CuGenDBv2

Gene ID	HG10006211
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	40S ribosomal protein S8
Genome location	Chr07:15867213..15868826
RNA-Seq Expression	HG10006211
Synteny	HG10006211
Gene Ontology terms	GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process) GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR001047 - Ribosomal protein S8e IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6598870.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.2e-112

97.26

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

KAG7029811.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.6e-112

96.8

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_008451649.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo]

6.9e-113

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]

9.0e-113

97.26

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]

9.0e-113

97.26

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKK+EEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LJA0 40S ribosomal protein S8

1.7e-112

96.8

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S8

3.3e-113

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S8

3.3e-113

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1EP23 40S ribosomal protein S8

4.4e-113

97.26

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S8

4.4e-113

97.26

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEA TRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQR+IEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O81361 40S ribosomal protein S8

9.7e-102

86.88

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKE--EEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEG
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKK TA+AKK+  EEG+A TEE KKSNHV  ++EKRQQ R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEG
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKE--EEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEG

Query:  KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S8

5.7e-102

87.33

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEG---DAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A AKK+ EG   +A TEE KKSNHV R++EKRQQ R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEG---DAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S8

3.7e-101

85.52

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEG---DAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +A  EE KKSNHV R++EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEG---DAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-1

3.2e-97

81.45

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKE-EEGD----AVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+ +S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ R+I  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKE-EEGD----AVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-2

5.5e-97

84.09

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEA TRKTRILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAV-TEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK          G+AV TEEVKKSNHVQR++E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAV-TEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein

2.3e-98

81.45

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKE-EEGD----AVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+ +S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ R+I  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKE-EEGD----AVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein

3.9e-98

84.09

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEA TRKTRILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAV-TEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK          G+AV TEEVKKSNHVQR++E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAV-TEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAGAGGCGCGCCACTGGTGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGAAAAAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAA
GTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTCGAGTTCGTGGTGGTAATGTGAAGTGGCGCGCTTTTAGGCTGGATACTGGAAACTACTCTTGGGGTAGTGAGGCTGGGA
CTAGAAAGACCCGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCAAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTGGTGAAAAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCGGCACCATTT
AAACAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGACGGAAGAAGAAGACCACAGCCTCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGTCACTGAGGAGGTAAAGAA
GAGTAACCATGTCCAGCGCGAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGTAAGCTCGATCCGCATATTGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAA
GGCCTGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGGTATATATTGGAGGGCAAAGAGCTTGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAGTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPF
KQWYLQHYGVDIGRKKKTTASAKKEEEGDAVTEEVKKSNHVQREIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

HG10006211 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome