; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10002498 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10002498
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionLong chain acyl-CoA synthetase 4-like protein
Genome locationChr11:7421439..7422080
RNA-Seq ExpressionHG10002498
SyntenyHG10002498
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044898.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein isoform 2 [Cucumis melo var. makuwa]8.9e-5497.48Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

KAE8649209.1 hypothetical protein Csa_014401 [Cucumis sativus]3.4e-5396.64Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQF LATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

XP_004148996.1 uncharacterized protein LOC101210049 [Cucumis sativus]3.4e-5396.64Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQF LATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

XP_008451954.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493102 [Cucumis melo]8.9e-5497.48Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

XP_022941746.1 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X2 [Cucurbita moschata]9.2e-5192.44Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+R+S+RQ ALA RRSNFQGNQFALATEVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAFNRR PNW KTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUX2 Uncharacterized protein1.6e-5396.64Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQF LATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A1S3BTH9 uncharacterized protein LOC1034931024.3e-5497.48Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A5A7TPS5 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein isoform 24.3e-5497.48Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A5D3CYD8 Uncharacterized protein4.3e-5497.48Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSS+RQ ALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A6J1FPB6 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X14.4e-5192.44Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+R+S+RQ ALA RRSNFQGNQFALATEVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAFNRR PNW KTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G10970.1 unknown protein6.0e-2458.33Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR L NK +KF + A ++   K QR+MDSRS +RQ A A +RSNFQGNQF + T VARKAA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY
          R R +N  R  N N++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.2 unknown protein6.0e-2458.33Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR L NK +KF + A ++   K QR+MDSRS +RQ A A +RSNFQGNQF + T VARKAA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY
          R R +N  R  N N++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.3 unknown protein6.0e-2458.33Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR L NK +KF + A ++   K QR+MDSRS +RQ A A +RSNFQGNQF + T VARKAA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY
          R R +N  R  N N++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.4 unknown protein6.0e-2458.33Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR L NK +KF + A ++   K QR+MDSRS +RQ A A +RSNFQGNQF + T VARKAA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY
          R R +N  R  N N++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.5 unknown protein1.2e-1655.66Show/hide
Query:  MDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVAPIRPRAFN-RRAPN
        MDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR L NK +KF + A ++   K QR+MDSRS +RQ A A +RSNFQGNQF + T VARKAA A  R R +N  R  N
Subjt:  MDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVAPIRPRAFN-RRAPN

Query:  WNKTRY
         N++ +
Subjt:  WNKTRY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCTAAACCACTTACTACCGAAGCAATTGCCATAACTGAGAAGAAGATGGACATGGCTTTAGACGACATTATTAAAATGTCCAAAAATACGGGAAATAAAGGCAG
GAAGCAAAGAAGGTTACCGAACAAAATGCAGAAATTTCCAAATAATGCTACTCAAGATAGACCTAGAAAGTTGCAGCGTTTCATGGACTCTAGATCCTCTATGAGACAGG
CGGCTTTGGCCAACAGAAGGTCGAACTTTCAAGGGAATCAGTTTGCTTTGGCGACTGAGGTTGCAAGAAAGGCTGCTGTTGCTCCAATTCGCCCTAGAGCTTTTAATCGT
AGGGCACCCAATTGGAATAAAACAAGGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCTAAACCACTTACTACCGAAGCAATTGCCATAACTGAGAAGAAGATGGACATGGCTTTAGACGACATTATTAAAATGTCCAAAAATACGGGAAATAAAGGCAG
GAAGCAAAGAAGGTTACCGAACAAAATGCAGAAATTTCCAAATAATGCTACTCAAGATAGACCTAGAAAGTTGCAGCGTTTCATGGACTCTAGATCCTCTATGAGACAGG
CGGCTTTGGCCAACAGAAGGTCGAACTTTCAAGGGAATCAGTTTGCTTTGGCGACTGAGGTTGCAAGAAAGGCTGCTGTTGCTCCAATTCGCCCTAGAGCTTTTAATCGT
AGGGCACCCAATTGGAATAAAACAAGGTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRLPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDSRSSMRQAALANRRSNFQGNQFALATEVARKAAVAPIRPRAFNR
RAPNWNKTRY