; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10004165 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10004165
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionras-related protein RABC2a-like
Genome locationChr08:14347961..14351305
RNA-Seq ExpressionHG10004165
SyntenyHG10004165
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150373.1 ras-related protein RABC2a [Cucumis sativus]5.5e-10587.77Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI              GVDFKIKMVTVGGK+LKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNL++VWAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGS+RAVTTEEGMEVAK+HKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSKM+EVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH
        NGSVVVKQKILDKT+ARK  E ND GCCH
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH

XP_008456546.1 PREDICTED: ras-related protein RABC2a-like [Cucumis melo]2.5e-10587.77Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNL+++WAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH
        NGS+VVKQKILDKTRA K  E ND GCCH
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH

XP_022952871.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita moschata]2.2e-10689.82Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

XP_022990456.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita maxima]9.4e-10588.94Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNLM VWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        NGSVVVKQKILDKTRA KEANDGGCC
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

XP_038885704.1 ras-related protein RABC2a-like [Benincasa hispida]3.7e-10991.19Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVE+YLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCCH
        NGSVVVKQKILD TRARKEAND GCCH
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCCH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN27 Uncharacterized protein2.7e-10587.77Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI              GVDFKIKMVTVGGK+LKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNL++VWAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGS+RAVTTEEGMEVAK+HKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSKM+EVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH
        NGSVVVKQKILDKT+ARK  E ND GCCH
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH

A0A1S3C3K9 ras-related protein RABC2a-like1.2e-10587.77Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNL+++WAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH
        NGS+VVKQKILDKTRA K  E ND GCCH
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH

A0A5D3BLP5 Ras-related protein RABC2a-like3.8e-10478.54Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFL---------------------------------SIYACFDGVDFKI
        MGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIG  L  L                                 SI     GVDFKI
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFL---------------------------------SIYACFDGVDFKI

Query:  KMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKS
        KMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNL+++WAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKS
Subjt:  KMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKS

Query:  LFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH
        LFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGS+VVKQKILDKTRA K  E ND GCCH
Subjt:  LFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARK--EANDGGCCH

A0A6J1GLE8 ras-related protein RABC2a-like1.1e-10689.82Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

A0A6J1JMZ9 ras-related protein RABC2a-like4.5e-10588.94Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTI              GVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYR

Query:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE
        GAHGIILVYDVTRRETFTNLM VWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLE
Subjt:  GAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLE

Query:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        NGSVVVKQKILDKTRA KEANDGGCC
Subjt:  NGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC19.5e-6860Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTI              GVDFK+K +T+G K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        A GII+VYDVTRR+TFTNL D+WAKE++LY TN +CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG++ A+E+  LFLECSA+TR NV++CF EL  K+LE PSL   
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS   K+ I  +  A+  +     C
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

O49841 Ras-related protein RABC2a6.6e-7767.11Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTI              GVDFKIK +TVGGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        A GIILVYDVTRRETFTNL+DVW KE+ELY TN EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+ +AKE   +FLECSARTR+NV++CF EL+ K++EVPSLLE 
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS  VK+ IL +    +     GCC
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

P36862 GTP-binding protein yptV34.2e-4752.58Show/hide
Query:  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYD
        S+DY+FK+LL+GDSGVGKS IL  + S  F    + TI              GVDFK+K +T  GKR KLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII VYD
Subjt:  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYD

Query:  VTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSV
        VTRR+TF +L   W +E ++Y T    IK++V NKVD  ++R V++EEG + A+ H  LF+E SAR    V + F EL  K+L+ P LLE  +V
Subjt:  VTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSV

Q5ZLG1 Ras-related protein Rab-182.5e-4447.17Show/hide
Query:  SFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        + KIL+IG+SGVGKSS+LL +  + F  +L+ TI              GVDFK+K ++V G + KL IWDTAGQERF TLT SYYRGA G+ILVYDVTRR
Subjt:  SFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        +TF  L D W  E+E Y T ++ +K+LVGNK+D+   R V   EG++ A++H  LF+E SA+T + V   F EL  K+++ P L E+ S     K+ +K 
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCC
           +E + GG C
Subjt:  RARKEANDGGCC

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b8.3e-7265.78Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTI              GVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        + GIILVYDVT+RETF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE 
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS  VK+K          A+ G CC
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B186.8e-6960Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTI              GVDFK+K +T+G K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        A GII+VYDVTRR+TFTNL D+WAKE++LY TN +CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG++ A+E+  LFLECSA+TR NV++CF EL  K+LE PSL   
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS   K+ I  +  A+  +     C
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B5.9e-7365.78Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTI              GVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        + GIILVYDVT+RETF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE 
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS  VK+K          A+ G CC
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

AT3G09910.2 RAB GTPase homolog C2B5.9e-7365.78Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTI              GVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        + GIILVYDVT+RETF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE 
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS  VK+K          A+ G CC
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

AT3G09910.3 RAB GTPase homolog C2B5.9e-7365.78Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTI              GVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        + GIILVYDVT+RETF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE 
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS  VK+K          A+ G CC
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A4.7e-7867.11Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTI              GVDFKIK +TVGGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRG
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRG

Query:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN
        A GIILVYDVTRRETFTNL+DVW KE+ELY TN EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+ +AKE   +FLECSARTR+NV++CF EL+ K++EVPSLLE 
Subjt:  AHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLEN

Query:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        GS  VK+ IL +    +     GCC
Subjt:  GSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATTTTGTTGATTGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTTAGCTACAT
CTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCCACCATCGGTTTTTCTCTCTCTTTTCTCTCTATCTATGCATGTTTTGATGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATGGTAACAGTTG
GTGGGAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGACAAGAGAGATTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGTGCACATGGAATCATCCTAGTATACGAC
GTTACCCGACGGGAGACGTTTACAAACTTGATGGATGTATGGGCAAAGGAAGTAGAGTTGTATTTAACCAATCATGAGTGCATAAAGATTCTAGTTGGAAATAAAGTCGA
TCGGGGTAGTGAAAGAGCGGTAACAACAGAAGAAGGCATGGAAGTTGCCAAGGAGCATAAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGTGCTAGAACTCGAGAAAATGTCGACAGAT
GCTTCAGTGAACTCTCTTCAAAGATGCTGGAAGTTCCAAGTCTACTGGAAAATGGATCTGTTGTTGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAGACACGAGCACGCAAAGAAGCG
AACGACGGGGGTTGTTGCCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATTTTGTTGATTGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTTAGCTACAT
CTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCCACCATCGGTTTTTCTCTCTCTTTTCTCTCTATCTATGCATGTTTTGATGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATGGTAACAGTTG
GTGGGAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGACAAGAGAGATTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGTGCACATGGAATCATCCTAGTATACGAC
GTTACCCGACGGGAGACGTTTACAAACTTGATGGATGTATGGGCAAAGGAAGTAGAGTTGTATTTAACCAATCATGAGTGCATAAAGATTCTAGTTGGAAATAAAGTCGA
TCGGGGTAGTGAAAGAGCGGTAACAACAGAAGAAGGCATGGAAGTTGCCAAGGAGCATAAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGTGCTAGAACTCGAGAAAATGTCGACAGAT
GCTTCAGTGAACTCTCTTCAAAGATGCTGGAAGTTCCAAGTCTACTGGAAAATGGATCTGTTGTTGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAGACACGAGCACGCAAAGAAGCG
AACGACGGGGGTTGTTGCCACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGFSLSFLSIYACFDGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYD
VTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEA
NDGGCCH