CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G9070
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5
Genome location	ctg1635:2160112..2169569
RNA-Seq Expression	Cucsat.G9070
Synteny	Cucsat.G9070
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process) GO:0000502 - proteasome complex (cellular component)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

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Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLI

Query:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA
        SA+D ILGSSEG+DVNV E+A EALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+VI AAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE RSENDIMLNDNAEENLRDLIYQ A
Subjt:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS KMTPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQDI+NIV DAS+ETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AV+NGPYL+RR +ETQPAIMTAERF
Subjt:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

0.0

86.67

Show/hide

Query:  MEEFSVNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLAC
        MEEF+V+DPT+LL+AAA+FANYPGVRTD SVKEF  RFPLP +INALQ KAE PGLE+TLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQ VR+LAC
Subjt:  MEEFSVNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLAC

Query:  KTVTRLLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTVTRLL+E+D T     QLI+DY IYPLL++CLLNGNEQVANSSMD++K LAAFP+GMEII P+NKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
Subjt:  KTVTRLLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS

Query:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLI
        SVASAVYN+NLL+LLESEI+NS DTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTSFLQLL SIISN SAESILRSRAMVI GRLLSKENIFSLVDESC+R LI
Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLI

Query:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA
        S++D ILGSSEG+DVNV E+A EALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+VI AAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE RSENDIMLNDNAEENL DLIYQ A
Subjt:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS K+TPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQDI+NIV DAS+ETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AV+NGPYL+RR +ETQPAIMTAERF
Subjt:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

1.1e-165

56.73

Show/hide

Query:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR
        + D  +L  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+TLV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   +S +QL+++ GIYPLLLD ++N +++VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLISAVDG
        V  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E+ ++ LISA+DG
Subjt:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLISAVDG

Query:  ILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK
         L S E  D +  EAAI+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI GE R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K
Subjt:  ILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK

Query:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG
        +TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL EI +K++I+NIV DA++ET KI MEARYNCC AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+G
Subjt:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG

Query:  PYLNRRNVETQPAIMTAERF
        PY+++++   +P +MT E F
Subjt:  PYLNRRNVETQPAIMTAERF

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

7.1e-162

53.62

Show/hide

Query:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR
        + D  +L  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+TLV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   +S +QL+++ GIYPLLLD ++N +++VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDES-----------
        V  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E+           
Subjt:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDES-----------

Query:  ---------------------CLRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF
                             C++ LISA+DG L S E  D +  EAAI+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI 
Subjt:  ---------------------CLRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF

Query:  GEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCL
        GE R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K+TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL EI +K++I+NIV DA++ET KI MEARYNCC 
Subjt:  GEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCL

Query:  AIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+++++   +P +MT E F
Subjt:  AIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTTTCTGTTAATGATCCGACTCGGCTACTCCAAGCAGCTGCAAACTTCGCTAATTATCCCGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCG
CTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAATTTCCTGGTCTAGAGGATACTTTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGAG
CTTCTCTTATACCGCATTACATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACAGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAACCTTAGCTTGTAAAACGGTTACTCGCCTCTTGCAGGAGTCT
GATGAAACTGCTCTTTCGCCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCCACTTTTGCTAGACTGCCTTCTGAATGGTAACGAACAAGTTGCTAACTCATCGATGGA
TTCAATTAAGACATTGGCTGCATTTCCACAGGGGATGGAAATCATCATCCCATCAAATAAAACAGAAGCAACACACCTAGGGACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGG
GAAGAGTTCGAGTCATGGCATTGGTAGTGAAGCTATTTTCAGTTTCTAGCTCTGTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAAT
AATTCAAAGGACACACTTGTAACTTTAAGTGTCTTGGAACTCTTGTATGAGCTAGTGGAGATTGAACACGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTACT
AGGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCCATGGTCATTTGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACATCTTCTCGCTTGTAGATGAAT
CATGTCTGCGGAATTTGATATCTGCTGTAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGAGAGGATGTAAATGTATCTGAAGCTGCAATTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCC
AGCACATGGGGAGCCACCTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACCTGTGTGAAGCATGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAACATGGTAAACAGCTGGCAGCCATGCA
TGCTCTTGGTAACATCTTCGGGGAAGGTCGATCAGAGAATGATATTATGCTAAATGATAATGCAGAAGAAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTT
CAAAAATGACACCCTCAGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGTCTA
ACAGAGATCTGCTCGAAACAAGACATAGTAAATATAGTTGGTGATGCAAGTTCTGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGGCTATCCATAA
GGCCTTCATGTCTTCACCTAGGCTTACTGGCGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCAAAGCTGCAGGAAGCGGTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATGTTG
AAACTCAACCAGCTATAATGACAGCTGAAAGATTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEFSVNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTRLLQES
DETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEIN
NSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGS
STWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGEGRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL
TEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

Cucsat.G9070 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome