; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10007660 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10007660
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionABC transporter G family member 12 like
Genome locationChr10:9478543..9483907
RNA-Seq ExpressionHG10007660
SyntenyHG10007660
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR018790 - Protein of unknown function DUF2358


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004139091.1 uncharacterized protein LOC101206988 [Cucumis sativus]5.3e-13884.31Show/hide
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XP_022973871.1 uncharacterized protein LOC111472460 [Cucurbita maxima]5.3e-13882.97Show/hide
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XP_023520646.1 uncharacterized protein LOC111784055 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-13883.28Show/hide
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XP_038879445.1 uncharacterized protein LOC120071318 [Benincasa hispida]3.8e-14488.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B999 uncharacterized protein LOC1034871955.6e-14184.83Show/hide
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A0A5D3CX50 Uncharacterized protein2.3e-11092.95Show/hide
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        AT AL+NPTTSVQEMVM+STS+LNIKWTI+GKPKSLV+AI GDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASAEAGKD ADS
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        VSSLTGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPTK
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A0A6J1DTK7 uncharacterized protein LOC1110238788.3e-13783.64Show/hide
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A0A6J1F169 uncharacterized protein LOC1114411884.4e-13882.66Show/hide
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A0A6J1I9U0 uncharacterized protein LOC1114724602.6e-13882.97Show/hide
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Query:  SAI-GDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASAEAGKDFADSVSSLTGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPTKFFQGEDNFQR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65230.1 Uncharacterized conserved protein (DUF2358)1.5e-8561.9Show/hide
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        NDS  T     E ++++SE DK+VD +DFGELCN+FEC SSP VESTARQL RDIL++R+G+R+   +AV VKYKDP+R F GREKYKR +W T  LENP
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Query:  TTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVSAI-GDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASAEAGKDFADSVSSLTGRV
        T +VQEMVM+STS+L IKWT+KGKPKS+++A+ GDLI+KV S+FTLNQISGQV EHEE WD+SSSS I+QA+FW SR LFA++E+ KD AD    LT  +
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Query:  STEKQNLEMFPDPSGDPTKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
        +T K++ +++ DP+ DP KFFQ +++F+RD YQ AL LAI+YFVVQFL+ T+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGAACAGCACCGAGCAATTGACGGTGGAATCCGCCGTCGAAAGATCGGAGGCTGATAAGATCGTAGACGGCATGGATTTCGGTGAGCTCTGCAACGAATTTGAGTGCATC
AGTAGCCCCTTGGTTGAATCTACTGCCAGGCAACTTGCTAGAGACATTCTTCAACTTCGCCAAGGCGATCGGTCTCTTGGAAAATTTGCCGTCTTTGTCAAGTATAAGGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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