CuGenDBv2

Gene ID	HG10007651
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	SH3 domain-containing protein
Genome location	Chr10:9287205..9287919
RNA-Seq Expression	HG10007651
Synteny	HG10007651
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0035767.1 hypothetical protein E6C27_scaffold403G00450 [Cucumis melo var. makuwa]

4.5e-57

95.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSSTISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

XP_008442260.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486168 [Cucumis melo]

4.5e-57

95.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSSTISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

XP_011653942.1 uncharacterized protein LOC101209457 [Cucumis sativus]

2.2e-56

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSS ISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

XP_022158053.1 uncharacterized protein LOC111024631 [Momordica charantia]

3.0e-53

90.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPST SAGSTSTSA SV SSTIS++SNSSSS  PTALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVR NIMPQRQ+KKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

XP_038881318.1 uncharacterized protein LOC120072865 [Benincasa hispida]

4.5e-57

95.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSSTISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L427 Uncharacterized protein

1.1e-56

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSS ISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

A0A1S3B5A4 uncharacterized protein LOC103486168

2.2e-57

95.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSSTISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

A0A5A7T2H4 Uncharacterized protein

2.2e-57

95.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPSTTSAGSTST+ASSVQSSTISSSSNSSSSVLP+ALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

A0A6J1DV14 uncharacterized protein LOC111024631

1.5e-53

90.71

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPST SAGSTSTSA SV SSTIS++SNSSSS  PTALGKPAGEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVR NIMPQRQ+KKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

A0A6J1HA83 uncharacterized protein LOC111461543

9.5e-53

89.29

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH
        MDLITADPST SAGS ST+AS+V SST+SSSS+SSSSVLP++LGKP GEKRSKRAAL QIQNDTISAAKAAL PVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQ ARSIH
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIH

Query:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        ELAA SDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  ELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G07360.1 SH3 domain-containing protein

3.1e-40

72.54

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSV-LPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQ-SKKKPVSYSQWARS
        MDLI+ADP+   A STS+SASS  S   S+S++SSS +  P +     GEK+SKRA L QIQNDTIS AKAAL PV+ NIMPQRQ  KKKPVSYSQ ARS
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSV-LPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQ-SKKKPVSYSQWARS

Query:  IHELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        IHELAAT DQKSSQKQLV+HVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  IHELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

AT2G07360.2 SH3 domain-containing protein

3.1e-40

72.54

Show/hide

Query:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSV-LPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQ-SKKKPVSYSQWARS
        MDLI+ADP+   A STS+SASS  S   S+S++SSS +  P +     GEK+SKRA L QIQNDTIS AKAAL PV+ NIMPQRQ  KKKPVSYSQ ARS
Subjt:  MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSV-LPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQ-SKKKPVSYSQWARS

Query:  IHELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV
        IHELAAT DQKSSQKQLV+HVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLM+
Subjt:  IHELAATSDQKSSQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGATCTGATTACTGCCGACCCGTCAACGACTTCGGCGGGATCGACCTCCACATCTGCTTCATCGGTCCAGTCATCAACGATTAGTTCATCTTCAAATTCTTCCTCAAG
TGTTCTCCCCACTGCACTGGGGAAGCCAGCCGGAGAGAAGAGGTCTAAGAGGGCGGCACTGAGGCAGATCCAGAATGATACGATTTCTGCTGCTAAAGCAGCTTTGATTC
CTGTGAGGACCAACATTATGCCGCAGAGGCAGAGCAAGAAGAAGCCTGTTTCTTATTCCCAATGGGCTAGGAGTATCCATGAACTAGCTGCTACGTCTGATCAGAAAAGC
TCCCAGAAGCAGTTGGTGCATCATGTATTCCCAAAACTTGCCGTCTACAATTCAGTCGATCCTTCGCTGGCACCATCTCTTCTCATGGTAAGATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDLITADPSTTSAGSTSTSASSVQSSTISSSSNSSSSVLPTALGKPAGEKRSKRAALRQIQNDTISAAKAALIPVRTNIMPQRQSKKKPVSYSQWARSIHELAATSDQKS
SQKQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMVR

HG10007651 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome