| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| XP_038899577.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45-like [Benincasa hispida] | 2.05e-235 | 97.24 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0KZM9 RRM domain-containing protein | 3.07e-244 | 99.75 | Show/hide |
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| A0A1S3CPA3 serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 1.87e-238 | 97.99 | Show/hide |
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| A0A5D3CC44 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 1.89e-224 | 90.12 | Show/hide |
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RGRSSSYSASPSPRKVPRRVSRSPR
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| A0A6J1C2C4 serine/arginine-rich splicing factor SR45 isoform X1 | 5.09e-217 | 92.4 | Show/hide |
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SPSPL RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRR RSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRP AA RRGRSSSYSASPSPRKV
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RRVSRSPR
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|
|
| A0A6J1C2D4 serine/arginine-rich splicing factor SR45 isoform X2 | 1.56e-219 | 93.55 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSPPSGSAS SSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRS SVSRSRSRSRS SSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARR+RASPPPAKRSSPP
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PRKPSPVRESLVLH+DALSRNVHEGHLREIF NFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTR DAEKAQVYMDGAQIDGNVIR RFTLPQRQKMPTPPRT
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VA PKRDGPKPENVG +AEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSP RRQPDSPRRRP+SPPRRR+ESPFRRDSPP RRRPASP+RG RSPSPL
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RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRR RSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRP AA RRGRSSSYSASPSPRKV RRVSR
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SPR
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
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| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 4.0e-19 | 42.64 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RRSR+ P KR ++ SP
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+ +H+ L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R +S
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| Q28E41 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 2.1e-20 | 43.8 | Show/hide |
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+R RRS SGS+SSSRSRS S S S S S S S S S S S S SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RRSR+ KR ++ SP
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+H+ L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R +P+R
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P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R +S
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| Q3KPW1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-B | 1.8e-19 | 43.02 | Show/hide |
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++ RRS SGS+SSSRSR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RRSR+ KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
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P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R +S
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| Q5XG24 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-A | 2.3e-19 | 42.64 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
++ RRS SGS+SSS SR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RRSR+ KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
Query: ESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+H+ L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R + P+R
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Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDS
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R +S
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| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 3.6e-105 | 67.25 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLHVD+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
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Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPF-RRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPR RR PDSP RRR SP RR PPRRRPASP RG SP
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Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRRV
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++PR++
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Query: SRS
SRS
Subjt: SRS
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 2.6e-106 | 67.25 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLHVD+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPF-RRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPR RR PDSP RRR SP RR PPRRRPASP RG SP
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Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRRV
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++PR++
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Query: SRS
SRS
Subjt: SRS
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| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 2.4e-104 | 66.58 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLHVD+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPF-RRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPLA
+ PKRD PK +N DAEKD R+ PR + SPRRRSP+ RRG SPR RR PDSP RRR SP RR PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPF-RRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPLA
Query: RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRRVSR
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++PR++SR
Subjt: RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRRVSR
Query: S
S
Subjt: S
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| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 4.1e-104 | 65.38 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSASSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLHVD+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHVDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPF-RRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPR RR PDSP RRR SP RR PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPF-RRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSAS
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+ G G AGRRGRSSSYS+S
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSAS
Query: PSPRKVPRRVSRS
PSPR++PR++SRS
Subjt: PSPRKVPRRVSRS
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| AT2G29210.1 splicing factor PWI domain-containing protein | 1.4e-06 | 48.04 | Show/hide |
Query: KRQREPSPRRKPPSPRRR---SPVARRGGSP---RRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPFRRDSPPPRRR--PASPMRGGRSPSPLARRHRSPPRPSPRRIRG
+R R S RR SPRRR SP R SP R+P RR P RR SP SPP RRR P+ P R RSPSP ARRHRSP P+ +R
Subjt: KRQREPSPRRKPPSPRRR---SPVARRGGSP---RRQPDSPRRRPDSPPRRRIESPFRRDSPPPRRR--PASPMRGGRSPSPLARRHRSPPRPSPRRIRG
Query: SPV--RRRSPPPPRRR---TPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSP
SP R RSPPP RRR +PP R R P P RRRS SP+ R RS S + R R A +RGRS S SPSP
Subjt: SPV--RRRSPPPPRRR---TPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSP
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