; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10001059 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10001059
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionRibosomal protein
Genome locationChr09:13635161..13635628
RNA-Seq ExpressionHG10001059
SyntenyHG10001059
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015934 - large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000911 - Ribosomal protein L11/L12
IPR006519 - Ribosomal protein L11, bacterial-type
IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal
IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal
IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily
IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7034038.1 mrpl19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTL+VKHIY+IAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANSMGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_023003939.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]4.8e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKK+AGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANS GIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_031269209.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial [Pistacia vera]4.8e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKK AGIESGS R
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANSMGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_031283263.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial-like [Pistacia vera]1.3e-7696.13Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKK AGIESGS R
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLE ICKSIIGTANSMGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_038901904.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial [Benincasa hispida]3.3e-7797.42Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANSMGIKVVKELE
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWT6 Uncharacterized protein3.9e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK +TPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A1S3BMZ5 54S ribosomal protein L19, mitochondrial3.0e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A5A7T9U7 54S ribosomal protein L193.0e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A6A2Z0M6 54S ribosomal protein L193.9e-7693.55Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        M+TLKEILTRRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHV+A+TLSV+HIYEIAK+KQSDPYCQYMSLE ICKSIIGTAN+MGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A6J1KUS1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial-like2.3e-7695.48Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKK+AGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVASTLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYM LE ICKSIIGTANS GIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A7HWQ0 50S ribosomal protein L114.6e-2947.89Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS
        + +   I+L VPAGAA P+PP+GPALGQ  LN+M FCK FNA TQK +   P+ V ITAF D +F F +K+P  +++LKKAA + SGS  PG   A T++
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVK
        V    EIA+ K +D       L+   K I G+A SMG++VV+
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVK

Q07KJ7 50S ribosomal protein L113.5e-2947.14Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS
        + V   ++L VPAGAA P+PP+GPALGQ  LN+M FCK+FNA+TQK + +TP+ V IT + D +F F +K+P ++++LK+AA I+SGS  PG  VA  +S
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV
           + EIA+ K  D  C   S+E   + + G+A SMG++V
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV

Q211C4 50S ribosomal protein L115.9e-2946.43Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS
        + V   ++L VPAGAA P+PP+GPALGQ  LN+M FCK FNA+TQK + +TP+ V IT + D +F F +K+P ++++LK+AA ++SGS  PG  VA  ++
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV
           + EIA+ K  D  C   S+E   K + G+A SMG++V
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV

Q3SSY4 50S ribosomal protein L111.0e-2845.77Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS
        + V   ++L VPAGAA P+PP+GPALGQ  LN+M FCK FNA+TQK + +TP+ V IT + D +F F +K+P + ++LK+AA I+SGS  PG   A TL+
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVK
           + EIA+ K  D  C   ++E     + G+A SMG++V +
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVK

Q9UTK2 54S ribosomal protein L19, mitochondrial6.8e-3351.11Show/hide
Query:  IRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLSVKHIYE
        I+L VPAG A P PP+GPALG   L  + FCK+FNART  +  +TP+   IT     TF FT+ +P  +W + K   +E GSS P H +   LS+KHIYE
Subjt:  IRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLSVKHIYE

Query:  IAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVV
        IAK+K +DP  Q + L  +CKS+IGTA SMG+KVV
Subjt:  IAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32990.1 plastid ribosomal protein l112.5e-2242.86Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS
        + V   I+L + AG A PAPPVGPALG   +N+MAFCKD+NART   KA   + V IT F D +F F +K+P  +  L KAAG+E GS  P       ++
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV
        +  +  IA  K  D  C   ++E   + I GTA +MGI +
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV

AT4G35490.1 mitochondrial ribosomal protein L111.1e-7083.12Show/hide
Query:  ATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRP
        A  KEIL RRPVAATIRLTVPAG ARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDN+FEFTVKSP+V+WY+KKAAG++ GS+RP
Subjt:  ATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRP

Query:  GHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        GH+  +TLSV+H+YEIAKVKQ+DP+CQYM LE ICKSIIGTANSMGIK+V++LE
Subjt:  GHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE

AT5G51610.1 Ribosomal protein L11 family protein1.1e-0631.65Show/hide
Query:  DNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV
        D +F F +K+P  ++ L KAAG++ GS  P  +    +++  + +IA+VK  +  C   ++    ++I GTA +MGI +
Subjt:  DNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCTTGAAAGAGATTCTAACCAGACGACCCGTCGCTGCCACTATCAGGCTTACCGTCCCTGCCGGTGCAGCTCGCCCTGCGCCACCGGTGGGTCCGGCGCTGGG
TCAATACCGGCTAAATCTGATGGCCTTCTGCAAGGATTTCAATGCCCGGACTCAAAAGTACAAGGCTGACACCCCCATGGCCGTCACCATTACGGCTTTCAAGGACAACA
CCTTCGAGTTCACCGTCAAATCACCGTCAGTCACTTGGTACCTGAAGAAAGCTGCCGGGATCGAATCTGGGAGCAGCCGCCCAGGCCATGTAGTCGCCTCCACGCTTTCA
GTCAAGCACATTTATGAGATCGCCAAAGTCAAGCAATCCGATCCTTATTGCCAGTACATGTCACTCGAATGCATTTGTAAGTCCATTATCGGCACTGCCAATAGCATGGG
AATTAAGGTAGTTAAGGAATTGGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACCTTGAAAGAGATTCTAACCAGACGACCCGTCGCTGCCACTATCAGGCTTACCGTCCCTGCCGGTGCAGCTCGCCCTGCGCCACCGGTGGGTCCGGCGCTGGG
TCAATACCGGCTAAATCTGATGGCCTTCTGCAAGGATTTCAATGCCCGGACTCAAAAGTACAAGGCTGACACCCCCATGGCCGTCACCATTACGGCTTTCAAGGACAACA
CCTTCGAGTTCACCGTCAAATCACCGTCAGTCACTTGGTACCTGAAGAAAGCTGCCGGGATCGAATCTGGGAGCAGCCGCCCAGGCCATGTAGTCGCCTCCACGCTTTCA
GTCAAGCACATTTATGAGATCGCCAAAGTCAAGCAATCCGATCCTTATTGCCAGTACATGTCACTCGAATGCATTTGTAAGTCCATTATCGGCACTGCCAATAGCATGGG
AATTAAGGTAGTTAAGGAATTGGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGAARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVASTLS
VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMSLECICKSIIGTANSMGIKVVKELE