; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10001896 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10001896
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionlate embryogenesis abundant protein At5g17165-like
Genome locationChr11:1477612..1484464
RNA-Seq ExpressionHG10001896
SyntenyHG10001896
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039291 - Late embryogenesis abundant protein At5g17165-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576842.1 Late embryogenesis abundant protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.4e-5886.92Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIW  DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN DEQVRP++VPDDVIQPQ+ADKYWAPHP+TGVFGPAT NP AAVAN  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
        A+GGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF

XP_004146886.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165 [Cucumis sativus]3.8e-5889.39Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQ-AADKYWAPHPKTGVFGPATDNPA--AAVA
        MAANSRS GAIAGLGKRITDQIWT DPLRNSVISSSAPKFRRAAHTS YDKN +EQVRP++VPDDVIQPQ AAD YWAPHP+TGVFGPA+DNPA  AA A
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQ-AADKYWAPHPKTGVFGPATDNPA--AAVA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

XP_008453829.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494437 [Cucumis melo]5.4e-5789.31Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWT-SDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAA-AVAN
        MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWT SD LRNSVISSSAPKFRRAAHTS YDKN +EQVRP++VPDDVIQPQAADKYWAPHP+TGVFGP +DNPAA A AN
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWT-SDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAA-AVAN

Query:  RAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        RAAD GNYSA EEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  RAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

XP_022984594.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Cucurbita maxima]5.8e-5988.46Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIWT DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN DEQVRP++VPDDVIQPQ+ADKYWAPHP+TGVFGPAT NP AAVAN  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
        ADGGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF

XP_038901450.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Benincasa hispida]1.3e-6193.8Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAG IAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPK RRAAHTSAYDKN DEQVRP+VVPDDVIQ QAADKYWAPHP+TGVFGPA+DNPAAA ANRA
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYE5 uncharacterized protein LOC1034944372.6e-5789.31Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWT-SDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAA-AVAN
        MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWT SD LRNSVISSSAPKFRRAAHTS YDKN +EQVRP++VPDDVIQPQAADKYWAPHP+TGVFGP +DNPAA A AN
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWT-SDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAA-AVAN

Query:  RAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        RAAD GNYSA EEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  RAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

A0A6J1CHE9 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like1.1e-5284.5Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAGAIAGLGKRIT+QIWTSDPLRNS ISSSAPKFRRAAHTS YDKN DEQ RP++VPD+VIQPQ  DKYWAPHP+TGVFGP TD+P AA A +A
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        A+GG+Y AVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

A0A6J1E3E9 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like5.9e-5785.38Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIW  DPLRNS ISS+APKFRRAAH+S YDKN DEQVRP++VPDDVIQPQ+ADKYWAP+P+TGVFGPAT NP AAVAN  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
        A+GGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF

A0A6J1FNH5 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like isoform X13.9e-5383.08Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAGAIAGLGKRIT+QIWTSD    S ISSSA KFRRAAHTSAYDKN DEQVRP++VPDDVIQPQAA+KYWAPHP TGVFGP  D P AA  +RA
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
        ADGGN++A EEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF

A0A6J1JAZ8 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like2.8e-5988.46Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIWT DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN DEQVRP++VPDDVIQPQ+ADKYWAPHP+TGVFGPAT NP AAVAN  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRA

Query:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
        ADGGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF
Subjt:  ADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4KFM8 Late embryogenesis abundant protein At5g171651.5e-2056.32Show/hide
Query:  RAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        R  HTSAYDKN++E+++P+ VPD++I+P  +DKYW+PHP+TGVFGP++ +  A    R   GG   +V EEKAWFRPTSLED +K H
Subjt:  RAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G03150.1 unknown protein6.1e-2255.68Show/hide
Query:  RRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        RR+ H+SAYDKN+++++  + VPD+VI+P  +DKYW+PHPKTGVFGP+T   +A       D    +AV EE AWFRPTSLEDS+K H
Subjt:  RRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH

AT5G17165.1 unknown protein1.0e-2156.32Show/hide
Query:  RAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        R  HTSAYDKN++E+++P+ VPD++I+P  +DKYW+PHP+TGVFGP++ +  A    R   GG   +V EEKAWFRPTSLED +K H
Subjt:  RAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCTAATTCGAGGAGCGCAGGAGCGATCGCCGGCTTGGGGAAACGAATCACTGACCAGATCTGGACCAGCGATCCACTTCGCAACTCTGTGATATCTTCCTCTGC
TCCGAAGTTCAGGAGGGCAGCTCACACCTCAGCATATGACAAGAACCTCGACGAGCAAGTTCGACCGACCGTAGTCCCTGATGATGTGATTCAGCCTCAAGCTGCTGATA
AATACTGGGCTCCTCATCCAAAAACCGGAGTTTTTGGGCCGGCCACCGACAATCCTGCTGCAGCGGTGGCCAACCGTGCAGCAGATGGTGGCAACTACTCTGCTGTGGAG
GAGGAAAAGGCTTGGTTCCGACCAACCAGTCTTGAGGATTCCGAGAAGCCCCACGGGTTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGCTAATTCGAGGAGCGCAGGAGCGATCGCCGGCTTGGGGAAACGAATCACTGACCAGATCTGGACCAGCGATCCACTTCGCAACTCTGTGATATCTTCCTCTGC
TCCGAAGTTCAGGAGGGCAGCTCACACCTCAGCATATGACAAGAACCTCGACGAGCAAGTTCGACCGACCGTAGTCCCTGATGATGTGATTCAGCCTCAAGCTGCTGATA
AATACTGGGCTCCTCATCCAAAAACCGGAGTTTTTGGGCCGGCCACCGACAATCCTGCTGCAGCGGTGGCCAACCGTGCAGCAGATGGTGGCAACTACTCTGCTGTGGAG
GAGGAAAAGGCTTGGTTCCGACCAACCAGTCTTGAGGATTCCGAGAAGCCCCACGGGTTCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWTSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSAYDKNLDEQVRPTVVPDDVIQPQAADKYWAPHPKTGVFGPATDNPAAAVANRAADGGNYSAVE
EEKAWFRPTSLEDSEKPHGF