; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10005233 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10005233
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionX8 domain-containing protein
Genome locationChr07:703681..705174
RNA-Seq ExpressionHG10005233
SyntenyHG10005233
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572453.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-10291.2Show/hide
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XP_031744909.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 isoform X1 [Cucumis sativus]3.5e-10493.21Show/hide
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XP_038887351.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.2e-10694.98Show/hide
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XP_038887352.1 major pollen allergen Ole e 10-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.2e-10694.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M5 X8 domain-containing protein7.1e-10390.99Show/hide
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A0A0A0K8Y4 X8 domain-containing protein1.1e-10392.31Show/hide
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A0A1S4DWJ2 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like2.9e-10493.64Show/hide
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A0A5A7SSE1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like2.9e-9695.45Show/hide
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A0A6J1D2V3 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like1.7e-9689.81Show/hide
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        LLLLT+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P52409 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase6.3e-1641.96Show/hide
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        S + T SP    +P     PS G  WC+A   A+   LQ  ++YACG+   DC  IQ+G +C++PN++  HASY  N+YYQ N   + +C+F GT ++TS
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        +DPS   C+Y S
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Q84V39 Major pollen allergen Ole e 103.7e-1641.59Show/hide
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        P  T     P   SP    P      WC+    A+   LQ  +DY C   G DC  IQA  +C+NPNT+  HASYA NS+YQ K      C+F GT  IT
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        S+DPS  +C + S
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Q9FJU9 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 132.8e-1642.74Show/hide
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        S   SSG+  SWCIAS  AS++ L+ ALD+ACG G  DC+AIQ  Q C+ P+T+  HAS+ FNSY+Q+N   + +C+FGG  V  + DPS   C Y +  
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              N T +  +T   +  S+P
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 12.6e-1742.4Show/hide
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        S ASWC+     S   LQ  LDYACG  G DC+  +  QSC+NP+ +  H +YA NS++Q K   P SCNF GTA  T++DPS   C + ++++ SS   
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Query:  --VLNTTNSKGSTVFGAVPSSPSPS
             TTN KGS     +P S + S
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Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 38.0e-1938.78Show/hide
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        ++  ++CIA +   +K LQ ALD+ACG G  DCSA+  G+SCY P+ +  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+TDPS   C +  ++ S+  L
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Query:  -NTTN----SKGSTVFGAVPSSPSPSAATCQEINVLQQLLLLTIVSL
         N T+    S  ST  G +P       A+  ++ +L  LL++ +V L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.5e-2542.78Show/hide
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        P+ T      TP  T P   ++NP    P   P+ T     P +  P  S+ PS SG SWC+A   ASQ +LQ ALDYACG    DCS +Q G +CY+P 
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Query:  TIYDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQY---TSTSTSSSVLNTTNSKGSTVFGAVPSSPSPSAAT
        ++  HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +T+PST +C Y   +STST  +   TT +  +      P + +P   T
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.1e-2855.08Show/hide
Query:  WCIASQSASQKALQIALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIYDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLNTTNSK
        WCIA  +AS  +LQ+ALDYACGYGG DC  IQ G +CY PNTI DHAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TSTDPS  +C ++S+S + S  +  +  
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Query:  GSTVFGAVPSSPSPSAAT
            F + PSS  P   T
Subjt:  GSTVFGAVPSSPSPSAAT

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.9e-3747.12Show/hide
Query:  QRDITTPITTVPTIILSNPTVSTPFINPTSTSDTYSPAMESPKRSSPPSSGA-----SWCIASQSASQKALQIALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNT
        ++DITTP+ T       NPT +   + P S SD  + A       S P   A     SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G +CYNPN+
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Query:  IYDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLNTTNSKGSTVFGAVPS--SPSPSAATCQEINVLQQLLLL
        +  HAS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS  +C + STSTS S+LN T+  G  +FG +PS  +P P A+T     ++  L  L
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.1e-2850.74Show/hide
Query:  QRDITTPITTVPTIILSNPTVSTPFINPTSTSDTYSPAMESPKRSSPPSSGA-----SWCIASQSASQKALQIALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNT
        ++DITTP+ T       NPT +   + P S SD  + A       S P   A     SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G +CYNPN+
Subjt:  QRDITTPITTVPTIILSNPTVSTPFINPTSTSDTYSPAMESPKRSSPPSSGA-----SWCIASQSASQKALQIALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNT

Query:  IYDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPS
        +  HAS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS
Subjt:  IYDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPS

AT4G13600.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.9e-2047.86Show/hide
Query:  SSGASWCIASQSASQKALQIALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIYDHASYAFNSYYQKNPV-PNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVL
        SS A WC+A    + +ALQ ALDYAC   G DC+ IQ    C+ PNT+  HASYAFNSY+Q+  + P SCNF GT+ I  TDPS  +C Y      +SV 
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Query:  NTTNSKGSTVFGAVPSS
        N   S  +T  G  PS+
Subjt:  NTTNSKGSTVFGAVPSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAGGACACACGAGAGAGCTAAACCATGAGAATCAGAAATTCAGTTCCCCAATCTCAACCACTCAAAGAGATATCACCACCCCTATAACAACTGTTCCCACAATAAT
TCTTTCCAATCCCACCGTGTCAACTCCATTTATCAATCCAACTTCAACCTCGGACACGTATTCTCCGGCCATGGAATCTCCCAAAAGATCATCTCCACCATCTTCAGGGG
CTAGCTGGTGCATTGCTAGTCAAAGTGCATCACAAAAGGCATTGCAAATTGCTCTAGATTACGCATGTGGCTATGGTGGTACTGACTGCTCAGCAATTCAAGCTGGTCAG
AGCTGTTACAACCCAAACACCATTTATGATCATGCCTCCTACGCCTTCAATAGCTACTATCAAAAGAATCCTGTCCCAAATAGCTGTAACTTTGGTGGGACTGCCGTCAT
TACTAGCACTGACCCAAGTACTATGGCCTGTCAGTACACATCCACTAGCACAAGTTCATCAGTTCTGAACACCACAAATTCCAAGGGATCAACAGTGTTTGGTGCTGTAC
CCTCAAGCCCCTCTCCTTCAGCAGCAACTTGTCAAGAAATAAATGTTCTGCAACAATTATTGTTGTTGACCATAGTTTCTCTCAGATTATTACACAACAACAATCTTCAT
GGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTGHTRELNHENQKFSSPISTTQRDITTPITTVPTIILSNPTVSTPFINPTSTSDTYSPAMESPKRSSPPSSGASWCIASQSASQKALQIALDYACGYGGTDCSAIQAGQ
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