; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10002098 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10002098
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionDNA-binding protein BIN4
Genome locationChr11:3349740..3356161
RNA-Seq ExpressionHG10002098
SyntenyHG10002098
Gene Ontology termsGO:0042023 - DNA endoreduplication (biological process)
GO:0009330 - DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR033246 - DNA-binding protein BIN4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK02024.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-16385.68Show/hide
Query:  APTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSE
        APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKE  L+  TG+ENS+HSVWMLSSDSESC DNNFIKE+ +HHEELSE
Subjt:  APTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSE

Query:  LATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLV
        LATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVS + SPKK++KSQVCTS KEK INS+TNKGGL LEGSE +VRN G+ EI+EKDALDDC  PPVSSSRLPLV
Subjt:  LATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLV

Query:  LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT
        LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGT+YRA IVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT
Subjt:  LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT

Query:  LDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        LDGFSFDSEDEAEKI+KVASSP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK+GG+LQAPKKTRKKVQ SKTKN KSKK
Subjt:  LDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

XP_004147326.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Cucumis sativus]3.2e-16283.55Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +  APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEV L+ HTG+ENSKHSVWMLS DSESC DNNFI
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KE+YS+HEEL+ELATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVSN+ SPKK+VKS+VCTS KE  +NS TNKGG  +EGSE +VRN GDVEI+EKDALDDC 
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS
        GPPVSSSRLPLVLSDK HRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGT+YRA IVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALS
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS

Query:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        KVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKI+K A+SP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVKTGG+LQAPKKTRKKVQ SKTKN KSKK
Subjt:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

XP_008460815.1 PREDICTED: DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Cucumis melo]8.3e-16383.8Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +  APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKE  L+  TG+ENS+HSVWMLSSDSESC DNNFI
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KE+ +HHEELSELATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVS + SPKK++KSQVCTS KEK INS+TNKGGL LEGSE +VRN G+ EI+EKDALDDC 
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS
         PPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGT+YRA IVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALS
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS

Query:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKI+KVASSP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK+GG+LQAPKKTRKKVQ SKTKN KSKK
Subjt:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

XP_038894608.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida]3.7e-17184.94Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +  AP GVALSSNSESSKN SSSMDNA+D+KGPSS+KTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEV  EEHT +ENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KENYSHHEELSE ATSQFQGRG+DENAG RFTEGKSKS KVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEK INSETNKGGLMLEGSE YVRNG DV+IIEKDALD CN
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI------------------------
        GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSS KNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI                        
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI------------------------

Query:  -IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKN
         IESIMNDFIQLKALSKVDEAETM+EGTLDGFSFDSEDEAEKI KV SSPTDQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK GGKLQAPKKTRKKVQ SKTK+
Subjt:  -IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKN

Query:  TKSKK
        TKSKK
Subjt:  TKSKK

XP_038894663.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Benincasa hispida]5.2e-17388.43Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +  AP GVALSSNSESSKN SSSMDNA+D+KGPSS+KTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEV  EEHT +ENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KENYSHHEELSE ATSQFQGRG+DENAG RFTEGKSKS KVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEK INSETNKGGLMLEGSE YVRNG DV+IIEKDALD CN
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS
        GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSS KNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALS
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS

Query:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        KVDEAETM+EGTLDGFSFDSEDEAEKI KV SSPTDQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK GGKLQAPKKTRKKVQ SKTK+TKSKK
Subjt:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJZ5 Uncharacterized protein2.7e-15985.52Show/hide
Query:  APTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSE
        APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEV L+ HTG+ENSKHSVWMLS DSESC DNNFIKE+YS+HEEL+E
Subjt:  APTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSE

Query:  LATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLV
        LATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVSN+ SPKK+VKS+VCTS KE  +NS TNKGG  +EGSE +VRN GDVEI+EKDALDDC GPPVSSSRLPLV
Subjt:  LATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLV

Query:  LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT
        LSDK HRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGT+YRA IVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT
Subjt:  LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT

Query:  LDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQ
        LDGFSFDSED+AEKI+K A+SP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVKTGG+LQAPKKTRKKVQ
Subjt:  LDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQ

A0A1S3CDA8 DNA-binding protein BIN4 isoform X24.0e-16383.8Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +  APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKE  L+  TG+ENS+HSVWMLSSDSESC DNNFI
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KE+ +HHEELSELATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVS + SPKK++KSQVCTS KEK INS+TNKGGL LEGSE +VRN G+ EI+EKDALDDC 
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS
         PPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGT+YRA IVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALS
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALS

Query:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKI+KVASSP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK+GG+LQAPKKTRKKVQ SKTKN KSKK
Subjt:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

A0A1S3CDB0 DNA-binding protein BIN4 isoform X14.2e-16080.69Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +  APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKE  L+  TG+ENS+HSVWMLSSDSESC DNNFI
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KE+ +HHEELSELATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVS + SPKK++KSQVCTS KEK INS+TNKGGL LEGSE +VRN G+ EI+EKDALDDC 
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLK---------------GTIYRAAIVPSRTFCI---------
         PPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLK               GT+YRA IVPSRTFCI         
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLK---------------GTIYRAAIVPSRTFCI---------

Query:  IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNT
        IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKI+KVASSP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK+GG+LQAPKKTRKKVQ SKTKN 
Subjt:  IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNT

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

A0A5D3BS94 DNA-binding protein BIN4 isoform X22.4e-16385.68Show/hide
Query:  APTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSE
        APTGVALSSNS SSKNGSSSMDNAID++ PSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKE  L+  TG+ENS+HSVWMLSSDSESC DNNFIKE+ +HHEELSE
Subjt:  APTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSE

Query:  LATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLV
        LATS+ QGR KDENAGRRFTEGKSKSRKVS + SPKK++KSQVCTS KEK INS+TNKGGL LEGSE +VRN G+ EI+EKDALDDC  PPVSSSRLPLV
Subjt:  LATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLV

Query:  LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT
        LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGT+YRA IVPSRTFCI         IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT
Subjt:  LSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGT

Query:  LDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        LDGFSFDSEDEAEKI+KVASSP DQNEPVEGL TKSKNK EKSSGRKRVK+GG+LQAPKKTRKKVQ SKTKN KSKK
Subjt:  LDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

A0A6J1CI66 DNA-binding protein BIN4 isoform X17.1e-15279.69Show/hide
Query:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI
        R QS     +   PTGVALSSNSESS N SS MDNAID+K  SSHKTTQDLDGDQIQGD G+HNL KE+ LEEH G+ +SKHSVWMLSSDSE C DN+ I
Subjt:  RFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFI

Query:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN
        KE+YSHHEEL E  TSQF GR KDEN  R FT+GKSKSRKVS+KKSPKK+VKSQV T  KEK IN  TNK G +LEGSEC VRNGGDVEII KDALDDCN
Subjt:  KENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCN

Query:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCII---------ESIMNDFIQLKALS
        GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGD+GAVGRVVVSDSS AKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI+         E IMNDFIQLKA S
Subjt:  GPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCII---------ESIMNDFIQLKALS

Query:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
         +DEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKI+KV+SSPTDQNE VEGL  KSKNK EKSSGRKRV+TGGKLQAPKK RKKVQ  KTKN KSKK
Subjt:  KVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FLU1 DNA-binding protein BIN41.5e-3738.46Show/hide
Query:  DQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--
        D   G    +N+  E    +H   +    SVW++SSDSE S P           D +F+ E             E+  +  +   +   K+ N+ +    
Subjt:  DQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--

Query:  TEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTS
        TE K     ++ + +P+K  K++   S   +    E N    +L+  +       D  I E+   D    P   SSSRLPLVLS+KV+R K LVECEG S
Subjt:  TEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTS

Query:  IDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKV
        IDLSGDMGAVGRVVVSD++    ++ LDLKGTIY++ I+PSRTFC+         IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+DE+ K +K 
Subjt:  IDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKV

Query:  ASSPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        A  P DQ+   E         K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ASSPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G24630.1 double-stranded DNA binding3.0e-3838.38Show/hide
Query:  GNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--TEGKSKS
        GN+   ++++ +     +    SVW++SSDSE S P           D +F+ E             E+  +  +   +   K+ N+ +    TE K   
Subjt:  GNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--TEGKSKS

Query:  RKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDM
          ++ + +P+K  K++   S   +    E N    +L+  +       D  I E+   D    P   SSSRLPLVLS+KV+R K LVECEG SIDLSGDM
Subjt:  RKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDM

Query:  GAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQ
        GAVGRVVVSD++    ++ LDLKGTIY++ I+PSRTFC+         IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+DE+ K +K A  P DQ
Subjt:  GAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQ

Query:  NEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        +   E         K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  NEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

AT5G24630.2 double-stranded DNA binding1.6e-3939.26Show/hide
Query:  IQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCPDNNFIKENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKS-KSRKVSNKKSPKKQVKS
        ++G    +N+  E    +H   +    SVW++SSDSE S P    +  +     +    AT       ++E A +   + KS K++  S++K+PK+   +
Subjt:  IQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCPDNNFIKENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKS-KSRKVSNKKSPKKQVKS

Query:  QVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGG-------DVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVV
        Q     ++K  ++   +     +G++ ++ +         D  I E+   D    P   SSSRLPLVLS+KV+R K LVECEG SIDLSGDMGAVGRVVV
Subjt:  QVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGG-------DVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVV

Query:  SDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVE---
        SD++    ++ LDLKGTIY++ I+PSRTFC+         IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+DE+ K +K A  P DQ+   E   
Subjt:  SDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVE---

Query:  --GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
              K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  --GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

AT5G24630.3 double-stranded DNA binding6.1e-3938.4Show/hide
Query:  IQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--TE
        ++G    +N+  E    +H   +    SVW++SSDSE S P           D +F+ E             E+  +  +   +   K+ N+ +    TE
Subjt:  IQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--TE

Query:  GKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSID
         K     ++ + +P+K  K++   S   +    E N    +L+  +       D  I E+   D    P   SSSRLPLVLS+KV+R K LVECEG SID
Subjt:  GKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSID

Query:  LSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVAS
        LSGDMGAVGRVVVSD++    ++ LDLKGTIY++ I+PSRTFC+         IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+DE+ K +K A 
Subjt:  LSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVAS

Query:  SPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
         P DQ+   E         K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  SPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

AT5G24630.4 double-stranded DNA binding6.1e-3938.4Show/hide
Query:  IQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--TE
        ++G    +N+  E    +H   +    SVW++SSDSE S P           D +F+ E             E+  +  +   +   K+ N+ +    TE
Subjt:  IQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--TE

Query:  GKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSID
         K     ++ + +P+K  K++   S   +    E N    +L+  +       D  I E+   D    P   SSSRLPLVLS+KV+R K LVECEG SID
Subjt:  GKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSID

Query:  LSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVAS
        LSGDMGAVGRVVVSD++    ++ LDLKGTIY++ I+PSRTFC+         IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+DE+ K +K A 
Subjt:  LSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVAS

Query:  SPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
         P DQ+   E         K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  SPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK

AT5G24630.6 double-stranded DNA binding1.0e-3838.46Show/hide
Query:  DQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--
        D   G    +N+  E    +H   +    SVW++SSDSE S P           D +F+ E             E+  +  +   +   K+ N+ +    
Subjt:  DQIQGDCGNHNLAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSE-SCP-----------DNNFIKENYSHH--------EELSELATSQFQGRGKDENAGRRF--

Query:  TEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTS
        TE K     ++ + +P+K  K++   S   +    E N    +L+  +       D  I E+   D    P   SSSRLPLVLS+KV+R K LVECEG S
Subjt:  TEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLMLEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPV-SSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTS

Query:  IDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKV
        IDLSGDMGAVGRVVVSD++    ++ LDLKGTIY++ I+PSRTFC+         IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+DE+ K +K 
Subjt:  IDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCI---------IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKV

Query:  ASSPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK
        A  P DQ+   E         K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ASSPTDQNEPVE-----GLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCCACACCCCACGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACTTCTTCCCTCCTTCAGTCTTCAAATCGAGTCTTCAGTTGACGTAGTAGCAGTTCACGCCATTTTCTTATT
CTTCACCTTTACACCACTTTTTCCCTTCAGATTTCAGTCCAGTTCACCGACAACTACTTCTAGTGCACCAACTGGTGTTGCTCTATCCTCTAATTCTGAATCTTCAAAGA
ATGGTAGCTCATCAATGGACAATGCAATTGATGAAAAGGGTCCATCATCACATAAAACCACACAGGATTTAGATGGAGATCAGATTCAAGGGGATTGTGGCAACCATAAT
TTGGCGAAGGAAGTGACACTTGAGGAACATACAGGCAATGAAAACTCAAAGCACTCTGTTTGGATGCTATCATCGGATTCAGAGTCATGTCCTGATAATAATTTTATAAA
GGAGAATTACAGTCATCATGAAGAATTATCTGAACTTGCAACATCTCAGTTCCAAGGGAGAGGGAAGGATGAAAATGCAGGTCGCAGATTCACTGAGGGAAAATCTAAAT
CAAGGAAAGTATCAAATAAAAAGTCTCCAAAAAAACAGGTCAAATCACAAGTTTGCACTTCAGTAAAAGAGAAGACAATCAATTCTGAAACAAATAAAGGTGGTCTTATG
TTGGAAGGATCTGAATGCTATGTAAGAAATGGTGGAGATGTGGAGATTATAGAAAAAGATGCATTGGATGACTGCAACGGACCTCCTGTTTCCTCCTCAAGGTTGCCATT
GGTGTTGTCTGACAAAGTCCACCGGTTGAAGGCACTTGTTGAGTGTGAAGGAACTTCAATAGATTTGAGCGGTGACATGGGTGCTGTAGGGCGGGTTGTAGTTTCAGATT
CCTCATCTGCAAAAAATGAACTTTGCCTAGATCTGAAAGGTACAATTTACAGAGCGGCAATAGTTCCTTCAAGGACATTTTGCATCATAGAATCTATCATGAACGACTTC
ATACAGTTGAAGGCACTGTCCAAAGTTGATGAGGCTGAAACTATGGTTGAAGGAACATTAGATGGCTTCTCATTTGATTCTGAAGACGAGGCTGAGAAAATATCTAAAGT
TGCTTCTTCTCCAACTGACCAAAATGAGCCTGTAGAAGGGCTCTACACAAAATCCAAAAACAAAACCGAGAAATCATCAGGGCGGAAGCGTGTTAAAACTGGAGGAAAGC
TGCAGGCACCGAAGAAAACAAGGAAGAAAGTTCAAGCTTCTAAGACTAAAAATACAAAGAGCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCCCACACCCCACGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACTTCTTCCCTCCTTCAGTCTTCAAATCGAGTCTTCAGTTGACGTAGTAGCAGTTCACGCCATTTTCTTATT
CTTCACCTTTACACCACTTTTTCCCTTCAGATTTCAGTCCAGTTCACCGACAACTACTTCTAGTGCACCAACTGGTGTTGCTCTATCCTCTAATTCTGAATCTTCAAAGA
ATGGTAGCTCATCAATGGACAATGCAATTGATGAAAAGGGTCCATCATCACATAAAACCACACAGGATTTAGATGGAGATCAGATTCAAGGGGATTGTGGCAACCATAAT
TTGGCGAAGGAAGTGACACTTGAGGAACATACAGGCAATGAAAACTCAAAGCACTCTGTTTGGATGCTATCATCGGATTCAGAGTCATGTCCTGATAATAATTTTATAAA
GGAGAATTACAGTCATCATGAAGAATTATCTGAACTTGCAACATCTCAGTTCCAAGGGAGAGGGAAGGATGAAAATGCAGGTCGCAGATTCACTGAGGGAAAATCTAAAT
CAAGGAAAGTATCAAATAAAAAGTCTCCAAAAAAACAGGTCAAATCACAAGTTTGCACTTCAGTAAAAGAGAAGACAATCAATTCTGAAACAAATAAAGGTGGTCTTATG
TTGGAAGGATCTGAATGCTATGTAAGAAATGGTGGAGATGTGGAGATTATAGAAAAAGATGCATTGGATGACTGCAACGGACCTCCTGTTTCCTCCTCAAGGTTGCCATT
GGTGTTGTCTGACAAAGTCCACCGGTTGAAGGCACTTGTTGAGTGTGAAGGAACTTCAATAGATTTGAGCGGTGACATGGGTGCTGTAGGGCGGGTTGTAGTTTCAGATT
CCTCATCTGCAAAAAATGAACTTTGCCTAGATCTGAAAGGTACAATTTACAGAGCGGCAATAGTTCCTTCAAGGACATTTTGCATCATAGAATCTATCATGAACGACTTC
ATACAGTTGAAGGCACTGTCCAAAGTTGATGAGGCTGAAACTATGGTTGAAGGAACATTAGATGGCTTCTCATTTGATTCTGAAGACGAGGCTGAGAAAATATCTAAAGT
TGCTTCTTCTCCAACTGACCAAAATGAGCCTGTAGAAGGGCTCTACACAAAATCCAAAAACAAAACCGAGAAATCATCAGGGCGGAAGCGTGTTAAAACTGGAGGAAAGC
TGCAGGCACCGAAGAAAACAAGGAAGAAAGTTCAAGCTTCTAAGACTAAAAATACAAAGAGCAAGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPHTPRQQQQQQQLLPSFSLQIESSVDVVAVHAIFLFFTFTPLFPFRFQSSSPTTTSSAPTGVALSSNSESSKNGSSSMDNAIDEKGPSSHKTTQDLDGDQIQGDCGNHN
LAKEVTLEEHTGNENSKHSVWMLSSDSESCPDNNFIKENYSHHEELSELATSQFQGRGKDENAGRRFTEGKSKSRKVSNKKSPKKQVKSQVCTSVKEKTINSETNKGGLM
LEGSECYVRNGGDVEIIEKDALDDCNGPPVSSSRLPLVLSDKVHRLKALVECEGTSIDLSGDMGAVGRVVVSDSSSAKNELCLDLKGTIYRAAIVPSRTFCIIESIMNDF
IQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDEAEKISKVASSPTDQNEPVEGLYTKSKNKTEKSSGRKRVKTGGKLQAPKKTRKKVQASKTKNTKSKK