CuGenDBv2

Gene ID	HG10007351
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1639)
Genome location	Chr10:4060526..4062509
RNA-Seq Expression	HG10007351
Synteny	HG10007351
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008451016.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492424 isoform X1 [Cucumis melo]

6.2e-19

48.87

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        +SI SPT+NQRTT+T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEK S+DHPTGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSM+SDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

XP_008451017.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492424 isoform X2 [Cucumis melo]

6.2e-19

48.87

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        +SI SPT+NQRTT+T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEK S+DHPTGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSM+SDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

XP_022960630.1 uncharacterized protein LOC111461360 [Cucurbita moschata]

1.4e-18

48.87

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        ++IVSPTNNQRT++T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEKAS++H TGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSMDSDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

XP_023515869.1 uncharacterized protein LOC111779905 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

4.7e-19

49.62

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        ++IVSPTNNQRT++T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEKAS+DH TGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSMDSDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

XP_038879793.1 uncharacterized protein LOC120071537 [Benincasa hispida]

1.5e-20

51.13

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        +SIV+PTNNQRTT+T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEKASMDHPTGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSMDS+SE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LZ81 Uncharacterized protein

1.1e-18

48.12

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        +SI SPT+NQRTT+T+PEKEDRYYTTRGSMG+D+K SMDHP GNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSM+SDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

A0A1S3BPZ2 uncharacterized protein LOC103492424 isoform X1

3.0e-19

48.87

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        +SI SPT+NQRTT+T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEK S+DHPTGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSM+SDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

A0A1S3BQL5 uncharacterized protein LOC103492424 isoform X2

3.0e-19

48.87

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        +SI SPT+NQRTT+T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEK S+DHPTGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSM+SDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

A0A6J1H9M1 uncharacterized protein LOC111461360

6.6e-19

48.87

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        ++IVSPTNNQRT++T+PEKEDRYYTTRGSMG+DEKAS++H TGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSMDSDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

A0A6J1JCG4 uncharacterized protein LOC111485516

1.1e-18

49.62

Show/hide

Query:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------
        ++IVSPTNNQRT++T+ EKEDRYYTTRGSMG+DEKASMDH TGNDRKG    +  I     + EE F         + P    + L  S  L +      
Subjt:  RSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPC---QIEESF---------RYPFGSFEKLANSFRLCV------

Query:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        D  ++   +  +   +KRPRGLKAMRSMDSDSE
Subjt:  DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G55340.1 Protein of unknown function (DUF1639)

1.0e-08

36.3

Show/hide

Query:  SPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPCQI---------EESFRYPFG--------SFEKLANSFRLCV-----
        S  N +R+ + +PEKEDRYYTTRGSMGIDE   +       ++  KE KK +  ++         EE F    G           KL     L V     
Subjt:  SPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPCQI---------EESFRYPFG--------SFEKLANSFRLCV-----

Query:  --DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
          D  ++   +  +   +KRPRGLKAM SM+SDSE
Subjt:  --DAARDARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

AT1G55340.2 Protein of unknown function (DUF1639)

6.8e-08

35.66

Show/hide

Query:  RTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPCQI---------EESFRYPFG--------SFEKLANSFRLCV-------DAAR
        ++ + +PEKEDRYYTTRGSMGIDE   +       ++  KE KK +  ++         EE F    G           KL     L V       D  +
Subjt:  RTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPCQI---------EESFRYPFG--------SFEKLANSFRLCV-------DAAR

Query:  DARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE
        +   +  +   +KRPRGLKAM SM+SDSE
Subjt:  DARFMAIRFVPRKRPRGLKAMRSMDSDSE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTAAAAACTAACTGTGACCCATTAATCTTTAATGTCTCTTCTTCCATTCTAGCCATTTTTCTCTTCTTCTTCTTTGGAAGATTGTTTTGCCATTTCCATTTTTCTCT
CTGCGGGTTCATCGGTTCTTTTGCTACTGAGGATTCTTCTTCCATTGCAACTTTGGTGTTGATGATGAATAGCGATGGAGTAGAAGCTTTTGGACAGAATCTAAATGAAG
GAGTAGTTGATTTTGTTGCATCATCTTCTGGTAAATCATGTGTTTGGTTAATGATTGTTAATCCATTGAATGCAGGGTTATTAGAGGGAAATTGTGTTGATGATCCACTG
ATTTTTGGGCCTTGGATCTTGAGGAGCATTGTTTCACCAACTAACAATCAAAGAACAACCCTAACAACACCCGAAAAGGAAGATCGATACTATACGACCAGGGGTTCGAT
GGGCATTGATGAAAAAGCCTCAATGGATCACCCCACGGGAAACGACCGAAAAGGAGCCAAGGAGGAAAAGAAAGCAATCCCATGTCAGATCGAGGAATCCTTTCGGTATC
CTTTCGGTTCATTTGAAAAATTAGCTAACTCCTTTCGCTTGTGTGTGGATGCAGCTCGTGATGCCAGGTTCATGGCTATCAGATTTGTGCCAAGAAAGAGACCCAGAGGA
TTGAAGGCCATGAGAAGTATGGATAGTGACTCAGAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVKTNCDPLIFNVSSSILAIFLFFFFGRLFCHFHFSLCGFIGSFATEDSSSIATLVLMMNSDGVEAFGQNLNEGVVDFVASSSGKSCVWLMIVNPLNAGLLEGNCVDDPL
IFGPWILRSIVSPTNNQRTTLTTPEKEDRYYTTRGSMGIDEKASMDHPTGNDRKGAKEEKKAIPCQIEESFRYPFGSFEKLANSFRLCVDAARDARFMAIRFVPRKRPRG
LKAMRSMDSDSE

HG10007351 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome