasa hispida]3.49e-20890.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZJ1 Growth-regulating factor1.94e-240100Show/hide
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A0A1S3BQB1 Growth-regulating factor2.82e-23197.01Show/hide
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A0A5D3CDH7 Growth-regulating factor5.27e-22896.96Show/hide
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A0A6J1D0G4 Growth-regulating factor2.09e-20387.16Show/hide
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A0A6J1D2Q2 Growth-regulating factor2.99e-20587.43Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6AWY4 Growth-regulating factor 52.7e-4237.24Show/hide
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        YCERHMHRG+NRSRKPV+      A      LSN T ++ ++++      P P+  + +     +G+S+    +        +    P Y S+Y+ G K 
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Query:  EVNEKVFFSQEPSEAIG-----RADFSASSIASSLQLTPLT--MSSSLYPKQNNSSSLQSDQSSFYQLHQNLTEPLKQQKRDES---------------Q
        +V E  FFS       G       D S  S+ SS+   P++    S L P   + S L+  Q    +L Q     L Q++   S                
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        + +  FFDEWP + R SW +  ++ SN +S STT+LSISIP
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Q6AWY6 Growth-regulating factor 35.3e-4339.47Show/hide
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Query:  HRGKNRSRKPVDVLKTTATNDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDTNTLLLLEPGSYSDKNPDYRSRYTCGLKEEVNEKVF
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Query:  FS--------QEPSEAI-GRADFSASSIASSLQLTPLTMSSSLYPKQNNSSSLQSDQSSFYQLHQNLTEPLKQQKRD--------ESQKTVHRFFDEWPP
        +S         E S  I G  D S  +    L     T S S YP   N S L  DQ++   L +   EPL     D        +  +T+  FFDEW P
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Query:  KDRGSWLDFADKSSNTSSVSTTRLSISIPTASNDFPIFRSKN
        K R SW D AD +S  ++ S T+LSISIP A++DF    S++
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Q6AWY8 Growth-regulating factor 17.7e-4237.08Show/hide
Query:  FPFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRS-ALDSPF-TSKLFPHHPQP-VGWNYLQMSLGRKI-DPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKY
        +PFT++QWQELEHQALI+KYM SG PIP +L+  ++RS  LDS   TS      PQP +GW    M  GRK  DPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKY
Subjt:  FPFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRS-ALDSPF-TSKLFPHHPQP-VGWNYLQMSLGRKI-DPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKY

Query:  CERHMHRGKNRSRKPVDVLKTT-------ATNDINHLS---NPTFSSLNSNSSLLSYRPFP--------------AHQISSTPNNG------NGISMKDT
        CE+HMHRGKNRSRKPV++   T       AT+  ++ S    PT ++ +S +   S RP P              A   + TP         +   ++  
Subjt:  CERHMHRGKNRSRKPVDVLKTT-------ATNDINHLS---NPTFSSLNSNSSLLSYRPFP--------------AHQISSTPNNG------NGISMKDT

Query:  NTLLLLEPGSYSDKNPDYRSRYTCGLKEEVNEKVFFS-------QEPSEAIGRADFSASSIASSLQLTPL--------TMSS----SLYPKQNNSSSLQS
         T     P  YS  + +Y   Y    KE   E  FFS          +   G+  F    +      TPL        T +S     L  + ++    + 
Subjt:  NTLLLLEPGSYSDKNPDYRSRYTCGLKEEVNEKVFFS-------QEPSEAIGRADFSASSIASSLQLTPL--------TMSS----SLYPKQNNSSSLQS

Query:  DQSSFYQLH-------QNLTEPLKQQKRDESQKTVHRFFDEWP--PKDRGSWLDFADKSSNTSSVSTTRLSISIPTASNDFPI
         Q    Q H         L +P        +QK +  FFDEWP     +GSW+    +         T+LS+SIP A+ND PI
Subjt:  DQSSFYQLH-------QNLTEPLKQQKRDESQKTVHRFFDEWP--PKDRGSWLDFADKSSNTSSVSTTRLSISIPTASNDFPI

Q6ZIK5 Growth-regulating factor 48.8e-4638.29Show/hide
Query:  SARSMFPFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSK
        +A  + PFT+AQ++ELE QALI+KY+V+G+P+PP+L+  I+R  LDS   +  F +HP  +G+       G+K+DPEPGRCRRTDGKKWRCSKEA PDSK
Subjt:  SARSMFPFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSK

Query:  YCERHMHRGKNRSRKPVD---VLKTTATNDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDT------------NTLLLLEPGSYSDK
        YCERHMHRG+NRSRKPV+   V ++   + +   +    ++ ++ SS  ++  +PA  I+ +   G G +M  +            N       G  + K
Subjt:  YCERHMHRGKNRSRKPVD---VLKTTATNDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDT------------NTLLLLEPGSYSDK

Query:  NPDYRSRYTCGLKEE----VNEKVFFSQEPSEAIGRADFSASSIASSLQLTPLTMSSSLYPKQNNSSSLQSDQSSFYQLHQNLTEPLKQQKRDESQKTVH
        +  Y +  T  L +E    + E +  S E    +  +  S   ++S  QL  L+      P  ++ S +Q    SF+       + +KQ+      +T+ 
Subjt:  NPDYRSRYTCGLKEE----VNEKVFFSQEPSEAIGRADFSASSIASSLQLTPLTMSSSLYPKQNNSSSLQSDQSSFYQLHQNLTEPLKQQKRDESQKTVH

Query:  RFFDEWPPKDRGSWLDFADKSSNTSSVSTTRLSISIPTASNDFPIFRSKN
         FFDEW PK R SW D AD+++N SS S T+LSISIP AS+DF    S++
Subjt:  RFFDEWPPKDRGSWLDFADKSSNTSSVSTTRLSISIPTASNDFPIFRSKN

Q8L8A6 Growth-regulating factor 51.0e-4655.11Show/hide
Query:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHM
        PFT  QW+ELEHQALI+KYMVSG+P+PPEL+FSI+RS LD+   S+L PH  Q +GW   QM  GRK DPEPGRCRRTDGKKWRCS+EAYPDSKYCE+HM
Subjt:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHM

Query:  HRGKNRSRKPVDVLKTTAT---------NDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDTNT
        HRG+NR+RK +D  +TT T          + N+ S    SS +SNSS  +Y    +   + + +N  G+    +NT
Subjt:  HRGKNRSRKPVDVLKTTAT---------NDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDTNT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G06200.1 growth-regulating factor 61.7e-3963.93Show/hide
Query:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKR----------SALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAY
        PFT +QW+ELE+QAL+FKY+ + +P+PP LLF IKR          S+  S F+  L PH     GWN  +M +GRKID EPGRCRRTDGKKWRCSKEAY
Subjt:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKR----------SALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAY

Query:  PDSKYCERHMHRGKNR--SRKP
        PDSKYCERHMHRGKNR  SRKP
Subjt:  PDSKYCERHMHRGKNR--SRKP

AT2G22840.1 growth-regulating factor 11.1e-3052.59Show/hide
Query:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPH---HPQPVGWNYLQMSL-GRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYC
        PF+  QW ELE QALI+KY+ + +P+P  LL S+K+S          FP+    P   GW    +   G  +DPEPGRCRRTDGKKWRCS++A PD KYC
Subjt:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPH---HPQPVGWNYLQMSL-GRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYC

Query:  ERHMHRGKNRSRKPVD
        ERH++RG++RSRKPV+
Subjt:  ERHMHRGKNRSRKPVD

AT2G36400.1 growth-regulating factor 35.3e-3047.95Show/hide
Query:  FTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHP-QPVGWNYLQMSLGR-KIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERH
        F+ AQWQELE QALI++YM++G  +P ELL  IK+S L    +   F HHP Q +        LGR  +DPEPGRCRRTDGKKWRCS++ +   KYCERH
Subjt:  FTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHP-QPVGWNYLQMSLGR-KIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERH

Query:  MHRGKNRSRKPVD---VLKTTATNDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSY
        MHRG+NRSRKPV+    +  TAT+  + ++    ++  + +S  ++
Subjt:  MHRGKNRSRKPVD---VLKTTATNDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSY

AT3G13960.1 growth-regulating factor 57.4e-4855.11Show/hide
Query:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHM
        PFT  QW+ELEHQALI+KYMVSG+P+PPEL+FSI+RS LD+   S+L PH  Q +GW   QM  GRK DPEPGRCRRTDGKKWRCS+EAYPDSKYCE+HM
Subjt:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHM

Query:  HRGKNRSRKPVDVLKTTAT---------NDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDTNT
        HRG+NR+RK +D  +TT T          + N+ S    SS +SNSS  +Y    +   + + +N  G+    +NT
Subjt:  HRGKNRSRKPVDVLKTTAT---------NDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDTNT

AT4G37740.1 growth-regulating factor 29.7e-3256.14Show/hide
Query:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSL-GRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERH
        PFT  QW ELE QALI+KY+ + +P+P  LL SIK+S    P+ S      P   GW    +   G  +DPEPGRCRRTDGKKWRCS++A PD KYCERH
Subjt:  PFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSL-GRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERH

Query:  MHRGKNRSRKPVDV
        ++RG++RSRKPV+V
Subjt:  MHRGKNRSRKPVDV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGCCAGAAGTATGTTTCCCTTCACATCAGCTCAGTGGCAAGAGCTTGAACATCAAGCTCTCATCTTCAAATACATGGTTTCTGGCATTCCTATACCTCCTGAACT
TCTCTTCAGTATTAAAAGAAGTGCTTTGGATTCTCCTTTCACTTCTAAGCTCTTCCCACACCATCCTCAACCTGTTGGATGGAACTATTTGCAGATGAGTTTGGGGAGGA
AGATAGACCCAGAGCCAGGGAGGTGTAGGAGAACTGATGGGAAAAAATGGAGATGTTCAAAAGAGGCATATCCAGATTCAAAATACTGTGAGAGACACATGCATAGAGGA
AAAAATCGTTCAAGAAAGCCTGTGGATGTTTTGAAAACAACAGCAACAAACGACATAAACCACCTCTCAAATCCAACATTTTCTTCCTTAAACAGCAACTCATCCTTACT
CTCCTATCGCCCCTTCCCGGCTCATCAAATATCTTCAACTCCTAATAATGGGAATGGTATATCAATGAAAGACACCAATACCCTCTTGCTTCTTGAACCTGGTTCTTATT
CCGACAAAAACCCAGATTACAGAAGTAGGTACACTTGTGGGCTAAAAGAGGAAGTGAATGAGAAAGTTTTCTTCTCACAAGAACCTTCTGAAGCTATTGGGAGAGCTGAT
TTCTCTGCTTCATCCATAGCTAGTTCATTGCAACTGACACCACTAACGATGAGTTCTTCTCTATACCCAAAACAGAACAACAGCTCCTCTTTGCAGAGTGATCAATCCTC
ATTTTATCAGCTTCATCAGAACCTCACAGAACCTTTGAAGCAACAAAAGAGAGACGAATCGCAGAAGACTGTTCATCGATTCTTCGATGAATGGCCTCCAAAAGACAGAG
GATCATGGCTTGATTTCGCTGATAAATCATCAAATACTAGCTCAGTTTCCACCACTCGGCTCTCAATTTCCATTCCCACAGCTTCCAACGACTTCCCCATTTTCAGATCC
AAAAACCCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCGCCAGAAGTATGTTTCCCTTCACATCAGCTCAGTGGCAAGAGCTTGAACATCAAGCTCTCATCTTCAAATACATGGTTTCTGGCATTCCTATACCTCCTGAACT
TCTCTTCAGTATTAAAAGAAGTGCTTTGGATTCTCCTTTCACTTCTAAGCTCTTCCCACACCATCCTCAACCTGTTGGATGGAACTATTTGCAGATGAGTTTGGGGAGGA
AGATAGACCCAGAGCCAGGGAGGTGTAGGAGAACTGATGGGAAAAAATGGAGATGTTCAAAAGAGGCATATCCAGATTCAAAATACTGTGAGAGACACATGCATAGAGGA
AAAAATCGTTCAAGAAAGCCTGTGGATGTTTTGAAAACAACAGCAACAAACGACATAAACCACCTCTCAAATCCAACATTTTCTTCCTTAAACAGCAACTCATCCTTACT
CTCCTATCGCCCCTTCCCGGCTCATCAAATATCTTCAACTCCTAATAATGGGAATGGTATATCAATGAAAGACACCAATACCCTCTTGCTTCTTGAACCTGGTTCTTATT
CCGACAAAAACCCAGATTACAGAAGTAGGTACACTTGTGGGCTAAAAGAGGAAGTGAATGAGAAAGTTTTCTTCTCACAAGAACCTTCTGAAGCTATTGGGAGAGCTGAT
TTCTCTGCTTCATCCATAGCTAGTTCATTGCAACTGACACCACTAACGATGAGTTCTTCTCTATACCCAAAACAGAACAACAGCTCCTCTTTGCAGAGTGATCAATCCTC
ATTTTATCAGCTTCATCAGAACCTCACAGAACCTTTGAAGCAACAAAAGAGAGACGAATCGCAGAAGACTGTTCATCGATTCTTCGATGAATGGCCTCCAAAAGACAGAG
GATCATGGCTTGATTTCGCTGATAAATCATCAAATACTAGCTCAGTTTCCACCACTCGGCTCTCAATTTCCATTCCCACAGCTTCCAACGACTTCCCCATTTTCAGATCC
AAAAACCCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSARSMFPFTSAQWQELEHQALIFKYMVSGIPIPPELLFSIKRSALDSPFTSKLFPHHPQPVGWNYLQMSLGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHMHRG
KNRSRKPVDVLKTTATNDINHLSNPTFSSLNSNSSLLSYRPFPAHQISSTPNNGNGISMKDTNTLLLLEPGSYSDKNPDYRSRYTCGLKEEVNEKVFFSQEPSEAIGRAD
FSASSIASSLQLTPLTMSSSLYPKQNNSSSLQSDQSSFYQLHQNLTEPLKQQKRDESQKTVHRFFDEWPPKDRGSWLDFADKSSNTSSVSTTRLSISIPTASNDFPIFRS
KNP