; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G9071 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G9071
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description30S ribosomal protein S20, chloroplastic
Genome locationctg1635:2170034..2173628
RNA-Seq ExpressionCucsat.G9071
SyntenyCucsat.G9071
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002583 - Ribosomal protein S20
IPR036510 - Ribosomal protein S20 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004146049.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucumis sativus]1.11e-115100Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

XP_008463697.1 PREDICTED: 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucumis melo]2.51e-11296.2Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAA+TCF+LSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTER+HRYSVVCEAAPK+K DSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIE L+AEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

XP_022139608.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Momordica charantia]4.84e-9485.33Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAAITCFS+SSKF NLSLN  SSS PA+ SSSTL+SL+FSSN+S  AFSNGCLSM + +R  RYSVVCEAAPK KVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALD LKKK EAQSEEVL IE LIAEAYSVIDKAV+ GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWY P SPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]9.31e-9283.61Show/hide
Query:  AAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKSE
        A A I+CF+L SKF NLSLN  SSS+P +PSSSTLRSLSFSSN+S+SAFSNGCLS+ K +R  RYSVVCEAAPK K DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSE
Subjt:  AAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKSE

Query:  IKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        IKTRMKKV+EALD LKKK EAQSEEVLPIE LIAEA+SVIDKAV+ GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt:  IKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

XP_038899721.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Benincasa hispida]3.06e-9786.41Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAA A++CFSL SKF NLSLN  SS IPA+PSS TLRSLSFSSN S+SAFSNGCL+M K +R  RYSVVCEAAPK+K DSAAKR RQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTR+KKVLEALDGLKKK EAQSEEVLPIE LIAEAYSVIDKAVR GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZK9 Uncharacterized protein5.37e-116100Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

A0A1S3CJU9 30S ribosomal protein S20, chloroplastic1.21e-11296.2Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAA+TCF+LSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTER+HRYSVVCEAAPK+K DSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIE L+AEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

A0A5A7VMD2 30S ribosomal protein S201.21e-11296.2Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAA+TCF+LSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTER+HRYSVVCEAAPK+K DSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIE L+AEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

A0A6J1CG14 30S ribosomal protein S20, chloroplastic2.34e-9485.33Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MAAAAITCFS+SSKF NLSLN  SSS PA+ SSSTL+SL+FSSN+S  AFSNGCLSM + +R  RYSVVCEAAPK KVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        EIKTRMKKVLEALD LKKK EAQSEEVL IE LIAEAYSVIDKAV+ GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWY P SPAAA
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like4.51e-9283.61Show/hide
Query:  AAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKSE
        A A I+CF+L SKF NLSLN  SSS+P +PSSSTLRSLSFSSN+S+SAFSNGCLS+ K +R  RYSVVCEAAPK K DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSE
Subjt:  AAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKSE

Query:  IKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        IKTRMKKV+EALD LKKK EAQSEEVLPIE LIAEA+SVIDKAV+ GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt:  IKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A7HJB0 30S ribosomal protein S201.4e-0846.07Show/hide
Query:  SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
        SA KR R +EKRR+ NKA K+ +K ++K VL A+        AQ +    I  L  +A S IDKA ++G +H+N A+RRKSRLA + KA
Subjt:  SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKA

P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic3.7e-4662.36Show/hide
Query:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS
        MA  +  C S+SSK  NLS +  S+  P    +S+L+ L+FS+N+S   FS GC S+   +R   +SVVCE A   K DSAAKR RQAE RR+ NKARKS
Subjt:  MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKS

Query:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP
        E+KTRM+KV EALD LKKK+ A +EE++PI+ LIAEAYS IDKAV  GTLHRNTAARRKSRLAR KK VEIHHGWYTP
Subjt:  EIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP

Q3M5D2 30S ribosomal protein S202.8e-0946.15Show/hide
Query:  SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVE
        SA KRA+ AE+ R+ NK  KS +KT MK  L A+         +S++    +T +A AYS IDKAV+ G LH N  AR+KSRLA + K +E
Subjt:  SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVE

Q8YWL3 30S ribosomal protein S202.8e-0946.15Show/hide
Query:  SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVE
        SA KRA+ AE+ R+ NK  KS +KT MK  L A+         +S++    +T +A AYS IDKAV+ G LH N  AR+KSRLA + K +E
Subjt:  SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVE

Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic1.2e-4460.96Show/hide
Query:  TCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAP------SSSTL-RSLSFSSNIS-LSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCE-AAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKA
        +C +L S+F  LSL G S S P++       +S+TL  SLSFS ++S   AFS G L ++K     R  +VCE AAP  K DSAAKRARQAEKRR+YNK+
Subjt:  TCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAP------SSSTL-RSLSFSSNIS-LSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCE-AAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKA

Query:  RKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        +KSE +TRMKKVLEAL+GLKKK +AQ++E++ +E LI EAYS IDKAV+   LH+NT ARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PD+ AAA
Subjt:  RKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15190.1 chloroplast 30S ribosomal protein S20, putative8.5e-4660.96Show/hide
Query:  TCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAP------SSSTL-RSLSFSSNIS-LSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCE-AAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKA
        +C +L S+F  LSL G S S P++       +S+TL  SLSFS ++S   AFS G L ++K     R  +VCE AAP  K DSAAKRARQAEKRR+YNK+
Subjt:  TCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAP------SSSTL-RSLSFSSNIS-LSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCE-AAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKA

Query:  RKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
        +KSE +TRMKKVLEAL+GLKKK +AQ++E++ +E LI EAYS IDKAV+   LH+NT ARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PD+ AAA
Subjt:  RKSEIKTRMKKVLEALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCAGCTGCAATTACTTGCTTCTCTCTTTCTTCTAAGTTCGGAAATCTTTCCCTTAATGGGTTTTCCTCCTCTATTCCCGCTGCCCCATCTTCTTCCACCCTCAG
GTCTCTCAGTTTCTCCTCCAACATTTCACTTTCCGCCTTCTCCAATGGGTGTCTGTCGATGAGGAAAACTGAGAGGCTGCATCGTTACTCTGTGGTTTGCGAGGCAGCTC
CGAAGTCCAAAGTTGATTCTGCTGCCAAGAGGGCTCGGCAGGCTGAGAAAAGACGTATTTACAATAAAGCCCGAAAATCTGAAATTAAAACCAGGATGAAGAAGGTTCTG
GAAGCTTTAGATGGTCTCAAGAAGAAAGCTGAAGCACAATCAGAGGAAGTCCTTCCAATTGAGACGCTCATTGCAGAAGCATACTCAGTGATCGACAAAGCCGTGAGAGC
GGGCACATTGCACCGAAACACTGCCGCACGACGAAAATCTCGGCTCGCCAGAAGAAAGAAAGCTGTAGAAATCCACCATGGGTGGTACACCCCGGATTCACCAGCGGCTG
CCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCAGCTGCAATTACTTGCTTCTCTCTTTCTTCTAAGTTCGGAAATCTTTCCCTTAATGGGTTTTCCTCCTCTATTCCCGCTGCCCCATCTTCTTCCACCCTCAG
GTCTCTCAGTTTCTCCTCCAACATTTCACTTTCCGCCTTCTCCAATGGGTGTCTGTCGATGAGGAAAACTGAGAGGCTGCATCGTTACTCTGTGGTTTGCGAGGCAGCTC
CGAAGTCCAAAGTTGATTCTGCTGCCAAGAGGGCTCGGCAGGCTGAGAAAAGACGTATTTACAATAAAGCCCGAAAATCTGAAATTAAAACCAGGATGAAGAAGGTTCTG
GAAGCTTTAGATGGTCTCAAGAAGAAAGCTGAAGCACAATCAGAGGAAGTCCTTCCAATTGAGACGCTCATTGCAGAAGCATACTCAGTGATCGACAAAGCCGTGAGAGC
GGGCACATTGCACCGAAACACTGCCGCACGACGAAAATCTCGGCTCGCCAGAAGAAAGAAAGCTGTAGAAATCCACCATGGGTGGTACACCCCGGATTCACCAGCGGCTG
CCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAAITCFSLSSKFGNLSLNGFSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKSKVDSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRMKKVL
EALDGLKKKAEAQSEEVLPIETLIAEAYSVIDKAVRAGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA