; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10004904 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10004904
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionThylakoidal processing peptidase 1
Genome locationChr08:21314069..21317411
RNA-Seq ExpressionHG10004904
SyntenyHG10004904
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process)
GO:0005887 - integral component of plasma membrane (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000223 - Peptidase S26A, signal peptidase I
IPR019533 - Peptidase S26
IPR019756 - Peptidase S26A, signal peptidase I, serine active site
IPR019758 - Peptidase S26A, signal peptidase I, conserved site
IPR036286 - LexA/Signal peptidase-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BBL0 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like3.7e-18991.89Show/hide
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A0A5A7VHF7 Thylakoidal processing peptidase 12.4e-18891.62Show/hide
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A0A6J1CT20 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like1.1e-18087.4Show/hide
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A0A6J1GIQ5 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like isoform X19.8e-17484.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04348 Thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic6.0e-9654.67Show/hide
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P72660 Probable signal peptidase I-15.2e-3947.56Show/hide
Query:  EDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVN
        E+   L  AL +++L + F+AEP+ IPS SM PTLE GDR++ EKVSY F  P+V DI++F  P++LQ  G    + FIKRV+A  G  V V  G +  +
Subjt:  EDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVN

Query:  GVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSK
        G    E+++LEP  Y +  + VP+G V+VMGDNRNNS DSH WG LP +NI+G +L +++P S+
Subjt:  GVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSK

P73157 Probable signal peptidase I-21.7e-3440.57Show/hide
Query:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGK
        +T+ E  K + TA+ +++  ++F+AE + IPSSSM PTL++ DR++ EK+SY  R PE  +IV+F     L+    + ++ FIKR++   GD V V +G 
Subjt:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGK

Query:  LVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDE
        + VNG + DE+++  P AYE  P+ VP+    V+GDNRNNS DSH WG +P E ++GR+ +++WP  +   + D+
Subjt:  LVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDE

Q8H0W1 Chloroplast processing peptidase3.8e-5858.38Show/hide
Query:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS
        EK+      L   S+DA+ +F A+ VS+ F+ F+AEP+ IPS SM PT +VGDR++AEKVSY+FRKP  +DIVIFK+P +LQE G +  +VFIKR+VA  
Subjt:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS

Query:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDE
        GD+V V  GKL+VNGV ++E F+LEP  YEM P+ VPE  V+VMGDNRNNS DSH WGPLP++NI+GRS+ +YWPP++ SG V E
Subjt:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDE

Q9M9Z2 Probable thylakoidal processing peptidase 2, chloroplastic1.3e-9353.95Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL
        MAIRVT +YS YVA+++ASS G R   G+ R   E WVR    G    P++  KS GS     S   R +P       +SMYST+A E + E  K+P+VL
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL

Query:  GLMSMLKSMADSSAISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGTT----VCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSED
        G++S++              G+S FK +S+IPFL+GSKW+P   I + +S D   VD+GG      V  + ++  SN         + WV++LL+  SED
Subjt:  GLMSMLKSMADSSAISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGTT----VCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSED

Query:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV
        AKA FTA+TVS+LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+VGDR++AEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAP IL E G S  +VFIKR+VA+ GD V V  GKL+VN  
Subjt:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV

Query:  VQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMV
        VQ EDFVLEPI YEMEP+ VPEGYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPI+NI+GRS+ +YWPPSK S ++
Subjt:  VQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06870.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein8.9e-9553.95Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL
        MAIRVT +YS YVA+++ASS G R   G+ R   E WVR    G    P++  KS GS     S   R +P       +SMYST+A E + E  K+P+VL
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL

Query:  GLMSMLKSMADSSAISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGTT----VCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSED
        G++S++              G+S FK +S+IPFL+GSKW+P   I + +S D   VD+GG      V  + ++  SN         + WV++LL+  SED
Subjt:  GLMSMLKSMADSSAISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGTT----VCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSED

Query:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV
        AKA FTA+TVS+LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+VGDR++AEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAP IL E G S  +VFIKR+VA+ GD V V  GKL+VN  
Subjt:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV

Query:  VQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMV
        VQ EDFVLEPI YEMEP+ VPEGYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPI+NI+GRS+ +YWPPSK S ++
Subjt:  VQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMV

AT1G23465.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein1.0e-1335.66Show/hide
Query:  SMCPTLE-VGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPI-AYEMEPLLVPEGYV
        SM PTL   G+ +LAE++S  ++KP   DIV+ ++P+       + N+  IKRVV   GD ++                FV++P+ + E + ++VP+G+V
Subjt:  SMCPTLE-VGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPI-AYEMEPLLVPEGYV

Query:  YVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSL
        +V GD  +NS DS ++GP+P   I GR L
Subjt:  YVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSL

AT1G53530.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein5.0e-1331.03Show/hide
Query:  FLAEPKSIPSSSMCPTLEV-GDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEM
        ++     +   SM PTL + GD ILAE +S+ F K  + D+V+ ++P+           +  KR++   GD +      LV +  V              
Subjt:  FLAEPKSIPSSSMCPTLEV-GDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEM

Query:  EPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPP
          +LVP+G+V++ GDN   S DS  +GP+P   I G++LL+ WPP
Subjt:  EPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPP

AT2G30440.1 thylakoid processing peptide4.3e-9754.67Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVLGLMS
        MAIR+T +YS +VA+NL  +     G C            F S   P   S    R++    R         +P SMY ++A E +GE  ++P+V+GL+S
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVLGLMS

Query:  MLKSMADSSAISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDDVDKGGTTVCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVS
        +LKS     + +    GVSSFKA+SIIPFLQGSKW+        V DDVDKGG TVC D ++  S          S WV++LLS  SEDAKA FTA+TVS
Subjt:  MLKSMADSSAISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDDVDKGGTTVCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVS

Query:  VLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQIL---QEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVL
        +LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+ GDR++AEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAP IL    E+G SSN+VFIKR+VA+ GD V V+ GKL VN +VQ+EDFVL
Subjt:  VLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQIL---QEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVL

Query:  EPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDEPRA
        EP++YEMEP+ VP+GYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPIENIVGRS+ +YWPPSK S  +   +A
Subjt:  EPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDEPRA

AT3G24590.1 plastidic type i signal peptidase 12.7e-5958.38Show/hide
Query:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS
        EK+      L   S+DA+ +F A+ VS+ F+ F+AEP+ IPS SM PT +VGDR++AEKVSY+FRKP  +DIVIFK+P +LQE G +  +VFIKR+VA  
Subjt:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS

Query:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDE
        GD+V V  GKL+VNGV ++E F+LEP  YEM P+ VPE  V+VMGDNRNNS DSH WGPLP++NI+GRS+ +YWPP++ SG V E
Subjt:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATTCGTGTTACTCTCTCCTACTCTGGCTATGTCGCCCAAAACCTAGCCTCCTCCACCGGCCTTCGGGCCGGTAACTGCCGCGTCTTTCAGGAGTTTTGGGTCCG
ATCTTGTGTTTTTGGATCGACCCATAATCCGGAGCTCAAATCTGCTGGAAGCGCGCGCAATTATCGGTCCGATAGCCGGCGGTTCAAGCCGGGTGGCTCTATTGAGAAGC
CAACTTCTATGTACAGCACTCTCGCCGGAGAAAGGGTTGGGGAAAGCCCTAAAAACCCCATGGTTTTGGGTTTGATGTCGATGTTAAAATCGATGGCTGATTCTTCTGCG
ATCAGTACGGGGACTTTTGGGGTTTCTTCGTTTAAAGCCACTTCGATTATACCCTTTTTACAAGGATCGAAGTGGCTTCCGGGTTATGATATACGATCTCATGTAAGCGA
CGATGTGGATAAAGGCGGAACAACGGTTTGTTATGATTATAATGAAAGTGGGAGTAATCAGTTTTATGAGAATGATTTTGAGAAGAGCAGCTGGGTTTCGCGCTTGTTGA
GTACTTATTCCGAGGACGCAAAGGCCCTCTTTACGGCTTTGACTGTTAGTGTGCTCTTTAAATCTTTCTTGGCGGAGCCGAAATCGATTCCTTCTTCTTCCATGTGTCCA
ACTCTGGAAGTAGGGGATCGTATTTTAGCAGAAAAGGTTTCATACTTTTTCAGGAAACCTGAAGTTTCAGATATAGTGATCTTCAAGGCTCCTCAAATCTTGCAGGAATT
TGGAGTTAGTTCAAATGAGGTGTTTATTAAGAGAGTTGTGGCTACATCTGGGGACGTGGTTGCAGTTCAAAAAGGGAAATTGGTCGTAAATGGTGTAGTTCAAGATGAGG
ACTTTGTCTTAGAGCCAATTGCTTATGAGATGGAACCATTGCTTGTGCCTGAAGGTTATGTGTATGTAATGGGGGACAACCGTAACAATAGTTGTGATTCTCATGACTGG
GGTCCACTCCCAATAGAAAATATTGTAGGTAGATCATTATTGAAGTATTGGCCTCCCTCCAAGGGATCCGGTATGGTAGATGAACCACGTGCAGGGAAGATTAATCTGGG
GATTTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTATTCGTGTTACTCTCTCCTACTCTGGCTATGTCGCCCAAAACCTAGCCTCCTCCACCGGCCTTCGGGCCGGTAACTGCCGCGTCTTTCAGGAGTTTTGGGTCCG
ATCTTGTGTTTTTGGATCGACCCATAATCCGGAGCTCAAATCTGCTGGAAGCGCGCGCAATTATCGGTCCGATAGCCGGCGGTTCAAGCCGGGTGGCTCTATTGAGAAGC
CAACTTCTATGTACAGCACTCTCGCCGGAGAAAGGGTTGGGGAAAGCCCTAAAAACCCCATGGTTTTGGGTTTGATGTCGATGTTAAAATCGATGGCTGATTCTTCTGCG
ATCAGTACGGGGACTTTTGGGGTTTCTTCGTTTAAAGCCACTTCGATTATACCCTTTTTACAAGGATCGAAGTGGCTTCCGGGTTATGATATACGATCTCATGTAAGCGA
CGATGTGGATAAAGGCGGAACAACGGTTTGTTATGATTATAATGAAAGTGGGAGTAATCAGTTTTATGAGAATGATTTTGAGAAGAGCAGCTGGGTTTCGCGCTTGTTGA
GTACTTATTCCGAGGACGCAAAGGCCCTCTTTACGGCTTTGACTGTTAGTGTGCTCTTTAAATCTTTCTTGGCGGAGCCGAAATCGATTCCTTCTTCTTCCATGTGTCCA
ACTCTGGAAGTAGGGGATCGTATTTTAGCAGAAAAGGTTTCATACTTTTTCAGGAAACCTGAAGTTTCAGATATAGTGATCTTCAAGGCTCCTCAAATCTTGCAGGAATT
TGGAGTTAGTTCAAATGAGGTGTTTATTAAGAGAGTTGTGGCTACATCTGGGGACGTGGTTGCAGTTCAAAAAGGGAAATTGGTCGTAAATGGTGTAGTTCAAGATGAGG
ACTTTGTCTTAGAGCCAATTGCTTATGAGATGGAACCATTGCTTGTGCCTGAAGGTTATGTGTATGTAATGGGGGACAACCGTAACAATAGTTGTGATTCTCATGACTGG
GGTCCACTCCCAATAGAAAATATTGTAGGTAGATCATTATTGAAGTATTGGCCTCCCTCCAAGGGATCCGGTATGGTAGATGAACCACGTGCAGGGAAGATTAATCTGGG
GATTTCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCVFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPGGSIEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVLGLMSMLKSMADSSA
ISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDDVDKGGTTVCYDYNESGSNQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCP
TLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFKAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMEPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDW
GPLPIENIVGRSLLKYWPPSKGSGMVDEPRAGKINLGIS