; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10004988 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10004988
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionAdenine phosphoribosyltransferase
Genome locationChr08:21963419..21966241
RNA-Seq ExpressionHG10004988
SyntenyHG10004988
Gene Ontology termsGO:0006166 - purine ribonucleoside salvage (biological process)
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InterPro domainsIPR000836 - Phosphoribosyltransferase domain
IPR005764 - Adenine phosphoribosyl transferase
IPR029057 - Phosphoribosyltransferase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060947.1 adenine phosphoribosyltransferase 1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-11989.31Show/hide
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KAG6598340.1 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-11787.6Show/hide
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XP_008444565.1 PREDICTED: adenine phosphoribosyltransferase 1 isoform X1 [Cucumis melo]3.4e-11989.31Show/hide
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XP_038886497.1 adenine phosphoribosyltransferase 3-like [Benincasa hispida]3.9e-12391.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN96 Adenine phosphoribosyltransferase8.8e-12188.89Show/hide
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A0A1S3BAN4 Adenine phosphoribosyltransferase1.7e-11989.31Show/hide
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A0A5A7V262 Adenine phosphoribosyltransferase1.7e-11989.31Show/hide
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A0A6J1HEI1 Adenine phosphoribosyltransferase1.0e-11687.21Show/hide
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A0A6J1KCC0 Adenine phosphoribosyltransferase2.7e-11486.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P31166 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic1.3e-8175.24Show/hide
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Q43199 Adenine phosphoribosyltransferase 16.0e-7477.59Show/hide
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Q9LFP0 Adenine phosphoribosyltransferase 53.0e-6569.32Show/hide
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Q9SU38 Adenine phosphoribosyltransferase 49.5e-7275.42Show/hide
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        EEY LEYG+D++EMHV AV++G+RALV+DDLIATGGTL AA+ LL+RVG EV+ECACVIEL  LKGRERL  +PL+VLV
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Q9SUW2 Adenine phosphoribosyltransferase 34.6e-7479.89Show/hide
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        E+DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITT+LLD KAFKDTIDLFVERYR+K+ISVVAGIEARGF+FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY L
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        EYG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTL AAI LLERVG EVVECACVIEL  LKGR+RL  +PL +LV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27450.1 adenine phosphoribosyl transferase 19.4e-8375.24Show/hide
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        VLV +A
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AT1G27450.2 adenine phosphoribosyl transferase 12.3e-8181.87Show/hide
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        MA+ + QDPRIAKI+ +IRVIPDFPKPGI+FQDITTLLLDT+AFKDTI LFV+RY++K ISVVAG+EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG+VIS
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        EEYSLEYGTD +EMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL AAIRLLERVGV++VECACVIEL  LKG+E+LG+  LFVLV +A
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AT1G27450.3 adenine phosphoribosyl transferase 12.4e-7871.9Show/hide
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        D EMA+ + QDPRIAKI+ +IRVIPDFPKPGI+FQDITTLLLDT+AFKDTI LFV+RY++K ISVVAG+EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG 
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Query:  ------------------------EVISEEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGD
                                +VISEEYSLEYGTD +EMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL AAIRLLERVGV++VECACVIEL  LKG+E+LG+
Subjt:  ------------------------EVISEEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGD

Query:  RPLFVLVNAA
          LFVLV +A
Subjt:  RPLFVLVNAA

AT4G12440.2 adenine phosphoribosyl transferase 46.8e-7375.42Show/hide
Query:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVIS
        M+    +DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITTLLLD KAFKDTIDLFVERYR+ +ISVVAGIEARGFIFG PIALAIGAKFVP+RKPKKLPG++I 
Subjt:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVIS

Query:  EEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV
        EEY LEYG+D++EMHV AV++G+RALV+DDLIATGGTL AA+ LL+RVG EV+ECACVIEL  LKGRERL  +PL+VLV
Subjt:  EEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV

AT4G22570.1 adenine phosphoribosyl transferase 33.2e-7579.89Show/hide
Query:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSL
        E+DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITT+LLD KAFKDTIDLFVERYR+K+ISVVAGIEARGF+FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY L
Subjt:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSL

Query:  EYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV
        EYG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTL AAI LLERVG EVVECACVIEL  LKGR+RL  +PL +LV
Subjt:  EYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCAGTCTCCAATCTCACTTCCTCACTTCCTCTTTCGCCGTCACCGTCACCGTCGCACTGCAGGACCACCGCGGTCTTCACTCCTCGTCGACGGATCGGTTCTTC
GTCAACAGCCGTCGGCGGCGCTTTCTCGTCGTGTCGTAAACATTTGACTCGCTTTCCACAGCATCGATCTTCGTTTTGGCCTCTGCGATGCAATGTGAGGGAGACGGTGC
CGGATCAAGAAATGGCGTCCACCAATGAACAAGACCCACGCATAGCCAAAATCTCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCAGATTTTCCTAAACCAGGGATTTTGTTTCAGGAT
ATTACAACTTTGCTTCTTGATACAAAGGCCTTCAAGGATACTATCGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGAGAAGGATATCTCTGTCGTCGCTGGAATTGAGGCGAGAGG
GTTCATTTTTGGCCCTCCGATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAGAAAACCGAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCATTTCAGAAGAGTACTCTTTAGAGT
ATGGAACCGATAAAATGGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGAGAACGTGCTCTTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGGGAACCTTGCGTGCAGCAATAAGG
CTACTTGAGCGAGTTGGCGTTGAGGTGGTCGAGTGTGCATGTGTGATCGAGCTGGATGGACTAAAGGGCCGTGAACGATTGGGAGACAGACCTCTATTCGTTCTAGTTAA
TGCAGCAGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAATCAGTCTCCAATCTCACTTCCTCACTTCCTCTTTCGCCGTCACCGTCACCGTCGCACTGCAGGACCACCGCGGTCTTCACTCCTCGTCGACGGATCGGTTCTTC
GTCAACAGCCGTCGGCGGCGCTTTCTCGTCGTGTCGTAAACATTTGACTCGCTTTCCACAGCATCGATCTTCGTTTTGGCCTCTGCGATGCAATGTGAGGGAGACGGTGC
CGGATCAAGAAATGGCGTCCACCAATGAACAAGACCCACGCATAGCCAAAATCTCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCAGATTTTCCTAAACCAGGGATTTTGTTTCAGGAT
ATTACAACTTTGCTTCTTGATACAAAGGCCTTCAAGGATACTATCGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGAGAAGGATATCTCTGTCGTCGCTGGAATTGAGGCGAGAGG
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TGCAGCAGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSVSNLTSSLPLSPSPSPSHCRTTAVFTPRRRIGSSSTAVGGAFSSCRKHLTRFPQHRSSFWPLRCNVRETVPDQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQD
ITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIR
LLERVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLVNAAG