CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G7764
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic
Genome location	ctg1556:418144..424517
RNA-Seq Expression	Cucsat.G7764
Synteny	Cucsat.G7764
Gene Ontology terms	GO:0045727 - positive regulation of translation (biological process) GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component) GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function) GO:0005525 - GTP binding (molecular function) GO:0043022 - ribosome binding (molecular function)
InterPro domains	IPR006297 - Elongation factor 4 IPR009000 - Translation protein, beta-barrel domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_011653860.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]

7.90e-63

100

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

XP_031740276.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]

4.97e-63

100

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

XP_031740277.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus]

1.89e-63

100

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

XP_031740278.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X4 [Cucumis sativus]

1.45e-63

100

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

XP_031740279.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X5 [Cucumis sativus]

5.90e-64

100

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BMN9 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

7.79e-62

97.14

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGI+EILNAIVERVPPPRNTA+RPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

A0A6J1DVN5 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

1.23e-58

93.33

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        +VGLDCSNAIQCSAKEGIGI EILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DGRIK+GDRIYFMAS+KDYFADEVGVLSPNQLEV E
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

A0A6J1EAZ6 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

3.42e-58

94.29

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGI EILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DGRIK+GDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

A0A6J1HRW4 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

3.42e-58

94.29

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        IVGLDCSNAIQCSAKEGIGI EILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DGRIK+GDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

A0A7J7DZN0 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

2.32e-57

88.57

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        ++GLDCSNAI CSAKEGIGI EILNAIVERVPPPRNTAD PLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DG+IK+GDRIYFMAS+KDY ADE+GVLSPNQ+EVEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A5B4D2 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

1.9e-47

83.81

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        +VGLDCS+AI CSAKEGIGI EILNAIV+R+PPP +TA+RPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DG IK+GDRIYFMAS KDYFADE+GVLSPNQL+ +E
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

B8AI54 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

9.9e-44

78.1

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        I+G+DCSNAI+CSAKEGIGI EIL+AIV ++PPP+NTA  PLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DG IK+GD+I FMAS K+Y ADE+GVLSPNQ++V E
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

B9GHA6 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

6.0e-49

85.71

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        ++GLDCSNAI CSAKEGIGI EILNAIVERVPPPR+TA  PLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DG IK+GDRIYFMAS+KDY+ADE+GVLSPNQ++VEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

B9RHQ5 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

6.0e-49

85.71

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        ++GLDCSNAI+CSAKEGIGII+ILNAIVER+P PRNTA+ PLR LIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDG IK+GDRIYFMAS KDYFADE+GVLSPNQ++VEE
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

Q9FNM5 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

5.2e-45

79.05

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        ++GLDCS AI CSAKEGIGI EIL+AIV+R+P P +TA +PLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DG++K+GDRI+FMAS KDYFADEVGVLSPNQ++V+E
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G08650.1 Small GTP-binding protein

3.7e-46

79.05

Show/hide

Query:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE
        ++GLDCS AI CSAKEGIGI EIL+AIV+R+P P +TA +PLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV+DG++K+GDRI+FMAS KDYFADEVGVLSPNQ++V+E
Subjt:  IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEE

Query:  LYAGE
        LYAGE
Subjt:  LYAGE

AT5G39900.1 Small GTP-binding protein

7.8e-20

39.22

Show/hide

Query:  LDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYA
        LD  + +  SAK G+G+  +L A++ER+PPP   ++ PLR L+FDS+++ Y+GVI Y  V+DG + +GD++ F AS + Y   +VG++ P       L  
Subjt:  LDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYA

Query:  GE
        G+
Subjt:  GE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATTGTGGGTCTTGATTGTAGCAATGCAATACAATGCTCAGCAAAGGAGGGGATAGGTATAATTGAAATTTTAAATGCGATTGTTGAAAGAGTTCCTCCACCACGTAATAC
TGCTGATAGACCACTTCGAGCATTAATATTTGATAGTTATTATGATCCATATAGGGGTGTTATAGTTTATTTTCGAGTGCTTGATGGGAGAATAAAGAGAGGCGATAGAA
TATATTTCATGGCAAGTGACAAGGATTATTTTGCTGATGAAGTTGGAGTTTTATCTCCCAATCAGTTAGAAGTGGAGGAACTTTATGCTGGAGAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGE

Cucsat.G7764 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome