; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10001930 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10001930
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionSuccinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial
Genome locationChr11:1788068..1790435
RNA-Seq ExpressionHG10001930
SyntenyHG10001930
Gene Ontology termsGO:0006099 - tricarboxylic acid cycle (biological process)
GO:0022904 - respiratory electron transport chain (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0045273 - respiratory chain complex II (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0051538 - 3 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0051537 - 2 iron, 2 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
GO:0008177 - succinate dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR036010 - 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily
IPR025192 - Succinate dehydogenase/fumarate reductase N-terminal
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR012675 - Beta-grasp domain superfamily
IPR009051 - Alpha-helical ferredoxin
IPR006058 - 2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site
IPR004489 - Succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulphur protein
IPR001041 - 2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044721.1 succinate dehydrogenase (ubiquinone) iron-sulfur subunit 3 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-15089.55Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLK WFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLH YRWISDSRDEF++ERLQAIAED+TKLYRCRTVKNCTA CPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS+SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

XP_004146922.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucumis sativus]1.9e-15090.28Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK--SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLS
        MLK WFRHGYNK  K RFGVLEA P+A+QHAEEAMEAH E ++ L   +N+KEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQKIKAEKDSSLS
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK--SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLS

Query:  YRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILC
        YRRSCREGICGSC MNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQS AERKKLDGLYECILC
Subjt:  YRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILC

Query:  ACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        ACCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLH YRWISDSRDEF+KERLQAIAED TKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS+SN
Subjt:  ACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

XP_008454471.1 PREDICTED: succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucumis melo]1.1e-15089.55Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLK WFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLH YRWISDSRDEF++ERLQAIAED+TKLYRCRTVKNCTA CPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS+SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

XP_008454472.1 PREDICTED: succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial-like [Cucumis melo]8.4e-15189.9Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLKSWFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLH YRWISDSRDEF+KERLQAIAEDKTKLYRCRTV+NCTANCPKSLDPSSAIH+MKAMHLI +SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

XP_038875058.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Benincasa hispida]5.2e-15391.07Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKT-----RFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDS
        MLKSWFRHGYNKVAK      +FGVLEAHP AQQHAEEAMEAH E Q+ LK +QKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLS CGPMVLD LQKIKAE+DS
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKT-----RFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDS

Query:  SLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYEC
        SLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR  EDGREFRQSRAERKKLDGLYEC
Subjt:  SLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYEC

Query:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        ILCACCS SCPPYWWNPEEFLGPAALL+ YRWISDSRDEFEKERLQAI EDKTKLYRCRTV+NCTANCPKSLDPSSAIH MKAMHLISKSN
Subjt:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BY85 Iron-sulfur subunit of complex II4.1e-15189.9Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLKSWFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLH YRWISDSRDEF+KERLQAIAEDKTKLYRCRTV+NCTANCPKSLDPSSAIH+MKAMHLI +SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

A0A1S3BZX5 Iron-sulfur subunit of complex II5.3e-15189.55Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLK WFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLH YRWISDSRDEF++ERLQAIAED+TKLYRCRTVKNCTA CPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS+SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

A0A5A7TNF4 Iron-sulfur subunit of complex II4.1e-15189.9Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLKSWFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLH YRWISDSRDEF+KERLQAIAEDKTKLYRCRTV+NCTANCPKSLDPSSAIH+MKAMHLI +SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

A0A5A7TT90 Iron-sulfur subunit of complex II9.0e-15189.55Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLK WFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLH YRWISDSRDEF++ERLQAIAED+TKLYRCRTVKNCTA CPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS+SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

A0A5D3CZM3 Iron-sulfur subunit of complex II5.3e-15189.55Show/hide
Query:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY
        MLK WFRH YNKV+K RFGVLE HP+A+QHAEEAMEAH E ++ L+ +NQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFF+DLS CGPMVLDALQ IKAEKDSSLSY
Subjt:  MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLK-SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS E GREFRQ+ AERKKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN
        CCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLH YRWISDSRDEF++ERLQAIAED+TKLYRCRTVKNCTA CPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS+SN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6H4G3 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial6.5e-9859.17Show/hide
Query:  AKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNK-----------------LKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSS
        A   F  L  HP A+ +A +A E       K                   S  KEF++YRW+P  P+ +P L S+ VDL+ CGPMVLD LQKIKAE D++
Subjt:  AKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNK-----------------LKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSS

Query:  LSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTE-DGREFRQSRAERKKLDGLYEC
        L++RRSCREGICGSC+M IDG NTVACL+P+D DTS  T +TPLPHM+V++DLVVDLT+FYQQYKS+EPWLK +  T+ +  E  QS  ERK+LDGLYEC
Subjt:  LSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTE-DGREFRQSRAERKKLDGLYEC

Query:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISK
        ILCACCSA+CP YWWN E FLGPAALLH YRW+SDSRDE+  ER+QA+AE   KLYRCR +K+CTA CPKSLDP++AI  MK +H + K
Subjt:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISK

Q8LB02 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial2.0e-8666.67Show/hide
Query:  KEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDL
        K F+IYRWNP  P  KP L  + +DL +CGPMVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I++  SK T ITPLPHMFVIKDL
Subjt:  KEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDL

Query:  VVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT
        VVD+TNFY QYKSIEPWLK +  ++  G+E  QS+ +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLH  RWISDSRDE+ KERL+AI +D+ 
Subjt:  VVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT

Query:  KLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM
        KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  KLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM

Q8LBZ7 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial5.7e-8665.81Show/hide
Query:  SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F+IYRWNP  P  KP L ++ +DL +CGPMVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  D +  T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAE
        KDLVVD+TNFY QYKSIEPWLK +  ++   +E  QS+ +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLH  RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAE

Query:  DKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM
        D+ KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM

Q9FJP9 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial6.5e-11472.12Show/hide
Query:  FGVLEAHPVAQQHAEEAMEAH---VETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMN
        F +L  H  AQ  +++ +++     E + + K  +KEFKIYRWNP  PN KPFL SFFVDLS+CGPMVLD LQKIKAE D+SLSYRRSCREGICGSC+MN
Subjt:  FGVLEAHPVAQQHAEEAMEAH---VETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMN

Query:  IDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE
        IDG NTVACLKPI+ +TSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKS+EPWLKTR+  +DGRE RQS  +RKKLDGLYECILCACC+ SCP YWWNPEE
Subjt:  IDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE

Query:  FLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS
        F GPAALL  YRWISDSRDE+ +ERLQAI E +TK+YRCR +KNCTA CPK L+P+SAI  MK+ HL+S
Subjt:  FLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS

Q9S827 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial5.2e-8764.17Show/hide
Query:  NKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPH
        +K  +N K F IYRW+P  P+ KP L  + VDLS+CGPMVLD L KIK E+D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I + +S  T I+PLPH
Subjt:  NKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPH

Query:  MFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS-TEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQ
        MFVIKDLVVD+TNFY QYKS+EPWLK + +  + G+E  Q++A+R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPEE+LGPAALLH  RWI DSRD+F KERL 
Subjt:  MFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRS-TEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQ

Query:  AIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHL
        +I  D+ KLYRC T+KNCT  CPK L+P+  I  +K + L
Subjt:  AIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27380.1 succinate dehydrogenase 2-14.1e-8765.81Show/hide
Query:  SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F+IYRWNP  P  KP L ++ +DL +CGPMVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  D +  T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAE
        KDLVVD+TNFY QYKSIEPWLK +  ++   +E  QS+ +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLH  RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAE

Query:  DKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM
        D+ KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM

AT3G27380.2 succinate dehydrogenase 2-14.1e-8765.81Show/hide
Query:  SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F+IYRWNP  P  KP L ++ +DL +CGPMVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  D +  T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAE
        KDLVVD+TNFY QYKSIEPWLK +  ++   +E  QS+ +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLH  RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAE

Query:  DKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM
        D+ KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM

AT5G40650.1 succinate dehydrogenase 2-21.4e-8766.67Show/hide
Query:  KEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDL
        K F+IYRWNP  P  KP L  + +DL +CGPMVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I++  SK T ITPLPHMFVIKDL
Subjt:  KEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDL

Query:  VVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT
        VVD+TNFY QYKSIEPWLK +  ++  G+E  QS+ +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLH  RWISDSRDE+ KERL+AI +D+ 
Subjt:  VVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRR-STEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT

Query:  KLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM
        KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  KLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAM

AT5G65165.1 succinate dehydrogenase 2-34.6e-11572.12Show/hide
Query:  FGVLEAHPVAQQHAEEAMEAH---VETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMN
        F +L  H  AQ  +++ +++     E + + K  +KEFKIYRWNP  PN KPFL SFFVDLS+CGPMVLD LQKIKAE D+SLSYRRSCREGICGSC+MN
Subjt:  FGVLEAHPVAQQHAEEAMEAH---VETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGSCAMN

Query:  IDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE
        IDG NTVACLKPI+ +TSKPTIITPLPHM+VIKDLVVDLTNFYQQYKS+EPWLKTR+  +DGRE RQS  +RKKLDGLYECILCACC+ SCP YWWNPEE
Subjt:  IDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE

Query:  FLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS
        F GPAALL  YRWISDSRDE+ +ERLQAI E +TK+YRCR +KNCTA CPK L+P+SAI  MK+ HL+S
Subjt:  FLGPAALLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLIS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTAAAAAGCTGGTTCCGCCATGGCTACAACAAGGTGGCTAAGACGAGGTTTGGAGTATTAGAAGCCCATCCTGTGGCTCAGCAACATGCAGAAGAAGCCATGGAAGC
TCATGTTGAAACACAGAATAAGCTTAAATCCAATCAAAAGGAGTTCAAAATATATAGGTGGAATCCTCAATATCCCAACCACAAGCCTTTCCTTCACTCTTTCTTTGTTG
ATCTCTCTAATTGTGGTCCTATGGTTTTAGATGCATTGCAGAAGATAAAAGCAGAGAAAGACTCAAGTTTGAGTTATAGAAGGTCTTGTAGGGAAGGAATATGTGGATCA
TGTGCCATGAACATTGATGGAGCTAACACAGTGGCCTGTCTCAAACCTATTGATGCTGACACTTCCAAACCCACCATTATAACTCCTCTTCCCCACATGTTTGTCATCAA
AGATCTTGTTGTTGATCTCACCAACTTCTACCAACAATACAAGTCGATCGAGCCATGGCTGAAGACTAGAAGGTCGACAGAGGATGGGCGAGAGTTCAGGCAATCTCGGG
CGGAGAGGAAGAAGCTAGATGGGTTGTATGAGTGTATTCTTTGTGCTTGTTGCAGTGCTTCATGTCCTCCATATTGGTGGAATCCAGAAGAGTTTCTTGGTCCTGCTGCA
TTGCTCCATGTCTATCGATGGATCTCTGATAGTCGAGATGAGTTCGAGAAGGAACGATTGCAAGCAATAGCGGAAGACAAGACGAAGCTTTATAGATGTAGAACTGTAAA
GAACTGCACAGCCAACTGCCCCAAAAGCCTCGATCCTTCCTCTGCAATTCACCACATGAAGGCAATGCATTTGATCTCCAAGTCCAACAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTAAAAAGCTGGTTCCGCCATGGCTACAACAAGGTGGCTAAGACGAGGTTTGGAGTATTAGAAGCCCATCCTGTGGCTCAGCAACATGCAGAAGAAGCCATGGAAGC
TCATGTTGAAACACAGAATAAGCTTAAATCCAATCAAAAGGAGTTCAAAATATATAGGTGGAATCCTCAATATCCCAACCACAAGCCTTTCCTTCACTCTTTCTTTGTTG
ATCTCTCTAATTGTGGTCCTATGGTTTTAGATGCATTGCAGAAGATAAAAGCAGAGAAAGACTCAAGTTTGAGTTATAGAAGGTCTTGTAGGGAAGGAATATGTGGATCA
TGTGCCATGAACATTGATGGAGCTAACACAGTGGCCTGTCTCAAACCTATTGATGCTGACACTTCCAAACCCACCATTATAACTCCTCTTCCCCACATGTTTGTCATCAA
AGATCTTGTTGTTGATCTCACCAACTTCTACCAACAATACAAGTCGATCGAGCCATGGCTGAAGACTAGAAGGTCGACAGAGGATGGGCGAGAGTTCAGGCAATCTCGGG
CGGAGAGGAAGAAGCTAGATGGGTTGTATGAGTGTATTCTTTGTGCTTGTTGCAGTGCTTCATGTCCTCCATATTGGTGGAATCCAGAAGAGTTTCTTGGTCCTGCTGCA
TTGCTCCATGTCTATCGATGGATCTCTGATAGTCGAGATGAGTTCGAGAAGGAACGATTGCAAGCAATAGCGGAAGACAAGACGAAGCTTTATAGATGTAGAACTGTAAA
GAACTGCACAGCCAACTGCCCCAAAAGCCTCGATCCTTCCTCTGCAATTCACCACATGAAGGCAATGCATTTGATCTCCAAGTCCAACAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKSWFRHGYNKVAKTRFGVLEAHPVAQQHAEEAMEAHVETQNKLKSNQKEFKIYRWNPQYPNHKPFLHSFFVDLSNCGPMVLDALQKIKAEKDSSLSYRRSCREGICGS
CAMNIDGANTVACLKPIDADTSKPTIITPLPHMFVIKDLVVDLTNFYQQYKSIEPWLKTRRSTEDGREFRQSRAERKKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAA
LLHVYRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVKNCTANCPKSLDPSSAIHHMKAMHLISKSNN