; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10002968 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10002968
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionprotein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic
Genome locationChr11:15916482..15918628
RNA-Seq ExpressionHG10002968
SyntenyHG10002968
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR018962 - Domain of unknown function DUF1995
IPR044687 - Protein LOW PSII ACCUMULATION 3


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052999.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 3 [Cucumis melo var. makuwa]4.6e-10779.93Show/hide
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KAG7015785.1 hypothetical protein SDJN02_23423, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.5e-10586.15Show/hide
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XP_038877168.1 uncharacterized protein LOC120069467 isoform X3 [Benincasa hispida]9.2e-10882.63Show/hide
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XP_038877169.1 uncharacterized protein LOC120069467 isoform X4 [Benincasa hispida]1.5e-11081.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L151 DUF1995 domain-containing protein4.8e-9478.54Show/hide
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A0A1S3BK29 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic isoform X11.3e-9476.36Show/hide
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A0A1S3BKQ4 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic isoform X26.7e-9679.76Show/hide
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A0A5D3CIQ2 Protein LOW PSII ACCUMULATION 32.2e-10779.93Show/hide
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A0A6J1CWN5 uncharacterized protein LOC111014905 isoform X22.2e-9175.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G48790.1 Domain of unknown function (DUF1995)1.8e-5662.31Show/hide
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        K  RNL+  A S S   ++N S D +VPFPRDY +L+NQAK+A E AL+D KQLMEIEFPT+GL SV                                 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EEWFWDPLLKR