; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10000724 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10000724
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionprotein RALF-like 34
Genome locationChr09:8537840..8538115
RNA-Seq ExpressionHG10000724
SyntenyHG10000724
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571407.1 Protein RALF-like 34, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-3886.81Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTT S+ +   D D D  DL QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_004148071.1 protein RALF-like 34 [Cucumis sativus]5.0e-4186.96Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTTTSLI++  + D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPY+RGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_008457868.1 PREDICTED: protein RALF-like 34 [Cucumis melo]7.7e-4289.13Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTTTSLI++  D D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_023513191.1 protein RALF-like 34 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-3886.81Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTT S+ +   D D D  DL QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_038900702.1 protein RALF-like 34 [Benincasa hispida]8.2e-4492.47Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEA--AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTTTSLIE+  A DIDDDE+DL+QDPRRSLFW RVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEA--AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMS2 Uncharacterized protein2.4e-4186.96Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTTTSLI++  + D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPY+RGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A151TIM7 Uncharacterized protein4.6e-3272.83Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQD-PRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        M+DAL+WPTT SL +   D D +E D++    RRSLFW R+ YYISYGAL+ANRIPCPPRSGR YYTHNCYKARGPV+PYSRGCS ITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQD-PRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A1S3C7S7 protein RALF-like 343.7e-4289.13Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTTTSLI++  D D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A6A5LJB3 Putative rapid ALkalinization Factor3.9e-3167.01Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDP------RRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        M+D L+WPTT SL +   D D+D+V  ++D       RRSLFW R+ YYISYGAL+ANR+PCPPRSGR YYTHNCY ARGPV+PY+RGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDP------RRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A6J1EJN3 protein RALF-like 342.5e-3883.16Show/hide
Query:  MADALEWPTTTSLIEA----AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        MADALEWPTT S+ +       D D D  DL QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTSLIEA----AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.5e-0842.5Show/hide
Query:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        ++ E +    ++E ++  +  R +       YISYGAL  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Q945T0 Rapid alkalinization factor8.9e-0948.57Show/hide
Query:  DDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCR
        +++E +L  +  R +  ++   YISYGAL  N +PC  R G  YY  NC K     NPYSRGCSAITRCR
Subjt:  DDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCR

Q9FHA6 Protein RALF-like 343.9e-2858.95Show/hide
Query:  MADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        + D  +WP + S    +I+     +  E D     RRSL+W R  YYISYGAL+ANR+PCPPRSGR YYTHNC++ARGPV+PYSRGCS+ITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 238.9e-0950.72Show/hide
Query:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        +E ++  +  R +  +R   YISYGAL  N IPC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Q9MA62 Protein RALF-like 221.2e-0843.9Show/hide
Query:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        T S+ E  A  +++E++   D  R +   +   YISYGA+  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCS ITRCRR
Subjt:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G33775.1 ralf-like 193.2e-0946.07Show/hide
Query:  WPTTTSLIEAAADI-DDDEVDLQQDP---RRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        W  T S +     I +D E+D   D    RR L   R   YISYGAL  N +PC  R GR YY  +C K R   NPY RGCS IT C R
Subjt:  WPTTTSLIEAAADI-DDDEVDLQQDP---RRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT3G05490.1 ralf-like 228.3e-1043.9Show/hide
Query:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        T S+ E  A  +++E++   D  R +   +   YISYGA+  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCS ITRCRR
Subjt:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 236.4e-1050.72Show/hide
Query:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        +E ++  +  R +  +R   YISYGAL  N IPC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT4G15800.1 ralf-like 331.1e-0942.5Show/hide
Query:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        ++ E +    ++E ++  +  R +       YISYGAL  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT5G67070.1 ralf-like 342.7e-2958.95Show/hide
Query:  MADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        + D  +WP + S    +I+     +  E D     RRSL+W R  YYISYGAL+ANR+PCPPRSGR YYTHNC++ARGPV+PYSRGCS+ITRCRR
Subjt:  MADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGACGCCCTCGAATGGCCCACCACCACCTCCCTCATCGAAGCCGCCGCCGACATCGACGATGATGAAGTCGACCTACAACAAGACCCCCGCAGATCTCTCTTCTG
GAGCCGAGTCCACTACTACATTTCTTACGGCGCCCTCGCCGCCAACCGGATCCCTTGCCCGCCCCGCTCCGGCCGCCCTTACTACACTCACAACTGCTACAAAGCTCGTG
GCCCTGTCAATCCTTACTCCCGCGGCTGCTCCGCCATCACTCGCTGCCGCCGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGACGCCCTCGAATGGCCCACCACCACCTCCCTCATCGAAGCCGCCGCCGACATCGACGATGATGAAGTCGACCTACAACAAGACCCCCGCAGATCTCTCTTCTG
GAGCCGAGTCCACTACTACATTTCTTACGGCGCCCTCGCCGCCAACCGGATCCCTTGCCCGCCCCGCTCCGGCCGCCCTTACTACACTCACAACTGCTACAAAGCTCGTG
GCCCTGTCAATCCTTACTCCCGCGGCTGCTCCGCCATCACTCGCTGCCGCCGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR