; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10001993 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10001993
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionprotein RTE1-HOMOLOG
Genome locationChr11:2460932..2461767
RNA-Seq ExpressionHG10001993
SyntenyHG10001993
Gene Ontology termsGO:0010104 - regulation of ethylene-activated signaling pathway (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008496 - TMEM222/RTE1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004146489.1 protein RTE1-HOMOLOG isoform X2 [Cucumis sativus]1.1e-12196.46Show/hide
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XP_031740651.1 protein RTE1-HOMOLOG isoform X1 [Cucumis sativus]1.1e-12196.46Show/hide
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XP_038884143.1 protein RTE1-HOMOLOG [Benincasa hispida]2.1e-12095.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXZ7 Uncharacterized protein5.3e-12296.46Show/hide
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A0A1S4DZL7 protein RTE1-HOMOLOG1.7e-12095.58Show/hide
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A0A5D3CZH3 Protein RTE1-HOMOLOG1.1e-11495.81Show/hide
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A0A6J1C4G0 protein RTE1-HOMOLOG8.5e-12093.81Show/hide
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A0A6J1FW19 protein RTE1-HOMOLOG-like2.4e-11489.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4ITL6 Protein REVERSION-TO-ETHYLENE SENSITIVITY12.3e-5853.33Show/hide
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        + TY FKN++
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Q8BVA2 Transmembrane protein 2221.2e-3039.53Show/hide
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Q9H0R3 Transmembrane protein 2224.2e-3140.12Show/hide
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        +D ER+RFP C+VWTP+PV++W  P IGH+GI    GVI DFAGP FV  DN  FG  A+Y +++  +   S                 + WD A+  ++
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        +E++HR +NL   NCHS VA  LN + +     WN+V L     L G++VS GA ++T+LPF+++  I L +
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Q9SD42 Protein RTE1-HOMOLOG5.0e-7760.85Show/hide
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                 E  E  H +E  TWDDALR+STQE+QH SYN+LTCNCHSFVANNLNRL  ++GGWNVVNLATL+  KGRWV+K A++++ LP ++V++IG+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G26070.1 Protein of unknown function (DUF778)1.7e-5953.33Show/hide
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        +ID ++++FPCCIVWTPLPV+SWL PFIGHIG+ REDGVILDFAG NF+ VD+F FG  ARYLQ++  KCC+      H  +   +  D      TWD+A
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        + TY FKN++
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AT3G51040.1 RTE1-homolog3.6e-7860.85Show/hide
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         LGG TF+   +     L GWFI+GTY FK L+QL
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AT3G51040.2 RTE1-homolog3.6e-7860.85Show/hide
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        E++ D E+++MI   ++  MKIDP+R RFPCCIVWTPLP ISWL+PFIGH+GI REDGVILDFAGPNFVCVDNF FGAV+RY+QIN +   + S RS   
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                 E  E  H +E  TWDDALR+STQE+QH SYN+LTCNCHSFVANNLNRL  ++GGWNVVNLATL+  KGRWV+K A++++ LP ++V++IG+
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AT3G51040.3 RTE1-homolog3.6e-7860.85Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCAAGTAAGGACCCTGAGAATCAGCTCATGATTGAAGGAACTATCGCTCAGAATATGAAGATTGATCCGGAGAGAGCTCGGTTTCCATGTTGCATTGTGTGGAC
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