CuGenDBv2

Gene ID	HG10006077
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like
Genome location	Chr07:13085401..13088698
RNA-Seq Expression	HG10006077
Synteny	HG10006077
Gene Ontology terms	GO:0006470 - protein dephosphorylation (biological process) GO:0050790 - regulation of catalytic activity (biological process) GO:0000159 - protein phosphatase type 2A complex (cellular component) GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function) GO:0019888 - protein phosphatase regulator activity (molecular function)
InterPro domains	IPR002048 - EF-hand domain IPR011992 - EF-hand domain pair IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0049945.1 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008441828.1 PREDICTED: serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like [Cucumis melo]

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XP_022149824.1 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like [Momordica charantia]

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XP_023546201.1 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038889903.1 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like [Benincasa hispida]

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A0A1S3B4B9 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like

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A0A5A7U8K3 Serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like

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A0A6J1D867 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like

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A0A6J1EV10 serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like

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Q5QIT3 Serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta

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Q84JI6 Probable serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''epsilon

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Q8VZQ4 Probable serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''gamma

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Q9SLI8 Probable serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''delta

2.5e-127

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Q9XGR4 Serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''alpha

2.2e-123

85.89

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Arabidopsis top hits

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AT1G54450.1 Calcium-binding EF-hand family protein

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AT5G28850.1 Calcium-binding EF-hand family protein

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        TLT+WDRFAHREYIRLSMEEDVEDASNGSAEVWD+ SLEAPF
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AT5G28850.2 Calcium-binding EF-hand family protein

2.1e-129

90.91

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        M HADEEEDINKVLRYFSYEHFYVIYCKFWELD DHDFLIDKENL++YGNHALTYRIVDRIFSQV RKFTSKVEG+MGYEDFVYFIL+EEDKSS PSLEY
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Query:  WFKCIDLDGNGILTRNELQFFYEEQLHRMECMAQEPVLFEDILCQIIDMIGPESETYITLRDLKGCKLSGSVFNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENP
        WFKCIDLD NGI+TRNE+QFFYEEQLHRMECMAQE VLFEDILCQ+IDMIGPE+E++ITL DLKG KLSG+VFNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENP
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Query:  TLTEWDRFAHREYIRLSMEEDVEDASNGSAEVWDE-SLEAPF
        TLT+WDRFAHREYIRLSMEEDVEDASNGSAEVWD+ SLEAPF
Subjt:  TLTEWDRFAHREYIRLSMEEDVEDASNGSAEVWDE-SLEAPF

AT5G28900.1 Calcium-binding EF-hand family protein

2.1e-129

90.91

Show/hide

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        M HADEEEDINKVLRYFSYEHFYVIYCKFWELD DHDFLIDKENL++YGNHALTYRIVDRIFSQV RKFT+KVEG+MGYEDFVYFIL+EEDKSS PSLEY
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Query:  WFKCIDLDGNGILTRNELQFFYEEQLHRMECMAQEPVLFEDILCQIIDMIGPESETYITLRDLKGCKLSGSVFNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENP
        WFKCIDLD NGI+TRNE+QFFYEEQLHRMECMAQE VLFEDILCQ+IDMIGPE+E++ITL DLKG KLSG+VFNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENP
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Query:  TLTEWDRFAHREYIRLSMEEDVEDASNGSAEVWDE-SLEAPF
        TLT+WDRFAHREYIRLSMEEDVEDASNGSAEVWDE SLEAPF
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AT5G44090.1 Calcium-binding EF-hand family protein

1.6e-124

85.89

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        MQ  DEE+DINKV+RYFSYEHFYVIYC+FWELD DHDFLIDKENLIKYGNHALTYRIVDRIFSQVPRKFTSKVEG+M YEDF YFIL+EEDKSSEPSLEY
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        WFKCIDLDG+G++T NE+QFFYEEQLHRMEC+ QEPVLFEDILCQI DMI PE E  ITL+DLK  KLSG++FNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENP
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        TLTEWDRFA REY+RLSMEEDVE+ SNGSA+VWDE LE+PF
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Sequences

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CDS sequence

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ATGCAACATGCTGATGAAGAAGAGGATATCAACAAAGTTTTGAGGTACTTTTCTTATGAGCATTTTTATGTAATATATTGTAAATTTTGGGAGCTGGACATGGACCATGA
TTTCTTGATTGACAAGGAGAACCTTATCAAATATGGAAATCATGCGCTTACCTACCGGATTGTTGATAGAATATTCTCTCAGGTTCCAAGAAAGTTTACTAGTAAGGTTG
AAGGTAGGATGGGATATGAAGATTTTGTTTATTTTATATTGTCTGAGGAAGATAAATCATCAGAGCCTAGCCTTGAGTATTGGTTCAAGTGCATAGATTTGGATGGTAAT
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TGATATGATTGGACCAGAGAGCGAGACTTATATCACTCTGCGTGATCTGAAAGGCTGCAAGCTTTCTGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTGAACAAGTTTATGG
CCTTCGAAACACGTGATCCATTTCTTATCCGCCAGGAACGTGAGAATCCTACTTTGACAGAGTGGGACCGTTTTGCGCATAGAGAATATATTAGGCTTTCTATGGAAGAA
GATGTGGAAGATGCCTCCAATGGAAGTGCAGAGGTTTGGGATGAGTCTCTTGAAGCTCCATTCTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MQHADEEEDINKVLRYFSYEHFYVIYCKFWELDMDHDFLIDKENLIKYGNHALTYRIVDRIFSQVPRKFTSKVEGRMGYEDFVYFILSEEDKSSEPSLEYWFKCIDLDGN
GILTRNELQFFYEEQLHRMECMAQEPVLFEDILCQIIDMIGPESETYITLRDLKGCKLSGSVFNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENPTLTEWDRFAHREYIRLSMEE
DVEDASNGSAEVWDESLEAPF

HG10006077 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome