; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10005717 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10005717
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionPolyprenol reductase
Genome locationChr07:5030587..5034319
RNA-Seq ExpressionHG10005717
SyntenyHG10005717
Gene Ontology termsGO:0006488 - dolichol-linked oligosaccharide biosynthetic process (biological process)
GO:0016095 - polyprenol catabolic process (biological process)
GO:0019408 - dolichol biosynthetic process (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0003865 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001104 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal
IPR039698 - Polyprenol reductase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148545.1 polyprenol reductase 2 [Cucumis sativus]2.0e-13971.43Show/hide
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XP_008444886.1 PREDICTED: polyprenol reductase 2 [Cucumis melo]1.7e-13870.63Show/hide
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XP_022971054.1 polyprenol reductase 2-like [Cucurbita maxima]2.7e-12866.4Show/hide
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          T A L L                 C+  I                          EVYHF A+G+AQFIV+GK QM D EV+LLDAVIPL+NLGW QW
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XP_038888380.1 polyprenol reductase 2 isoform X1 [Benincasa hispida]3.1e-14071.69Show/hide
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XP_038888381.1 polyprenol reductase 2 isoform X2 [Benincasa hispida]3.1e-14071.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5R7 Polyprenol reductase9.8e-14071.43Show/hide
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A0A1S3BBF0 Polyprenol reductase8.3e-13970.63Show/hide
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A0A6J1C196 Polyprenol reductase4.1e-12264.55Show/hide
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A0A6J1F6C0 Polyprenol reductase3.3e-12765.87Show/hide
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A0A6J1I5R2 Polyprenol reductase1.3e-12866.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XWN6 Polyprenol reductase 15.7e-6841.82Show/hide
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                                                         PL L       PE  E   ++   +A+FIV+G+ +MPD  ++    + PL 
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Query:  NLGWLQWIGTALFFWGWIHQRRCHQILGSLRVRREQSEEYRIPYGDWFEIVSSPHYLAEIVIYGGLVVASGGEDFTIWLLFGFVV
         LGW QWIG  +F WG +HQ RCH ILG+LR  ++ S+EY IP GDWF  VS PHYLAE+VIY G++VASGGED  +W LF FV+
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Q7F0Q2 Polyprenol reductase 21.6e-6240.78Show/hide
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        LL  AWIA  LPII A LP  T    +  R +L  F+ RGKT++          SS  KFTVPQK+F HFYV+ V+ TT+LL   W YAY+  TP + E 
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         ++  I S L  GS+SFS+ + +S    H++ VW+ VF LLLMEVQVLRRLYET ++F+YSP ARMHI GYLTGL + +A+                   
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                                                         PL L       PE  E +      + +F+V+G+ +MPD  ++    + PL 
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         LGW QWIG  +F WG +HQ RCH ILGSLR  ++  +EY IP GD F  VS PHYLAE+VIY G++VASG ED  +W LF FV+
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Q7XUH5 Polyprenol reductase 15.7e-6841.82Show/hide
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        LL  AWIA  LPIIVA LP       +  R +L  F+ RGKT++          SS  KFTVPQK+F HFYV+ V+ TT+LL   W YAY+  TP + E 
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         ++  I S L  GS+SFS+ +  S    H++ VW+ VF+LLLME+QVLRRLYET ++F+YSPSARMHI GYLTGL + +A+                   
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                                                         PL L       PE  E   ++   +A+FIV+G+ +MPD  ++    + PL 
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         LGW QWIG  +F WG +HQ RCH ILG+LR  ++ S+EY IP GDWF  VS PHYLAE+VIY G++VASGGED  +W LF FV+
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Q9CAH5 Polyprenol reductase 11.5e-7344.09Show/hide
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        ME+ IVWL++AA    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFTVPQKFF HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA             
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Query:  PAITSQLTGGSSSFSWQKSQSSRREHRFLVWKAVFLLLLMEVQVLRRLYETIYIFNYSPSARMHIFGYLTGLLFSLASFWYFGPRFNNAVERLSARIKIE
             ++ GGS  FS+  +     EHRF V +AVFLLLLME+ VLRR+ E+ Y+F YS SARMHI  Y+  L + +A+                      
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Query:  NLGVLITNATLLLQKWHSTSKIVIRRHGFECAISILIISLQSKKVFPLRLIVGKDSNPECHEVYHFVASGLAQFIVQGKRQMPDGEVNLLDAVIPLSNLG
                                                      PL L      +    EV  FV S +A+FI  GK    D   NLL ++ PL  LG
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Query:  WLQWIGTALFFWGWIHQRRCHQILGSLRVRREQSEEYRIPYGDWFEIVSSPHYLAEIVIYGGLVVASGGEDFTIWLLFGFV
         LQWIG A+F WGWIHQRRCH ILGSLR    Q++EY IPYGDWFE+VS PH+LAEIV+Y GL+++SGG D +IWLLFGFV
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Q9SI62 Polyprenol reductase 21.2e-8647.51Show/hide
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        +EL IVWL+R A    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFT+PQK F HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA    P  SE F  
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Query:  PAITSQLTGGSSSFSWQKSQSSRREHRFLVWKAVFLLLLMEVQVLRRLYETIYIFNYSPSARMHIFGYLTGLLFSLASFWYFGPRFNNAVERLSARIKIE
          I S+L GGS  FS  KS  +  EHRF VW+AVFLLLLME+ VLRRL E+ Y+F YSPSARMHI GY  GL F + +                      
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Query:  NLGVLITNATLLLQKWHSTSKIVIRRHGFECAISILIISLQSKKVFPLRLIVGKDSNPECHEVYHFVASGLAQFIVQGKRQMPDGEVNLLDAVIPLSNLG
                                                      PL L      +    EV  FV + +A+FI  GK      E NLL ++ PL  LG
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Query:  WLQWIGTALFFWGWIHQRRCHQILGSLRVRREQSEEYRIPYGDWFEIVSSPHYLAEIVIYGGLVVASGGEDFTIWLLFGFV
         LQWIG A+F WGWIHQRRCH ILGSLR    Q++EY IPYGDWF +VSSPH+LAEIV+Y GL++ASGG D TIWLLFGFV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72590.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein1.1e-7444.09Show/hide
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        ME+ IVWL++AA    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFTVPQKFF HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA             
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Query:  PAITSQLTGGSSSFSWQKSQSSRREHRFLVWKAVFLLLLMEVQVLRRLYETIYIFNYSPSARMHIFGYLTGLLFSLASFWYFGPRFNNAVERLSARIKIE
             ++ GGS  FS+  +     EHRF V +AVFLLLLME+ VLRR+ E+ Y+F YS SARMHI  Y+  L + +A+                      
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                                                      PL L      +    EV  FV S +A+FI  GK    D   NLL ++ PL  LG
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         LQWIG A+F WGWIHQRRCH ILGSLR    Q++EY IPYGDWFE+VS PH+LAEIV+Y GL+++SGG D +IWLLFGFV
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AT2G16530.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein8.6e-8847.51Show/hide
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        +EL IVWL+R A    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFT+PQK F HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA    P  SE F  
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          I S+L GGS  FS  KS  +  EHRF VW+AVFLLLLME+ VLRRL E+ Y+F YSPSARMHI GY  GL F + +                      
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                                                      PL L      +    EV  FV + +A+FI  GK      E NLL ++ PL  LG
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         LQWIG A+F WGWIHQRRCH ILGSLR    Q++EY IPYGDWF +VSSPH+LAEIV+Y GL++ASGG D TIWLLFGFV
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AT2G16530.2 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein1.1e-8547.24Show/hide
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        +EL IVWL+R A    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS +FT+PQK F HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA    P  SE F  
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          I S+L GGS  FS  KS  +  EHRF VW+AVFLLLLME+ VLRRL E+ Y+F YSPSARMHI GY  GL F + +                      
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                                                      PL L      +    EV  FV + +A+FI  GK      E NLL ++ PL  LG
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         LQWIG A+F WGWIHQRRCH ILGSLR    Q++EY IPYGDWF +VSSPH+LAEIV+Y GL++ASGG D TIWLLFGFV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTGGGAATTGTTTGGCTTCTTAGAGCTGCTTGGATTGCAGGAATGTTGCCTATAATTGTAGCTTTCTTACCGTTCTCTACACTGAATTGGTTTCGTGGAATTCT
GTTGGGGTTTGCGAAGAGAGGGAAGACCTTGCAATCGTCTTCTAGGAAATTCACTGTACCTCAGAAATTCTTCTGCCACTTTTATGTTTTGGCTGTTATCTGGACAACCT
TGTTGCTAGGAACAACTTGGATCTATGCATATGTATCAACCCCGGAAATCTCAGAGCCATTTAACTTTCCTGCCATTACCAGCCAGTTGACTGGAGGTTCAAGTTCGTTT
TCATGGCAAAAATCTCAATCATCTCGGAGGGAACACAGATTCCTGGTCTGGAAAGCTGTTTTTCTGCTTTTATTAATGGAAGTTCAAGTTTTGAGACGTCTTTATGAAAC
AATATACATTTTCAACTATAGTCCCTCGGCTCGGATGCATATCTTTGGATATTTAACCGGCTTGTTGTTTAGTTTGGCTAGTTTTTGGTATTTTGGACCCCGTTTTAATA
ATGCTGTGGAAAGACTTAGTGCTAGGATCAAGATAGAAAATCTTGGTGTTTTGATCACGAATGCAACACTTTTACTACAAAAATGGCATTCTACATCCAAAATAGTCATA
AGAAGACATGGTTTTGAGTGTGCTATCTCGATCTTGATCATCTCCTTGCAAAGTAAAAAGGTTTTCCCTCTTCGGTTGATCGTGGGCAAGGATTCAAACCCCGAATGCCA
TGAAGTGTATCACTTTGTCGCAAGTGGGCTAGCTCAATTTATTGTTCAAGGAAAAAGGCAAATGCCTGATGGTGAAGTCAACCTGTTGGATGCTGTGATTCCTCTATCAA
ATTTAGGGTGGCTTCAGTGGATTGGTACAGCTTTATTCTTTTGGGGTTGGATTCATCAGCGTCGTTGCCATCAGATTCTGGGCTCACTGCGGGTACGTAGAGAACAATCT
GAAGAGTATAGAATTCCTTATGGTGATTGGTTCGAAATCGTGTCTTCTCCACACTATCTCGCTGAGATTGTTATATATGGTGGACTTGTAGTTGCTAGTGGAGGAGAAGA
TTTCACAATCTGGCTACTTTTTGGATTTGTGGTGAGAATCTTATTTGTTAAGAGAATTAAACTACAGTTTGTTTCTTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EEYRIPYGDWFEIVSSPHYLAEIVIYGGLVVASGGEDFTIWLLFGFVVRILFVKRIKLQFVSL