; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10001491 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10001491
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationChr09:17562145..17563523
RNA-Seq ExpressionHG10001491
SyntenyHG10001491
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0030001 - metal ion transport (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0046873 - metal ion transmembrane transporter activity (molecular function)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000253 - Forkhead-associated (FHA) domain
IPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR010543 - Domain of unknown function DUF1117
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646961.1 hypothetical protein Csa_020907 [Cucumis sativus]1.3e-20896.05Show/hide
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XP_004143127.2 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1, partial [Cucumis sativus]1.1e-21096.09Show/hide
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XP_008464108.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RING1 [Cucumis melo]2.2e-20896.05Show/hide
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XP_023532253.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-19892.39Show/hide
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        VSWASRRSRGRE+RGIGRTFRNIFSFFGR RSS+SS+S  SN++ESVSRSHS SSSSVFSRYLRR NR+W LEN +ENGRW
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XP_038902866.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1 [Benincasa hispida]2.4e-21097.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE74 RING-type E3 ubiquitin transferase3.8e-21491.35Show/hide
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        QDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVLRGS D GDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPAS
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        AVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMDGGFN NG PRRVSWASRRSRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSS+SSPSN+SESVSRSHSHSSSSVFSRYLRR
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        QNRAWVLENQ+ENGRW
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A0A1S3CKQ2 RING-type E3 ubiquitin transferase1.1e-20896.05Show/hide
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A0A5A7V7N5 RING-type E3 ubiquitin transferase1.1e-20896.05Show/hide
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A0A6J1G610 RING-type E3 ubiquitin transferase1.7e-19892.39Show/hide
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        VSWASRRSRGRE+RGIGRTFRNIFSFFGR RSS+SS+S  SN++ESVSRSHS SSSSVFSRYLRR NR W LEN +ENGRW
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A0A6J1L6T2 RING-type E3 ubiquitin transferase3.2e-19791.86Show/hide
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Query:  GDV-VGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSHCAVCKEAFEIGTE
        GD   GGGE NSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSHCAVCKEAF IGTE
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Query:  VSWASRRSRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSNDSESVSRSHSHSSSSVFSRYLRRQNRAWVLENQSENGRW
        VSWASRRSRGRE+RGIGRTFRNIFSFFGR RSS+SS+S  SN++ESVSRSHS SSSSVFSRYLRR NR W LEN +ENGRW
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A4.4e-3431.09Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRF--SPAAIHTLDQDS-FQSPRLSTRRSRRRLGDRS-----------
        MSS   ++WC+RC R VR   Q+ + C YC GGFVE ++   AS       HR           +D  S F   RL+ R   R +  R+           
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Query:  ----TFNPVVVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-
             F   V  R +GD          N+ +  + +G   G+        ++  G G + L EQL+     G  R   PPA ++A++++PTI+I + H+ 
Subjt:  ----TFNPVVVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-

Query:  DSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPP
         SDS+C VCK+ FE+G+EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS     A G S                                      
Subjt:  DSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPP

Query:  AVYTEMDGGFNANGAPRRVSWASRRSRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSN-----DSESVSRSHSHSSSSVFSRYL
                       P R   +S  S    SR  G   RN FS F  FRSS SS+SS  N     +S++   +H++        Y+
Subjt:  AVYTEMDGGFNANGAPRRVSWASRRSRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSN-----DSESVSRSHSHSSSSVFSRYL

O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A3.1e-8045.83Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAI---------ESETASSLPAANLHRRFSPAAIH------TLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDR
        M+SG  SYWCY C+RFV  W  DSI+CP CDGGF+E I         +S T ++        RF P +        ++  D+  +P + TR    R    
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAI---------ESETASSLPAANLHRRFSPAAIH------TLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDR

Query:  STFNPVVVLRGS--GDGGDVVGGG-ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILES
         + NPV+VLRGS      DVV  G +R++F +YYDDG  SGLRP+P +M+EFL+G+GFDRLL+Q++Q+E+N        E+PPASK+A+E++P IEI  +
Subjt:  STFNPVVVLRGS--GDGGDVVGGG-ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILES

Query:  HV--DSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVV-------DEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFS
        H+  DS SHCAVCKE F + + AREMPC HIYH DCI+PWL++RNSCPVCRHELP+E ++   G +   V       ++   GLTIWRLPGGGFAVGR  
Subjt:  HV--DSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVV-------DEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFS

Query:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRR----SRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSNDSES-------VSRSHSHSSSSVF
        GG   G+R  P VYTE+DGG       PRRV+W SRR      G   RG G   R I   FG F  SS S ++ +  S           R+ S S  S  
Subjt:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRR----SRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSNDSES-------VSRSHSHSSSSVF

Query:  SRYLRRQN
        S   RR+N
Subjt:  SRYLRRQN

Q940T5 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF24.6e-8447.51Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAWAQD------SITCPYCDGGFVEAIESETAS----SLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVL
        TASYWCY C RFV  WA        S+ CP+CDGGF+E I   +++    ++PA+   R             S  + R S  R RRR G R +FNPV+VL
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAWAQD------SITCPYCDGGFVEAIESETAS----SLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVL

Query:  RG------SGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSH
        +G       G+ GD     +R +F+ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E +  G GRS NPPASK+A+ES+P +EI + H+ S+++
Subjt:  RG------SGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSH

Query:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE
        CAVC E FE  TEAREMPCKH++H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPSE        S+   ++  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+     GER  P V TE
Subjt:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE

Query:  MDGG--FNANGAPRRVSWASRRSRG---RESRGIG----------RTFRNIFSFFGRF---RSSSSSTSSPSNDSES------VSRSHSHSSSSVFSRYL
        MDGG   N+   PRR+SW   RS G    +S G G          R  R + S   R    RSSSSS+++ S  S++      V       S+SV  RY 
Subjt:  MDGG--FNANGAPRRVSWASRRSRG---RESRGIG----------RTFRNIFSFFGRF---RSSSSSTSSPSNDSES------VSRSHSHSSSSVFSRYL

Query:  RR
        RR
Subjt:  RR

Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF13.3e-3738.11Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQ--DSFQSPRLSTRRSRRRL-------GDRSTFNPV
        MSS   ++WC+RC R V   A+D++ C YC GGFVE I+      +  +  HR         L +   +F   RL+ R   R +       G  S  N  
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQ--DSFQSPRLSTRRSRRRL-------GDRSTFNPV

Query:  VVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-DSDSHCAV
         +L   G     + GG+ +S + +  +GA  G+     T   ++  G G + L+EQL+    +G      PPA K++++++PTI+I + H+  SDSHC V
Subjt:  VVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-DSDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS
        CK+ FE+ +EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS

Q9SNB6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF11.4e-8548.16Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAW----AQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVLRGSGDG
        T SYWCY C RF+  W    A   + CPYC+GGF+E IE  + S++ A        PA+  T +  S +    S  R RRR   R++FNPV+VL G G G
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAW----AQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVLRGSGDG

Query:  G------DVVGGG---ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSHCAV
        G      +  G G   ER +++ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E   NG GRS NPPASK+A+ES+P +EI + H  ++++CAV
Subjt:  G------DVVGGG---ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMD-
        C E FE G E REMPCKHI+H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPS+ +  +        +E  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+ G   GER  P V TEMD 
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMD-

Query:  GGFNANGAPRRVSWA-------SRRSRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSP--SNDSESVSRSHSHSSSSV
        GG  +N  PRR+SW          R+ GR   G  + R  R + SF  R R S  S++S     DS+  +R  + S+S +
Subjt:  GGFNANGAPRRVSWA-------SRRSRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSP--SNDSESVSRSHSHSSSSV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39720.1 RING-H2 finger C2A2.2e-8145.83Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAI---------ESETASSLPAANLHRRFSPAAIH------TLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDR
        M+SG  SYWCY C+RFV  W  DSI+CP CDGGF+E I         +S T ++        RF P +        ++  D+  +P + TR    R    
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAI---------ESETASSLPAANLHRRFSPAAIH------TLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDR

Query:  STFNPVVVLRGS--GDGGDVVGGG-ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILES
         + NPV+VLRGS      DVV  G +R++F +YYDDG  SGLRP+P +M+EFL+G+GFDRLL+Q++Q+E+N        E+PPASK+A+E++P IEI  +
Subjt:  STFNPVVVLRGS--GDGGDVVGGG-ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILES

Query:  HV--DSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVV-------DEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFS
        H+  DS SHCAVCKE F + + AREMPC HIYH DCI+PWL++RNSCPVCRHELP+E ++   G +   V       ++   GLTIWRLPGGGFAVGR  
Subjt:  HV--DSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVV-------DEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFS

Query:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRR----SRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSNDSES-------VSRSHSHSSSSVF
        GG   G+R  P VYTE+DGG       PRRV+W SRR      G   RG G   R I   FG F  SS S ++ +  S           R+ S S  S  
Subjt:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRR----SRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSNDSES-------VSRSHSHSSSSVF

Query:  SRYLRRQN
        S   RR+N
Subjt:  SRYLRRQN

AT3G46620.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein1.0e-8648.16Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAW----AQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVLRGSGDG
        T SYWCY C RF+  W    A   + CPYC+GGF+E IE  + S++ A        PA+  T +  S +    S  R RRR   R++FNPV+VL G G G
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAW----AQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVLRGSGDG

Query:  G------DVVGGG---ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSHCAV
        G      +  G G   ER +++ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E   NG GRS NPPASK+A+ES+P +EI + H  ++++CAV
Subjt:  G------DVVGGG---ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMD-
        C E FE G E REMPCKHI+H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPS+ +  +        +E  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+ G   GER  P V TEMD 
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMD-

Query:  GGFNANGAPRRVSWA-------SRRSRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSP--SNDSESVSRSHSHSSSSV
        GG  +N  PRR+SW          R+ GR   G  + R  R + SF  R R S  S++S     DS+  +R  + S+S +
Subjt:  GGFNANGAPRRVSWA-------SRRSRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSP--SNDSESVSRSHSHSSSSV

AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein2.3e-3838.11Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQ--DSFQSPRLSTRRSRRRL-------GDRSTFNPV
        MSS   ++WC+RC R V   A+D++ C YC GGFVE I+      +  +  HR         L +   +F   RL+ R   R +       G  S  N  
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQ--DSFQSPRLSTRRSRRRL-------GDRSTFNPV

Query:  VVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-DSDSHCAV
         +L   G     + GG+ +S + +  +GA  G+     T   ++  G G + L+EQL+    +G      PPA K++++++PTI+I + H+  SDSHC V
Subjt:  VVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-DSDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS
        CK+ FE+ +EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS

AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein2.3e-3838.11Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQ--DSFQSPRLSTRRSRRRL-------GDRSTFNPV
        MSS   ++WC+RC R V   A+D++ C YC GGFVE I+      +  +  HR         L +   +F   RL+ R   R +       G  S  N  
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQ--DSFQSPRLSTRRSRRRL-------GDRSTFNPV

Query:  VVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-DSDSHCAV
         +L   G     + GG+ +S + +  +GA  G+     T   ++  G G + L+EQL+    +G      PPA K++++++PTI+I + H+  SDSHC V
Subjt:  VVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHV-DSDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS
        CK+ FE+ +EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS

AT5G59550.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein3.3e-8547.51Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAWAQD------SITCPYCDGGFVEAIESETAS----SLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVL
        TASYWCY C RFV  WA        S+ CP+CDGGF+E I   +++    ++PA+   R             S  + R S  R RRR G R +FNPV+VL
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAWAQD------SITCPYCDGGFVEAIESETAS----SLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSFQSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVL

Query:  RG------SGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSH
        +G       G+ GD     +R +F+ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E +  G GRS NPPASK+A+ES+P +EI + H+ S+++
Subjt:  RG------SGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEILESHVDSDSH

Query:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE
        CAVC E FE  TEAREMPCKH++H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPSE        S+   ++  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+     GER  P V TE
Subjt:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE

Query:  MDGG--FNANGAPRRVSWASRRSRG---RESRGIG----------RTFRNIFSFFGRF---RSSSSSTSSPSNDSES------VSRSHSHSSSSVFSRYL
        MDGG   N+   PRR+SW   RS G    +S G G          R  R + S   R    RSSSSS+++ S  S++      V       S+SV  RY 
Subjt:  MDGG--FNANGAPRRVSWASRRSRG---RESRGIG----------RTFRNIFSFFGRF---RSSSSSTSSPSNDSES------VSRSHSHSSSSVFSRYL

Query:  RR
        RR
Subjt:  RR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCACTGACACTGTCAATCAGTACACTAATAGAATAACGCCACGTGTCGTGCCAGTTCATTCGCGTGAGGGCGCGTGGCCACGCTCGTGTGAAACCGCGTGCCTGAT
TTTCAGATCTGAGGCGATGTCTTCCGGAACGGCGTCGTATTGGTGTTACCGCTGCAATCGTTTCGTTCGTGCTTGGGCTCAGGATTCTATTACTTGTCCTTACTGTGACG
GTGGGTTTGTTGAAGCAATTGAAAGTGAAACCGCCTCTTCTCTTCCGGCGGCCAATCTCCACCGTCGATTCTCACCGGCCGCGATCCATACTTTGGATCAAGATTCGTTT
CAGTCTCCTCGCTTGAGCACTCGACGTAGTCGTCGGAGACTTGGGGATCGATCGACTTTTAACCCTGTTGTTGTTCTACGTGGTTCTGGTGACGGCGGCGATGTGGTCGG
CGGTGGGGAGAGGAATAGCTTCGATATTTACTACGACGACGGTGCTGGGTCTGGGCTCCGGCCGGTTCCGGCGACGATGTCGGAGTTTCTGATGGGGACTGGGTTCGATC
GGTTGCTGGAACAGTTGGCTCAGCTGGAGATCAACGGGTTTGGTAGATCTGAAAATCCGCCGGCGTCGAAAGCCGCTGTGGAATCAATGCCGACGATTGAGATTTTAGAA
AGTCATGTGGATTCCGATTCGCACTGCGCCGTATGTAAAGAGGCGTTTGAAATCGGAACTGAAGCCCGAGAAATGCCCTGTAAGCACATATATCACTCCGATTGCATCAT
CCCTTGGCTTTCCATGAGAAATTCCTGTCCGGTCTGCCGACACGAGCTGCCCTCGGAACGTGTGTCTCCGGCTGGCGGTGTTTCAGATCGGGTTGTTGACGAAGAGACCG
TTGGGTTAACGATCTGGAGGCTTCCCGGCGGTGGGTTTGCCGTCGGACGATTCTCCGGCGGGAGATTGGCCGGCGAGAGAGACCCGCCGGCCGTGTACACCGAAATGGAC
GGTGGGTTCAATGCGAACGGAGCTCCAAGAAGGGTCTCGTGGGCTTCGAGAAGAAGCAGGGGAAGAGAGAGCCGTGGAATTGGACGAACATTTCGTAATATCTTTTCCTT
CTTTGGGAGATTTAGATCGTCGAGTTCATCTACTTCCTCGCCTTCAAATGATTCTGAGTCTGTCAGTAGAAGCCATAGCCATTCGAGTTCTTCAGTCTTCAGCAGATACT
TGCGAAGGCAAAACAGAGCTTGGGTGTTGGAGAACCAGAGTGAAAATGGCCGATGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCACTGACACTGTCAATCAGTACACTAATAGAATAACGCCACGTGTCGTGCCAGTTCATTCGCGTGAGGGCGCGTGGCCACGCTCGTGTGAAACCGCGTGCCTGAT
TTTCAGATCTGAGGCGATGTCTTCCGGAACGGCGTCGTATTGGTGTTACCGCTGCAATCGTTTCGTTCGTGCTTGGGCTCAGGATTCTATTACTTGTCCTTACTGTGACG
GTGGGTTTGTTGAAGCAATTGAAAGTGAAACCGCCTCTTCTCTTCCGGCGGCCAATCTCCACCGTCGATTCTCACCGGCCGCGATCCATACTTTGGATCAAGATTCGTTT
CAGTCTCCTCGCTTGAGCACTCGACGTAGTCGTCGGAGACTTGGGGATCGATCGACTTTTAACCCTGTTGTTGTTCTACGTGGTTCTGGTGACGGCGGCGATGTGGTCGG
CGGTGGGGAGAGGAATAGCTTCGATATTTACTACGACGACGGTGCTGGGTCTGGGCTCCGGCCGGTTCCGGCGACGATGTCGGAGTTTCTGATGGGGACTGGGTTCGATC
GGTTGCTGGAACAGTTGGCTCAGCTGGAGATCAACGGGTTTGGTAGATCTGAAAATCCGCCGGCGTCGAAAGCCGCTGTGGAATCAATGCCGACGATTGAGATTTTAGAA
AGTCATGTGGATTCCGATTCGCACTGCGCCGTATGTAAAGAGGCGTTTGAAATCGGAACTGAAGCCCGAGAAATGCCCTGTAAGCACATATATCACTCCGATTGCATCAT
CCCTTGGCTTTCCATGAGAAATTCCTGTCCGGTCTGCCGACACGAGCTGCCCTCGGAACGTGTGTCTCCGGCTGGCGGTGTTTCAGATCGGGTTGTTGACGAAGAGACCG
TTGGGTTAACGATCTGGAGGCTTCCCGGCGGTGGGTTTGCCGTCGGACGATTCTCCGGCGGGAGATTGGCCGGCGAGAGAGACCCGCCGGCCGTGTACACCGAAATGGAC
GGTGGGTTCAATGCGAACGGAGCTCCAAGAAGGGTCTCGTGGGCTTCGAGAAGAAGCAGGGGAAGAGAGAGCCGTGGAATTGGACGAACATTTCGTAATATCTTTTCCTT
CTTTGGGAGATTTAGATCGTCGAGTTCATCTACTTCCTCGCCTTCAAATGATTCTGAGTCTGTCAGTAGAAGCCATAGCCATTCGAGTTCTTCAGTCTTCAGCAGATACT
TGCGAAGGCAAAACAGAGCTTGGGTGTTGGAGAACCAGAGTGAAAATGGCCGATGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVTDTVNQYTNRITPRVVPVHSREGAWPRSCETACLIFRSEAMSSGTASYWCYRCNRFVRAWAQDSITCPYCDGGFVEAIESETASSLPAANLHRRFSPAAIHTLDQDSF
QSPRLSTRRSRRRLGDRSTFNPVVVLRGSGDGGDVVGGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEILE
SHVDSDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVSDRVVDEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMD
GGFNANGAPRRVSWASRRSRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRFRSSSSSTSSPSNDSESVSRSHSHSSSSVFSRYLRRQNRAWVLENQSENGRW