; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10006391 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10006391
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationChr07:18035483..18035842
RNA-Seq ExpressionHG10006391
SyntenyHG10006391
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048028.1 Rapid ALkalinization Factor [Cucumis melo var. makuwa]7.7e-5894.12Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNSPTFFLI AAVF+IFSCSSTAVHAG+GI +SLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-5894.12Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]2.0e-5894.12Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]2.4e-5994.96Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]3.0e-62100Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein6.8e-6095.8Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNSPTFFLICAAVF+IFSCSST VHAGLGI HSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor3.7e-5894.12Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNSPTFFLI AAVF+IFSCSSTAVHAG+GI +SLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1DA82 protein RALF-like 331.2e-5691.6Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGF+SPT FLICAAVFV+F+CSSTAVH GLGIHHSLAWIP+QS+CKGSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 339.8e-5994.12Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.2e-5994.96Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.4e-3060.33Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      + A +    S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        C+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor9.2e-3059.83Show/hide
Query:  PTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWI-PNQS--TCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGA
        P+  ++C  +   F   + A  +G     +  W+ P +S   CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGA
Subjt:  PTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWI-PNQS--TCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGA

Query:  QANPYSRGCSAITRCRS
        QANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QANPYSRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.0e-2968.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 226.6e-2878.95Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 16.4e-3163.79Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + V+F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 14.5e-3263.79Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + V+F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.2e-1655.42Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC
        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 224.7e-2978.95Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.5e-3068.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 331.0e-3160.33Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      + A +    S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        C+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTTATCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGCCTCGGGATCCACCACAGTCT
TGCATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCCACTAGCC
AGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCTTACTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGCCGTGGA
TGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTTATCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGCCTCGGGATCCACCACAGTCT
TGCATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCCACTAGCC
AGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCTTACTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGCCGTGGA
TGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRG
CSAITRCRS