CuGenDBv2

Gene ID	HG10006108
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	flavin mononucleotide hydrolase 1, chloroplatic
Genome location	Chr07:13825574..13829924
RNA-Seq Expression	HG10006108
Synteny	HG10006108
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR036412 - HAD-like superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KGN61249.1 hypothetical protein Csa_006768 [Cucumis sativus]

8.2e-31

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XP_008463344.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501525 [Cucumis melo]

2.0e-32

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XP_022937644.1 LOW QUALITY PROTEIN: flavin mononucleotide hydrolase 1, chloroplatic [Cucurbita moschata]

3.1e-30

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XP_031737125.1 LOW QUALITY PROTEIN: flavin mononucleotide hydrolase 1, chloroplatic [Cucumis sativus]

4.7e-34

63.57

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XP_038889795.1 flavin mononucleotide hydrolase 1, chloroplatic [Benincasa hispida]

3.0e-33

64.52

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0LJI0 Uncharacterized protein

4.0e-31

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A0A1S3B4G8 uncharacterized protein LOC103485900 isoform X2

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62.1

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A0A1S3CJE8 uncharacterized protein LOC103501525

9.5e-33

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A0A5A7TVY0 Phosphoglycolate phosphatase-like

3.4e-30

62.1

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A0A6J1FBS7 LOW QUALITY PROTEIN: flavin mononucleotide hydrolase 1, chloroplatic

1.5e-30

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q84VZ1 Flavin mononucleotide hydrolase 1, chloroplatic

3.2e-22

46.28

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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G79790.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein

2.3e-23

46.28

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Query:  LIALKERNYEMHAFTNYPIWF
        L  L   ++E+HAFTNYPIW+
Subjt:  LIALKERNYEMHAFTNYPIWF

AT1G79790.2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein

5.9e-11

65.85

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTACTGGTTGCAGCTCTGATGGTGGTGATAGCACCTCTAGGAAGCTTCCTGTTCTGCTCTTTGACATCATGGATACCCTCGTTCGTGATCCCTTCTATGATGACGT
TCCCGCCTTTTTCAGCATCTATGTCTTTGTTGGCCTTATGTGGAAGTGTACTTTTTCTCAACTTCAAGTAGATGGAAAGATGAAGAGGCAGCTGGATACCCTGTCTAACT
GCTTGCACAAAGGCCTCAAAAACTGTATGATAAGCGGTTACTCTTACCTAGAAGGCATTGAAGAATTGCTAATTGCACTTAAAGAGAGAAACTATGAAATGCATGCCTTC
ACAAACTACCCTATTTGGTTCGTGGGAAAAGAATTATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATGCSSDGGDSTSRKLPVLLFDIMDTLVRDPFYDDVPAFFSIYVFVGLMWKCTFSQLQVDGKMKRQLDTLSNCLHKGLKNCMISGYSYLEGIEELLIALKERNYEMHAF
TNYPIWFVGKEL

HG10006108 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome