| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.44e-154 | 86.69 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRD+DYRRRSRSRS RSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSP+RS SPRRSLSPRRS PSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 1.59e-182 | 99.65 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRD+YRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 5.91e-178 | 97.16 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RD+YRD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 8.46e-155 | 87.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRD+DYRRRSRSRS RSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRS PSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 1.29e-168 | 93.64 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RD+YRD+DYRRRSRSRSRSRS D++DRDRRGRE+ERER++RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSR--GRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
SRSRSR GRSRSVDSGSPGR+SPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR SPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRP DSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSR--GRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 7.68e-183 | 99.65 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRD+YRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.86e-178 | 97.16 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RD+YRD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.88e-154 | 89.05 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS-
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RD+ RD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS-
Query: -LSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
SRS+SRG+SRSVDS SPGRRS SPRRS LSP+RSPSPR ESP RNG+G GR+PT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: -LSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 4.09e-155 | 87.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRD+DYRRRSRSRS RSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRS PSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.38e-152 | 84.95 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD YRD+DYRRRSRSRS RSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRS PSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+ ADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRS------------------PSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.2e-26 | 45.2 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + S Y RSRSPRRR R R RSRSRSRSRS R R R + R R R RSRS SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNG
RSRSR RSRS RSP P S R S S RS SP +SPE G
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.8e-26 | 45.04 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR R R RSRSRSRSRS R R R + R R R RSRS SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.8e-26 | 45.04 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR R R RSRSRSRSRS R R R + R R R RSRS SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.8e-26 | 45.04 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR R R RSRSRSRSRS R R R + R R R RSRS SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.6e-70 | 61.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RD+YR+KDYR+RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS +E SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 8.0e-14 | 37.73 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ ++R +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSR
R R +RD RRR+ R SRS ++ RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R RSL+ R + RS
Subjt: SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSR
Query: SVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S R SP R+ P SRS SP G D RSPS
Subjt: SVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.6e-14 | 36.84 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
+ E SR+R R R+P R + SRSRS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R R
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
SL+ R + RS S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S R SP R+ P SRS SP G D RSPS
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.0e-13 | 36.5 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSR
+ + +S R++ R RSP R R RR RSRSRSR + R +SRS+SP+ RY+ E RS SR
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSR
Query: SRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPS
S SR V SGSPGR R SPRRS+SPR++ S E R+ + V R S + PRG RSPS
Subjt: SRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.9e-71 | 61.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RD+YR+KDYR+RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS +E SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.9e-71 | 61.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RD+YR+KDYR+RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDEYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS +E SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
