; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10001880 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10001880
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationChr11:1348470..1351647
RNA-Seq ExpressionHG10001880
SyntenyHG10001880
Gene Ontology termsGO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044679.1 Ras-related protein RABD2c [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-10498.47Show/hide
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A0A0A0KUE5 Uncharacterized protein3.9e-10898.01Show/hide
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A0A1S3BWQ8 ras-related protein RABD2a-like3.9e-10898.01Show/hide
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A0A6J1CJB0 ras-related protein RABD2c-like3.0e-10898.01Show/hide
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A0A6J1FR03 ras-related protein RABD2c-like5.6e-10797.5Show/hide
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A0A6J1JJU9 ras-related protein RABD2c-like5.6e-10797.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a3.9e-9786.7Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC14.3e-9686.14Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM25.6e-9687.68Show/hide
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Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b2.5e-9686.63Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c7.8e-9887.13Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 52.8e-9886.7Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E3.8e-6357.28Show/hide
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein2.8e-8275.86Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C5.6e-9987.13Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.8e-9786.63Show/hide
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        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DL + +VVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK++TNVE+AFMAMTA IK RMASQPA   +PPTVQ++GQPVNQ+ GCC
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        SS
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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