CuGenDBv2

Gene ID	HG10007393
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	60S ribosomal protein L30
Genome location	Chr10:4423286..4424640
RNA-Seq Expression	HG10007393
Synteny	HG10007393
Gene Ontology terms	GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003723 - RNA binding (molecular function) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000231 - Ribosomal protein L30e IPR004038 - Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 IPR022991 - Ribosomal protein L30e, conserved site IPR029064 - 50S ribosomal protein L30e-like IPR039109 - Ribosomal protein L30/YlxQ

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAF8039682.1 hypothetical protein BT93_B2023 [Corymbia citriodora subsp. variegata]

7.5e-55

96.4

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKL+IIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKSMPGE
Subjt:  DSDIIKSMPGE

KAG6590249.1 60S ribosomal protein L30, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

5.7e-55

97.3

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PGE
Subjt:  DSDIIKSMPGE

XP_022157366.1 60S ribosomal protein L30 [Momordica charantia]

7.5e-55

97.3

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PGE
Subjt:  DSDIIKSMPGE

XP_022960585.1 60S ribosomal protein L30-like [Cucurbita moschata]

2.0e-55

97.32

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGES
        DSDIIKS+PGES
Subjt:  DSDIIKSMPGES

XP_038878626.1 60S ribosomal protein L30 [Benincasa hispida]

8.8e-56

98.21

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGES
        DSDIIKSMPGES
Subjt:  DSDIIKSMPGES

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1U8ENE7 60S ribosomal protein L30

6.2e-55

96.4

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKSMPG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

A0A3Q7J0N1 Ribosomal_L7Ae domain-containing protein

6.2e-55

96.4

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKSMPG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

A0A6J1DXV1 60S ribosomal protein L30

3.6e-55

97.3

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PGE
Subjt:  DSDIIKSMPGE

A0A6J1H9H7 60S ribosomal protein L30-like

9.5e-56

97.32

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGES
        DSDIIKS+PGES
Subjt:  DSDIIKSMPGES

A0A6J1JJ11 60S ribosomal protein L30-like

9.5e-56

97.32

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGES
        DSDIIKS+PGES
Subjt:  DSDIIKSMPGES

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O48558 60S ribosomal protein L30

1.7e-49

82.88

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV  KKTKK+ ++INN+L LVMKSGKYTLGYKTVL+TLRNSK KL+IIANNCPPLRKSEIEYYAML+KV VHH++G+NVDLGTACGKY+RVCCLSIIDPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIK+ PGE
Subjt:  DSDIIKSMPGE

O49884 60S ribosomal protein L30

1.2e-55

91.89

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLK+LR+SKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKYYRVCCLSI+DPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIK++PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

Q8VZ19 60S ribosomal protein L30-2

1.5e-50

83.78

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MVT KKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VLK+LR SKGKLI+I+ NCPPLR+SEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

Q9C8F7 Putative 60S ribosomal protein L30-1

5.8e-50

82.88

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VLK+LR+SKGKLI+I++NCPPLR+SEIEYYAML+KVGVHHYN +NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

Q9M5M6 60S ribosomal protein L30

9.5e-53

88.29

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKKTHESIN+RLALVMKSGK+TLGYKTVL++LR++KGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKY+RVCCLSIID G
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G36240.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein

4.1e-51

82.88

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV AKKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VLK+LR+SKGKLI+I++NCPPLR+SEIEYYAML+KVGVHHYN +NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

AT1G77940.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein

1.1e-51

83.78

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MVT KKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VLK+LR SKGKLI+I+ NCPPLR+SEIEYYAML+KVGVHHYNG+NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIKS+PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

AT3G18740.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein

1.3e-49

80.18

Show/hide

Query:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG
        MV  KK KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VLK+LR+SKGKLI+I++NCPPLR+SEIEYYAML+KVGVH YNG+NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSMPGE
        DSDIIK++PG+
Subjt:  DSDIIKSMPGE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTGACCGCAAAGAAGACGAAGAAGACACATGAGAGCATCAACAACAGACTCGCTCTCGTCATGAAGAGTGGGAAATATACCTTGGGATACAAAACCGTCCTCAAAAC
CTTGAGGAACTCTAAAGGTAAACTGATTATCATTGCTAACAACTGCCCTCCACTCCGAAAGTCCGAGATCGAATACTATGCGATGTTGTCGAAGGTTGGAGTTCATCATT
ACAACGGAAGCAATGTAGACCTCGGAACCGCTTGTGGCAAATACTACAGAGTATGCTGCCTCAGTATTATCGATCCCGGTGATTCGGATATTATCAAGAGCATGCCCGGA
GAAAGTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVTAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLKTLRNSKGKLIIIANNCPPLRKSEIEYYAMLSKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYYRVCCLSIIDPGDSDIIKSMPG
ES

HG10007393 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome