; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G7783 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G7783
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description10 kDa chaperonin, mitochondrial
Genome locationctg1556:1027242..1030391
RNA-Seq ExpressionCucsat.G7783
SyntenyCucsat.G7783
Gene Ontology termsGO:0051085 - chaperone cofactor-dependent protein refolding (biological process)
GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
GO:0051087 - chaperone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011032 - GroES-like superfamily
IPR018369 - Chaperonin GroES, conserved site
IPR020818 - GroES chaperonin family
IPR037124 - GroES chaperonin superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025877.1 10 kDa chaperonin-like [Cucumis melo var. makuwa]6.64e-4897.56Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQ
        MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS+KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGD+VLLPEYGGNEVKLGEKQ
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQ

KAF3778533.1 chaperonin [Nymphaea thermarum]6.86e-4587.95Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY
        MAKRL+PLLNRVL+EKIVPP+KTN+GILLPEK+TKLNSGKVIAVGPG RDREGKIIP+SVKEGD VLLPEYGG EVKLGEK+Y
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY

XP_004144325.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial [Cucumis sativus]1.29e-4997.7Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

XP_008455733.1 PREDICTED: 10 kDa chaperonin-like [Cucumis melo]2.14e-4895.4Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS+KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGD+VLLPEYGGNEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

XP_038881343.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Benincasa hispida]9.74e-4587.36Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        MAKRL+PLLNRVLIEKIVPP KTNSGILLPEKS+KLNSGKVI++GPGARDREGKIIP++VKEGD VLLPEYGG EVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYT6 Uncharacterized protein6.27e-5097.7Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

A0A1S3C2U3 10 kDa chaperonin-like1.04e-4895.4Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS+KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGD+VLLPEYGGNEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

A0A4S8K5K3 Uncharacterized protein1.11e-4384.34Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY
        MAKRL+PL NRVL+EKIVPP+KT++GILLPEK+TKLNSGKVIAVGPGARDR+GK+IP+SVKEGD VLLPEYGG EVKLGEK+Y
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY

A0A5A7SMD3 10 kDa chaperonin-like3.21e-4897.56Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQ
        MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS+KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGD+VLLPEYGGNEVKLGEKQ
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQ

A0A7J7DFM0 10 kDa chaperonin-like1.06e-4385.71Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYV
        MAKRLLP LNRVLIEKIVPPTKTN+GILLPEKS+KLNSGKV+AVGPG RDREGK+IP+SVKEGD VLLP+YGG EVKLGEK+ V
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59804 10 kDa heat shock protein, mitochondrial8.1e-1854.22Show/hide
Query:  AKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKST-KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY
        AK ++PLL+R+L+++I   TKT SGI LPEKS  KL+ G+VI+VG G  ++EGK+   SV  GD VLLP YGG+ +K+GE++Y
Subjt:  AKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKST-KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY

P34893 10 kDa chaperonin, mitochondrial4.2e-3071.08Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY
        M KRL+P  NR+L+++++ P KT SGILLPEKS+KLNSGKVIAVGPG+RD++GK+IP+SVKEGD VLLPEYGG +VKLGE +Y
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY

P38910 10 kDa heat shock protein, mitochondrial2.2e-1548.28Show/hide
Query:  AKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKST-KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        AK ++PL++RVL+++I    KT SG+ LPEK+  KLN  +V+AVGPG  D  G  +   VK GD VL+P++GG+ +KLG    V LF
Subjt:  AKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKST-KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

Q96539 10 kDa chaperonin7.1e-3071.08Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY
        M KRL+P  NR+L++ ++ P KT SGILLPEK++KLNSGKVIAVGPG+RD++GK+IP+SVKEGD VLLPEYGG +VKLGEK+Y
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY

Q9W6X3 10 kDa heat shock protein, mitochondrial2.2e-1548.84Show/hide
Query:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKST-KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF
        ++ LPL +RVL+E+++  T T  GI+LPEKS  K+    V+AVGPG+ +++G++ P+SVK G+ VLLP+YGG +V L +K Y +LF
Subjt:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKST-KLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14980.1 chaperonin 103.0e-3171.08Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY
        M KRL+P  NR+L+++++ P KT SGILLPEKS+KLNSGKVIAVGPG+RD++GK+IP+SVKEGD VLLPEYGG +VKLGE +Y
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQY

AT1G23100.1 GroES-like family protein3.5e-3276.19Show/hide
Query:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYV
        MAKRL+P LNRVL+EKI+PP+KT SGILLPEKS++LNSG+VIAVGPGARDR G +IP+SVKEGD VLLPE+GG +VKLGEK+++
Subjt:  MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYV

AT5G20720.1 chaperonin 208.4e-1047.37Show/hide
Query:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS-TKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G VIAVGPG+ D EGKI P+ V  G  VL  +Y GN+ K
Subjt:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS-TKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVK

AT5G20720.2 chaperonin 208.4e-1047.37Show/hide
Query:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS-TKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G VIAVGPG+ D EGKI P+ V  G  VL  +Y GN+ K
Subjt:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS-TKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVK

AT5G20720.3 chaperonin 208.4e-1047.37Show/hide
Query:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS-TKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G VIAVGPG+ D EGKI P+ V  G  VL  +Y GN+ K
Subjt:  KRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKS-TKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAAACGTTTGCTTCCATTGCTGAATCGCGTTCTGATCGAGAAGATCGTTCCCCCTACCAAGACCAATTCCGGCATTTTGCTTCCTGAGAAGTCCACTAAGCTCAA
CTCTGGAAAAGTTATCGCTGTTGGTCCTGGGGCTCGTGACAGAGAGGGAAAGATTATTCCTATCTCTGTAAAGGAAGGTGACATGGTTCTCCTACCAGAATATGGAGGAA
ATGAAGTCAAGCTTGGAGAAAAGCAGTATGTATACCTGTTCTATTGCTTTATTTATTTAGTTTTTGTCTGTTATTTGATCAAGAATTTGGTTTTAAAGTTAACCTGGAAG
TTGAAGTGCCCTCAATTTCTCCATATGGCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTAAACGTTTGCTTCCATTGCTGAATCGCGTTCTGATCGAGAAGATCGTTCCCCCTACCAAGACCAATTCCGGCATTTTGCTTCCTGAGAAGTCCACTAAGCTCAA
CTCTGGAAAAGTTATCGCTGTTGGTCCTGGGGCTCGTGACAGAGAGGGAAAGATTATTCCTATCTCTGTAAAGGAAGGTGACATGGTTCTCCTACCAGAATATGGAGGAA
ATGAAGTCAAGCTTGGAGAAAAGCAGTATGTATACCTGTTCTATTGCTTTATTTATTTAGTTTTTGTCTGTTATTTGATCAAGAATTTGGTTTTAAAGTTAACCTGGAAG
TTGAAGTGCCCTCAATTTCTCCATATGGCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKRLLPLLNRVLIEKIVPPTKTNSGILLPEKSTKLNSGKVIAVGPGARDREGKIIPISVKEGDMVLLPEYGGNEVKLGEKQYVYLFYCFIYLVFVCYLIKNLVLKLTWK
LKCPQFLHMA