| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004145851.1 THO complex subunit 4D [Cucumis sativus] | 2.66e-194 | 100 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 3.21e-188 | 97.55 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRNAT NVVN FPGPSHRGGLRNARGRGRGAW+RGVGLGG SGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 1.05e-168 | 85.25 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSG---------GGRGRGRGRG----------RGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
SESGR +SN VN FPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+G GGG G GGRGRGRGRG RGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSG---------GGRGRGRGRG----------RGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 7.29e-169 | 88.14 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRG--AWSRGVGLGGG---SGGGRGRGRG----RGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGR +SN VN FPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+G GGG GGGRGRGRG RGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRG--AWSRGVGLGGG---SGGGRGRGRG----RGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 6.34e-179 | 92.66 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGV+KEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGR A+SNVVN FPGPSHRGGLRN RGRGRG W+RG G+GGG GGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L717 RRM domain-containing protein | 2.82e-134 | 100 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 1.55e-188 | 97.55 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRNAT NVVN FPGPSHRGGLRNARGRGRGAW+RGVGLGG SGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 2.63e-163 | 87.76 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGR +S VVN FPGPS+RG LR RGRGRG WSRG G GGGRGRGRGRGRG GRKK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 2.04e-168 | 87.8 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRG--AWSRGVGLGGG---SGGGRGRGRG----RGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGR +S+ VN FPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+G GGG GGGRGRGRG RGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRG--AWSRGVGLGGG---SGGGRGRGRG----RGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 5.07e-169 | 85.25 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSG---------GGRGRGRGRG----------RGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
SESGR +SN VN FPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+G GGG G GGRGRGRGRG RGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: SESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSG---------GGRGRGRGRG----------RGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 3.6e-32 | 38.28 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPHRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
M +DMSL+D+IK N ++ +RG R GRG GG+ GG GV G GP+ + AR + P R K + +WQHDLF+ A +
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPHRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
Query: GIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNG
G++ G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G +K+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I++ V+++I+ T
Subjt: GIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNG
Query: RNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
R ++V +RGG+ R RG G G GG G RG RGRGRG GR + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: RNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 7.5e-70 | 53.9 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDI+ELFSEIG+V+R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVLTSESGRNATSNVVNSFPGP----SHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G GP S R + N +G G G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGRNATSNVVNSFPGP----SHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 7.6e-46 | 45.13 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE---MPVSARIN
G S I+ GTKLY+SNLDYGV+ EDIKELFSE+GD+KR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N +P+ A
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE---MPVSARIN
Query: VT-GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGGS-GGGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELEN
+ TNG + N N +F G N RGRGRG + RG G GGG+ GGRG RGRG GRG GR + S+++LD EL+
Subjt: VT-GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGGS-GGGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELEN
Query: YHAEAMQT
YH EAM+T
Subjt: YHAEAMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 3.9e-42 | 42.27 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIQIG
M+T LDMSL+D+I KN ++RG A RG G G + R P + R++ Y K P W HD+F ED +GI+ G
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIQIG
Query: TKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRT
TKLY+SNLDYGV EDIKELF+E+G++KR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N +
Subjt: TKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRT
Query: VVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
+ SGR A N G RG G+GRG RG G GGG GG GRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: VVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 7.3e-65 | 50.96 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDI+EL++EIG++KR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV--------GLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
G NGR +R+V F G RGG R RGRG G R + G+ G GG RGRGRG G G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV--------GLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.2e-66 | 50.96 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDI+EL++EIG++KR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV--------GLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
G NGR +R+V F G RGG R RGRG G R + G+ G GG RGRGRG G G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV--------GLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.2e-66 | 50.96 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDI+EL++EIG++KR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV--------GLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
G NGR +R+V F G RGG R RGRG G R + G+ G GG RGRGRG G G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV--------GLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.4e-47 | 45.13 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE---MPVSARIN
G S I+ GTKLY+SNLDYGV+ EDIKELFSE+GD+KR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N +P+ A
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE---MPVSARIN
Query: VT-GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGGS-GGGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELEN
+ TNG + N N +F G N RGRGRG + RG G GGG+ GGRG RGRG GRG GR + S+++LD EL+
Subjt: VT-GTNGRNRRTVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGGS-GGGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELEN
Query: YHAEAMQT
YH EAM+T
Subjt: YHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 5.3e-71 | 53.9 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDI+ELFSEIG+V+R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVLTSESGRNATSNVVNSFPGP----SHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G GP S R + N +G G G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGRNATSNVVNSFPGP----SHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 8.2e-72 | 54.64 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDI+ELFSEIG+V+R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ GR P S R + N +G G G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGRNATSNVVNSFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
