; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G8275 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G8275
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationctg1557:4074050..4074802
RNA-Seq ExpressionCucsat.G8275
SyntenyCucsat.G8275
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648921.1 hypothetical protein Csa_008227 [Cucumis sativus]3.41e-53100Show/hide
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XP_004148693.1 mini zinc finger protein 2 [Cucumis sativus]4.22e-53100Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]7.92e-5297.59Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]7.26e-4891.57Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]1.53e-4992.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor2.04e-53100Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 23.83e-5297.59Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 23.83e-5297.59Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like3.51e-4891.57Show/hide
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A0A6J1JL94 mini zinc finger protein 2-like3.79e-4890.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 11.5e-1979.25Show/hide
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Q0J5F8 Mini zinc finger protein 46.9e-2056.47Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 39.7e-2263.86Show/hide
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        M+KRQVV+++ + S   + +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TE
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.8e-2358.24Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 23.3e-3079.31Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger6.9e-2363.86Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.3e-2458.24Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 22.4e-3179.31Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 223.9e-1863.79Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++  + GG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAGAAGATCAGAAGAATCCTCAAGGGATTCTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCACGCTGCCGGTGTCGGAGGGTACG
CCGTTGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGAATTTCCATAGAAGGCAAGTTGGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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