; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10007008 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10007008
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationChr10:290324..296144
RNA-Seq ExpressionHG10007008
SyntenyHG10007008
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function)
GO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050962.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-23288.84Show/hide
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A0A5D3CJ91 ATP citrate synthase6.9e-23389.06Show/hide
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A0A6J1HYY6 ATP citrate synthase3.4e-23288.84Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRL NIDLQICSAQVNQSTDF ELTNNEPWLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVK RLGVQVEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T EACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFSVFQDLDF+FLEMN
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        PFTLVN EPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE+KLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
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                                                   VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 32.3e-21782.07Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDFTELTN E WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVKARLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F+VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+ EP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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                                                   V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 33.0e-21781.76Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDFTEL N EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKT+FLPTEK  T +ACAPLIATLPLE+R KIGDFI GV+SVFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VN EPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNI+FPLPFGRVL+P+ESF+H LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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                                                   V+GPEATMTGICKQAI+CIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 21.7e-22083.05Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDFTEL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF+VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VN EPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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                                                   V+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 12.1e-20278.16Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDFTEL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFL TEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF+VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VN EPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL 
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        NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+
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Query:  EREKGCIGGRGDVEEYKTELQLLRLSLDMVYAFCLKLTALSPTQVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        E                                           V+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 19.0e-19873.61Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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                                                   V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-31.6e-21882.07Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDFTELTN E WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVKARLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F+VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+ EP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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                                                   V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-16.4e-19973.61Show/hide
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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                                                   V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-16.4e-19973.61Show/hide
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        PFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  REKGCIGGRGDVEEYKTELQLLRLSLDMVYAFCLKLTALSPTQVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
                                                   V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-16.4e-19973.61Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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                                                   V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-25.4e-19872.96Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGGI+IEENWDKVKTI +PT    T E CAPL+ATLPLEI+G++ DFI  +F++F+DLDF+FLEMN
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        PFTLV+ +PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV++ TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
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                                                   V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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