; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10004092 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10004092
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionalpha-(1,4)-fucosyltransferase-like
Genome locationChr08:13614350..13617576
RNA-Seq ExpressionHG10004092
SyntenyHG10004092
Gene Ontology termsGO:0006486 - protein glycosylation (biological process)
GO:0036065 - fucosylation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0032580 - Golgi cisterna membrane (cellular component)
GO:0008417 - fucosyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001503 - Glycosyl transferase family 10
IPR017177 - Alpha-(1, 3)-fucosyltransferase/alpha-(1, 4)-fucosyltransferase, plant
IPR038577 - GT10-like, C-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578850.1 Alpha-(1,4)-fucosyltransferase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-22895.06Show/hide
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XP_023550434.1 alpha-(1,4)-fucosyltransferase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.1e-22894.81Show/hide
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XP_038885615.1 alpha-(1,4)-fucosyltransferase [Benincasa hispida]1.6e-22795.06Show/hide
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A0A5D3BZK0 Alpha-(1,4)-fucosyltransferase5.2e-22995.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5F2L1 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 101.2e-1733.33Show/hide
Query:  SKNN-----DTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTE
        SKNN       LVY  S  C P   R+   R+L++ +   S+G+CL N         +  +  N AS+     D  +  ++QYKFILA EN + + Y+TE
Subjt:  SKNN-----DTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTE

Query:  KLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRV
        K +  L  G VP+Y+G+P + D++P + S I  S+FS   ELAS+++RL  D   Y  Y  W+    + N R   A                +DT  C V
Subjt:  KLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRV

Query:  CDAV
        C  V
Subjt:  CDAV

Q6A198 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 104.3e-1829.81Show/hide
Query:  ALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQSTYAGALFHNSRNYHVSSSKNNDTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPH
        ALF E S     +    P+    +  A   R     L   Y    +V ++    +   S+N+     K+   LVY  S  C P   R+   R+L++ +  
Subjt:  ALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQSTYAGALFHNSRNYHVSSSKNNDTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPH

Query:  HSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSL
         S+G+CL N         + P+ +N AS+     D     ++QYKFILA EN + + Y+TEKL+  L  G VP+Y+G+P++ D++P + S I  S+FS  
Subjt:  HSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSL

Query:  EELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCDAV
         ELASY++ L  D   Y  Y  W+    + N R   A                +D   C VC  V
Subjt:  EELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCDAV

Q6NTZ6 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 102.3e-1932.19Show/hide
Query:  SYHAEDDVQSTY-AGALFHNSRNYHVSSSKNN------DTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPK
        S H+   + S Y  G     S +Y VS  K N        L Y  S  C P   R+   ++L+  +   S+G+CL+N           P+  N+ S    
Subjt:  SYHAEDDVQSTY-AGALFHNSRNYHVSSSKNN------DTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPK

Query:  WWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNY
             H  + QYKFILA EN + E Y+TEKL+  L  G+VP+YFGAPNV D++P + S I  S+FS  ++LA+Y+K+L  +   Y ++  W+    + N 
Subjt:  WWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNY

Query:  RRTRAAS--------------LDTLPCRVCDAV
        R   A +              +D   C VC  V
Subjt:  RRTRAAS--------------LDTLPCRVCDAV

Q6P4F1 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 104.3e-1833.16Show/hide
Query:  LVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSV
        LVY  S  C P   R+   R+L++ +   S+G+CL N    D+   +    + DA       D  +  ++QYKFILA EN + + Y+TEK +  L  G V
Subjt:  LVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSV

Query:  PIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCDAV
        P+Y+G+P++ D++P + S I  S+FS   ELASY++RL  D   Y  Y  W+    + N R   A                +D   C VC  V
Subjt:  PIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCDAV

Q9C8W3 Alpha-(1,4)-fucosyltransferase2.1e-16668.23Show/hide
Query:  MLLKPFNTVAVVFMLAFAFFIIFFTGFLEFPPASTSIVPSTDDLNLSAAEFASDPFTDLITAFKKWDSQVGCDRFREKIGGGLSNGSLSVSLQQVGGDSN
        M ++  N +A + M+ F   I+ FTG LEFP ASTS+  S D      ++  SDPF+D++ A+KKWD +VGC RFRE     +     S SLQ+ G    
Subjt:  MLLKPFNTVAVVFMLAFAFFIIFFTGFLEFPPASTSIVPSTDDLNLSAAEFASDPFTDLITAFKKWDSQVGCDRFREKIGGGLSNGSLSVSLQQVGGDSN

Query:  SECGGLKLNHVAVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKASVLADKPDALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST
          CG LK+ HV VLVKGWTWIPDNL+NLYSC CG++CLWTK+SVLAD PDAL FET+TPP QRR GDPLR+YM+LEAGRKRSG ED+F+SYHA+DDVQ+T
Subjt:  SECGGLKLNHVAVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKASVLADKPDALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST

Query:  YAGALFHNSRNYHVSSSKNNDTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIEN
        YAG+LFHN+RNYH+S  KNND LVYWSSSRCLP R++LA+ LL L+PHHSFGKCLNNVGGLD ALSMYPEC  + +   KW+DHLHCAMS YKF+LAIEN
Subjt:  YAGALFHNSRNYHVSSSKNNDTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIEN

Query:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCDAVSR
        T  ESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA NV DFVPPHS+IDGSKF S++ELA+YVKRL DDPVAY+EYHAWRRC  +GNY +TRA SLDTLPCR+C+ +SR
Subjt:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCDAVSR

Query:  RGGRNA
        RGG+NA
Subjt:  RGGRNA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49710.1 fucosyltransferase 122.7e-1234.78Show/hide
Query:  AMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS
        A+ +YKF LA ENT  E YVTEK F +L +GSVP+  G PN+ +F P   S +       +E +A  +K LA +P AY +   W+      +++     +
Subjt:  AMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS

Query:  LDTLPCRVCDAVSRR
             CR+C  ++ R
Subjt:  LDTLPCRVCDAVSRR

AT1G71990.1 fucosyltransferase 131.5e-16768.23Show/hide
Query:  MLLKPFNTVAVVFMLAFAFFIIFFTGFLEFPPASTSIVPSTDDLNLSAAEFASDPFTDLITAFKKWDSQVGCDRFREKIGGGLSNGSLSVSLQQVGGDSN
        M ++  N +A + M+ F   I+ FTG LEFP ASTS+  S D      ++  SDPF+D++ A+KKWD +VGC RFRE     +     S SLQ+ G    
Subjt:  MLLKPFNTVAVVFMLAFAFFIIFFTGFLEFPPASTSIVPSTDDLNLSAAEFASDPFTDLITAFKKWDSQVGCDRFREKIGGGLSNGSLSVSLQQVGGDSN

Query:  SECGGLKLNHVAVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKASVLADKPDALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST
          CG LK+ HV VLVKGWTWIPDNL+NLYSC CG++CLWTK+SVLAD PDAL FET+TPP QRR GDPLR+YM+LEAGRKRSG ED+F+SYHA+DDVQ+T
Subjt:  SECGGLKLNHVAVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKASVLADKPDALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST

Query:  YAGALFHNSRNYHVSSSKNNDTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIEN
        YAG+LFHN+RNYH+S  KNND LVYWSSSRCLP R++LA+ LL L+PHHSFGKCLNNVGGLD ALSMYPEC  + +   KW+DHLHCAMS YKF+LAIEN
Subjt:  YAGALFHNSRNYHVSSSKNNDTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIEN

Query:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCDAVSR
        T  ESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA NV DFVPPHS+IDGSKF S++ELA+YVKRL DDPVAY+EYHAWRRC  +GNY +TRA SLDTLPCR+C+ +SR
Subjt:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCDAVSR

Query:  RGGRNA
        RGG+NA
Subjt:  RGGRNA

AT3G19280.1 fucosyltransferase 111.3e-1437.39Show/hide
Query:  AMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS
        A+  YKF LA ENT  E YVTEK F +L +GSVP+  GAPN+ +F P P S +   +   ++ +A  +K LAD+P AY +   W+      +++     +
Subjt:  AMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS

Query:  LDTLPCRVCDAVSRR
             CR+C  V+ R
Subjt:  LDTLPCRVCDAVSRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCTTGAAGCCCTTCAACACCGTCGCCGTCGTATTCATGCTCGCTTTCGCATTCTTCATCATCTTCTTCACTGGCTTCCTCGAATTTCCACCGGCATCGACTTCCAT
CGTACCGTCCACCGACGATCTGAATCTCTCCGCAGCCGAATTCGCTTCCGACCCTTTCACTGATTTGATCACCGCCTTTAAGAAATGGGACTCTCAGGTGGGTTGTGATC
GGTTCCGGGAGAAAATTGGCGGCGGTTTGAGCAATGGGTCTTTGTCGGTTTCGCTGCAGCAAGTCGGCGGCGACTCTAATTCGGAATGCGGGGGGCTGAAACTGAATCAT
GTTGCTGTTTTGGTGAAAGGATGGACTTGGATTCCTGATAATTTAGATAATTTGTATTCGTGTTCCTGCGGATTGAGCTGTCTTTGGACTAAAGCTTCTGTTCTTGCTGA
TAAACCTGACGCCTTGTTCTTTGAAACCAGTACGCCTCCTCGGCAGAGGCGCAGAGGAGATCCTCTTCGCATATATATGGATCTCGAGGCTGGTCGGAAGCGCTCAGGTT
TTGAGGATCTATTTGTTAGTTATCATGCAGAAGATGATGTTCAGTCAACTTATGCAGGAGCACTCTTTCACAACAGTCGAAACTATCACGTATCTTCTTCTAAAAATAAT
GATACACTTGTTTATTGGTCGTCGTCTCGTTGTCTTCCCCAAAGAAATCAGCTTGCTAGGAAACTTCTAAGCTTGCTGCCCCACCATTCATTTGGCAAGTGCTTGAACAA
CGTAGGCGGCCTCGATATGGCCCTTTCGATGTACCCTGAATGTGCAAATGATGCCAGTGTCACCCCGAAATGGTGGGATCACTTGCATTGTGCAATGTCTCAATACAAAT
TCATTCTCGCAATTGAAAACACAATGACTGAGAGTTACGTAACGGAGAAGCTATTTTACGCGCTAGACTCTGGTTCGGTTCCGATCTATTTTGGTGCCCCTAATGTCTGG
GACTTTGTTCCTCCACATTCTATAATTGATGGGTCTAAATTCAGCTCCTTGGAAGAGTTAGCTTCTTACGTGAAGCGACTTGCGGATGATCCAGTAGCTTATGCTGAGTA
CCATGCTTGGAGACGATGTCGTGCATTGGGTAACTATAGAAGGACCCGAGCTGCGAGCCTTGACACGCTGCCATGTCGGGTTTGTGATGCTGTGAGCAGAAGGGGTGGTA
GAAATGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTCTTGAAGCCCTTCAACACCGTCGCCGTCGTATTCATGCTCGCTTTCGCATTCTTCATCATCTTCTTCACTGGCTTCCTCGAATTTCCACCGGCATCGACTTCCAT
CGTACCGTCCACCGACGATCTGAATCTCTCCGCAGCCGAATTCGCTTCCGACCCTTTCACTGATTTGATCACCGCCTTTAAGAAATGGGACTCTCAGGTGGGTTGTGATC
GGTTCCGGGAGAAAATTGGCGGCGGTTTGAGCAATGGGTCTTTGTCGGTTTCGCTGCAGCAAGTCGGCGGCGACTCTAATTCGGAATGCGGGGGGCTGAAACTGAATCAT
GTTGCTGTTTTGGTGAAAGGATGGACTTGGATTCCTGATAATTTAGATAATTTGTATTCGTGTTCCTGCGGATTGAGCTGTCTTTGGACTAAAGCTTCTGTTCTTGCTGA
TAAACCTGACGCCTTGTTCTTTGAAACCAGTACGCCTCCTCGGCAGAGGCGCAGAGGAGATCCTCTTCGCATATATATGGATCTCGAGGCTGGTCGGAAGCGCTCAGGTT
TTGAGGATCTATTTGTTAGTTATCATGCAGAAGATGATGTTCAGTCAACTTATGCAGGAGCACTCTTTCACAACAGTCGAAACTATCACGTATCTTCTTCTAAAAATAAT
GATACACTTGTTTATTGGTCGTCGTCTCGTTGTCTTCCCCAAAGAAATCAGCTTGCTAGGAAACTTCTAAGCTTGCTGCCCCACCATTCATTTGGCAAGTGCTTGAACAA
CGTAGGCGGCCTCGATATGGCCCTTTCGATGTACCCTGAATGTGCAAATGATGCCAGTGTCACCCCGAAATGGTGGGATCACTTGCATTGTGCAATGTCTCAATACAAAT
TCATTCTCGCAATTGAAAACACAATGACTGAGAGTTACGTAACGGAGAAGCTATTTTACGCGCTAGACTCTGGTTCGGTTCCGATCTATTTTGGTGCCCCTAATGTCTGG
GACTTTGTTCCTCCACATTCTATAATTGATGGGTCTAAATTCAGCTCCTTGGAAGAGTTAGCTTCTTACGTGAAGCGACTTGCGGATGATCCAGTAGCTTATGCTGAGTA
CCATGCTTGGAGACGATGTCGTGCATTGGGTAACTATAGAAGGACCCGAGCTGCGAGCCTTGACACGCTGCCATGTCGGGTTTGTGATGCTGTGAGCAGAAGGGGTGGTA
GAAATGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLLKPFNTVAVVFMLAFAFFIIFFTGFLEFPPASTSIVPSTDDLNLSAAEFASDPFTDLITAFKKWDSQVGCDRFREKIGGGLSNGSLSVSLQQVGGDSNSECGGLKLNH
VAVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKASVLADKPDALFFETSTPPRQRRRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQSTYAGALFHNSRNYHVSSSKNN
DTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALSMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSQYKFILAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVW
DFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPVAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCDAVSRRGGRNA