; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10004715 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10004715
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionWRKY protein
Genome locationChr08:19772271..19774850
RNA-Seq ExpressionHG10004715
SyntenyHG10004715
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003657 - WRKY domain
IPR036576 - WRKY domain superfamily
IPR044810 - WRKY transcription factor, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064890.1 putative WRKY transcription factor 40 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-12480Show/hide
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XP_023545515.1 probable WRKY transcription factor 40 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-12478.55Show/hide
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XP_038885570.1 probable WRKY transcription factor 40 [Benincasa hispida]5.4e-13282.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BC94 probable WRKY transcription factor 403.7e-12680.63Show/hide
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A0A5A7VCH3 Putative WRKY transcription factor 405.3e-12580Show/hide
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A0A6J1HD49 probable WRKY transcription factor 403.4e-12477.92Show/hide
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A0A6J1K8R9 probable WRKY transcription factor 404.2e-12277.29Show/hide
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E7CEW3 WRKY protein1.0e-12380.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8B0R8 WRKY transcription factor WRKY287.3e-3937.61Show/hide
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Q0DAJ3 WRKY transcription factor WRKY284.3e-3937.61Show/hide
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Q9C5T4 WRKY transcription factor 182.2e-4338.44Show/hide
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Query:  CSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASST
        CSFAP+CPVK+KVQRS EDPS LVATYEG HNH  PN+                         +S   S ++   +V    + +L + E        ++ 
Subjt:  CSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASST

Query:  QKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDK
        Q++L+QQMA+ LT+D  FT ALA AI+G ++++
Subjt:  QKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDK

Q9SAH7 Probable WRKY transcription factor 403.2e-5042.67Show/hide
Query:  STTINTSLDLNFNPPPYTADESPPTHTLSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDNY
        S+ ++TSLDL         +E PPT           + L E+LNR+S+EN+KL++ML L+ +NY+VL+ Q+++ + KS           +KRK+   ++ 
Subjt:  STTINTSLDLNFNPPPYTADESPPTHTLSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDNY

Query:  CNFNRSGSDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYL
         +    G        +D +   C  +R     K KV RV   T  SD++LVVKDGYQWRKYGQKVT+DNPSPRAY+KC+ AP+C VK+KVQRSVED S L
Subjt:  CNFNRSGSDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYL

Query:  VATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALA
        VATYEGEHNH  P+     Q+     LN  +   G +S+P ++ +  SL   + T     S      TS        QKLLV+QMA+ LT+DPNFT ALA
Subjt:  VATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALA

Query:  TAITGNM
         A+TG +
Subjt:  TAITGNM

Q9SK33 Probable WRKY transcription factor 603.3e-3939.26Show/hide
Query:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSG--SDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRV
        +K++   +L +++NR++SEN+KL +ML  V E Y  L N    LM + + RK+    N+ N   +G    +     S     S        N K  V   
Subjt:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSG--SDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRV

Query:  LVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSS
              SD+SL VKDGYQWRKYGQK+T+DNPSPRAY++CSF+P+C VK+KVQRS EDPS+LVATYEG HNH  P++ +   +        KLD       
Subjt:  LVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSS

Query:  PSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVD
        P    K                              + Q++LVQQMA+ LT+DP FT ALATAI+G +++
Subjt:  PSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G68150.1 WRKY DNA-binding protein 91.5e-1845.19Show/hide
Query:  VKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMT
        + DG QWRKYGQK  K NP PRAYY+C+ AP CPV+++VQR +ED S L+ TYEG HNH  P                 LDS    S PS      ++ +
Subjt:  VKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMT

Query:  SIVT
        S++T
Subjt:  SIVT

AT1G80840.1 WRKY DNA-binding protein 402.3e-5142.67Show/hide
Query:  STTINTSLDLNFNPPPYTADESPPTHTLSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDNY
        S+ ++TSLDL         +E PPT           + L E+LNR+S+EN+KL++ML L+ +NY+VL+ Q+++ + KS           +KRK+   ++ 
Subjt:  STTINTSLDLNFNPPPYTADESPPTHTLSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDNY

Query:  CNFNRSGSDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYL
         +    G        +D +   C  +R     K KV RV   T  SD++LVVKDGYQWRKYGQKVT+DNPSPRAY+KC+ AP+C VK+KVQRSVED S L
Subjt:  CNFNRSGSDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYL

Query:  VATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALA
        VATYEGEHNH  P+     Q+     LN  +   G +S+P ++ +  SL   + T     S      TS        QKLLV+QMA+ LT+DPNFT ALA
Subjt:  VATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALA

Query:  TAITGNM
         A+TG +
Subjt:  TAITGNM

AT2G25000.1 WRKY DNA-binding protein 602.3e-4039.26Show/hide
Query:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSG--SDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRV
        +K++   +L +++NR++SEN+KL +ML  V E Y  L N    LM + + RK+    N+ N   +G    +     S     S        N K  V   
Subjt:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSG--SDQYCGCCSDDNNDSCYNKRPRQNSKPKVMRV

Query:  LVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSS
              SD+SL VKDGYQWRKYGQK+T+DNPSPRAY++CSF+P+C VK+KVQRS EDPS+LVATYEG HNH  P++ +   +        KLD       
Subjt:  LVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSS

Query:  PSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVD
        P    K                              + Q++LVQQMA+ LT+DP FT ALATAI+G +++
Subjt:  PSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVD

AT4G31800.1 WRKY DNA-binding protein 181.6e-4438.44Show/hide
Query:  MEHSTTINTSLDLNFNP-----PPYTADESPPTHTLSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSR----------K
        M+ S+ ++ SLDLN NP     P         TH      EQ  + + L E+LNR++SEN+KL +ML  V E+Y+ L N +  L  +            K
Subjt:  MEHSTTINTSLDLNFNP-----PPYTADESPPTHTLSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSR----------K

Query:  RKAAGCDNYCNFN---RSGSDQYCGCCSD---------DNNDSCYNKRPRQNS--KPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYK
        ++    D +  F     SG  +      D           N     KRP  +S  K KV  V VPT  SD+SL VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++
Subjt:  RKAAGCDNYCNFN---RSGSDQYCGCCSD---------DNNDSCYNKRPRQNS--KPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYK

Query:  CSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASST
        CSFAP+CPVK+KVQRS EDPS LVATYEG HNH  PN+                         +S   S ++   +V    + +L + E        ++ 
Subjt:  CSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASST

Query:  QKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDK
        Q++L+QQMA+ LT+D  FT ALA AI+G ++++
Subjt:  QKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDK

AT4G31800.2 WRKY DNA-binding protein 182.0e-4438.55Show/hide
Query:  MEHSTTINTSLDLNFNP----PPYTADESPPTHTLSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSR----------KR
        M+ S+ ++ SLDLN NP     P        TH      EQ  + + L E+LNR++SEN+KL +ML  V E+Y+ L N +  L  +            K+
Subjt:  MEHSTTINTSLDLNFNP----PPYTADESPPTHTLSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSR----------KR

Query:  KAAGCDNYCNFN---RSGSDQYCGCCSD---------DNNDSCYNKRPRQNS--KPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKC
        +    D +  F     SG  +      D           N     KRP  +S  K KV  V VPT  SD+SL VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++C
Subjt:  KAAGCDNYCNFN---RSGSDQYCGCCSD---------DNNDSCYNKRPRQNS--KPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKC

Query:  SFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQ
        SFAP+CPVK+KVQRS EDPS LVATYEG HNH  PN+                         +S   S ++   +V    + +L + E        ++ Q
Subjt:  SFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLNSKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQ

Query:  KLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDK
        ++L+QQMA+ LT+D  FT ALA AI+G ++++
Subjt:  KLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACACTCAACTACCATCAATACTTCTCTCGATCTTAATTTCAATCCTCCGCCGTACACCGCCGACGAATCTCCGCCCACTCACACTCTTTCTCCACTCAAAGAACA
GGCTCCAGCCATTCTTGCGGAAAAATTGAATCGTATAAGTTCGGAGAATCAGAAACTGAATCAGATGCTTGGGCTGGTGGTTGAGAATTACAGCGTTCTGCAAAATCAGG
TAATCGATTTGATGATGAAATCAAGGAAAAGGAAAGCTGCTGGGTGCGATAATTACTGCAATTTCAATCGGAGCGGATCCGATCAATATTGCGGTTGCTGTAGCGACGAT
AATAATGATTCATGTTATAACAAAAGGCCTAGACAAAACAGTAAACCGAAAGTTATGAGAGTTTTGGTTCCGACGCCAGTTTCCGATTCCAGCCTGGTTGTGAAGGATGG
ATATCAATGGAGGAAATATGGTCAAAAGGTGACTAAAGACAATCCGTCCCCAAGAGCTTACTATAAATGCTCATTTGCCCCTACCTGTCCGGTGAAGAGAAAGGTTCAAA
GAAGTGTTGAAGATCCATCTTATTTAGTAGCTACATATGAAGGAGAGCACAATCATGCAAAACCCAACTCAGGAATTGAGTATCAATTAATTGGACCAATTCATTTAAAT
TCAAAGCTTGATTCTTATGGTGTTTCATCATCACCTTCTTCCTCTGTCAAATCTCCATCATTAATGACTTCTATTGTCACTGACTCTTTCAAAGCTTCACTTCCACAACC
TGAAACAACCTCAGTTTCAGCTTCAGCTTCTTCAACCCAAAAGCTTTTAGTTCAACAAATGGCTAACCTTTTGACCAGAGATCCAAATTTCACCACAGCCCTTGCCACTG
CCATTACTGGAAATATGGTAGATAAAGAAATCTGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAACACTCAACTACCATCAATACTTCTCTCGATCTTAATTTCAATCCTCCGCCGTACACCGCCGACGAATCTCCGCCCACTCACACTCTTTCTCCACTCAAAGAACA
GGCTCCAGCCATTCTTGCGGAAAAATTGAATCGTATAAGTTCGGAGAATCAGAAACTGAATCAGATGCTTGGGCTGGTGGTTGAGAATTACAGCGTTCTGCAAAATCAGG
TAATCGATTTGATGATGAAATCAAGGAAAAGGAAAGCTGCTGGGTGCGATAATTACTGCAATTTCAATCGGAGCGGATCCGATCAATATTGCGGTTGCTGTAGCGACGAT
AATAATGATTCATGTTATAACAAAAGGCCTAGACAAAACAGTAAACCGAAAGTTATGAGAGTTTTGGTTCCGACGCCAGTTTCCGATTCCAGCCTGGTTGTGAAGGATGG
ATATCAATGGAGGAAATATGGTCAAAAGGTGACTAAAGACAATCCGTCCCCAAGAGCTTACTATAAATGCTCATTTGCCCCTACCTGTCCGGTGAAGAGAAAGGTTCAAA
GAAGTGTTGAAGATCCATCTTATTTAGTAGCTACATATGAAGGAGAGCACAATCATGCAAAACCCAACTCAGGAATTGAGTATCAATTAATTGGACCAATTCATTTAAAT
TCAAAGCTTGATTCTTATGGTGTTTCATCATCACCTTCTTCCTCTGTCAAATCTCCATCATTAATGACTTCTATTGTCACTGACTCTTTCAAAGCTTCACTTCCACAACC
TGAAACAACCTCAGTTTCAGCTTCAGCTTCTTCAACCCAAAAGCTTTTAGTTCAACAAATGGCTAACCTTTTGACCAGAGATCCAAATTTCACCACAGCCCTTGCCACTG
CCATTACTGGAAATATGGTAGATAAAGAAATCTGGCGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEHSTTINTSLDLNFNPPPYTADESPPTHTLSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENYSVLQNQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDD
NNDSCYNKRPRQNSKPKVMRVLVPTPVSDSSLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPSYLVATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLN
SKLDSYGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTDSFKASLPQPETTSVSASASSTQKLLVQQMANLLTRDPNFTTALATAITGNMVDKEIWR