; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10003821 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10003821
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic
Genome locationChr08:9773540..9774325
RNA-Seq ExpressionHG10003821
SyntenyHG10003821
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140886.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis sativus]6.1e-11687.79Show/hide
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XP_022992337.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]2.7e-10882.58Show/hide
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XP_038884158.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Benincasa hispida]2.6e-12292.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein2.9e-11687.79Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic2.2e-11989.66Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein2.2e-11989.66Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like2.0e-10983.52Show/hide
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like1.3e-10882.58Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf533.5e-2134.51Show/hide
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           +  +P EF+W +    P GHLPL N LRG  ++  I  +
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P51202 Uncharacterized protein ycf532.6e-2136.18Show/hide
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        ++  + + +L  LL   +   AD+ T++ LI LAG   + R ++YF++++ I  +DL+ ID LW  HS GKFG+ VQ++I+  + K++ + + K+GW   
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           E+ +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG Q+++ + SH A++
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P72583 Ycf53-like protein1.7e-2338.56Show/hide
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        ++  I +  L   L ++DF  ADE TR  L  LAG GA +R ++YF+EV+   + DL  I+ LW  HS+G FG+SVQ+R++    K+FTKL+ K+GW   
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                 +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG ++  ++  HP + +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf532.0e-2439.47Show/hide
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        ++  +++ +L  LL  +D  +AD+ T++ LI LAG  AQ R ++YF++++ I + DL+ ID LW  HS GKFG  VQ++I+  V KD+ K + K+GW   
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           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG Q+++ + +H A+E
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic1.8e-5449.62Show/hide
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        HS PS  H     H  NL        ++L LK  ++A   +   + ++ ++S+ + +A S+ + SA T+ +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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        ++G+ A KRGYV+FSEV+ I+ +DL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPL
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        TNALRGTQL+  +LSHPAF   A +  GE +        VA E+ GV         +R+FK +YSF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding1.3e-5549.62Show/hide
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        HS PS  H     H  NL        ++L LK  ++A   +   + ++ ++S+ + +A S+ + SA T+ +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCGCCATCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTTCTCGCCGCCAAAGACTTCCGGCAAGCCGACGAGGAAACCCGGCGGCTTCTAATCGCCCTCGCCGGCGACGGCGCCCAG
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ACAGAAACGAATTTTTGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACAAAACTGTTTATGAAACTTGGGTGGATGAAGAAGCTGGATACGGAAATGGAGCAGTACAATTACAGAGCAT
TTCCGACGGAGTTCATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCGGAAGGGCATCTGCCATTAACGAATGCTTTGAGAGGGACACAGTTAATGACGAACATTCTGAGCCATCCG
GCATTTGAGGAGGACGCCATTGAAGAGAAAGGGGAAGAAAAAGTTGCAGGGGAAGAAAATGGAGTACTGAAAAAGGGATTGAAATCGATTAGTGAGAGGATTTTCAAAAG
GGATTATAGCTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AACTTCCACCGCCATCAACACCACCACCACCACCACCACCACTGCCGCCGCCGCTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCAGCTCCTTCTCTCCCTCCGCAGACACCTCCT
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TTCCGACGGAGTTCATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCGGAAGGGCATCTGCCATTAACGAATGCTTTGAGAGGGACACAGTTAATGACGAACATTCTGAGCCATCCG
GCATTTGAGGAGGACGCCATTGAAGAGAAAGGGGAAGAAAAAGTTGCAGGGGAAGAAAATGGAGTACTGAAAAAGGGATTGAAATCGATTAGTGAGAGGATTTTCAAAAG
GGATTATAGCTTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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