; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10007992 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10007992
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptioncell wall-plasma membrane linker protein
Genome locationChr10:18368626..18369641
RNA-Seq ExpressionHG10007992
SyntenyHG10007992
Gene Ontology termsGO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EAX07174.1 hCG1793893, partial [Homo sapiens]2.3e-0442.28Show/hide
Query:  PSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPS-PIEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIP--
        P   PIPL P  L  P PT P  PS P  P   P  PL P+P  P   P+ P P +P  P PL+P  P +PS P  + LP  L  P LPP  +  L P  
Subjt:  PSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPS-PIEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIP--

Query:  -----PTSTKPLIPPTPIEPF-LPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPS
             P S  P  PP+P  P   PPIP  P+P    S  P  +PPLLPS
Subjt:  -----PTSTKPLIPPTPIEPF-LPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPS

PIT14970.1 hypothetical protein BGI32_06510 [Snodgrassella alvi]4.6e-0548.36Show/hide
Query:  EPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIE-PDETPIEPLLPTPTE-PDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPTST
        EP P APIE   PAP +P  P+PIE P   P+EP  P P E P   P EP P  P++P P AP++P  P APIE   P A IEP  PP +     PP   
Subjt:  EPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIE-PDETPIEPLLPTPTE-PDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPTST

Query:  KPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLP
        +P  PP PIEP  P +PT P+P
Subjt:  KPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLP

SKC16713.1 hypothetical protein SAMN06295926_13251, partial [Lysinibacillus sp. AC-3]5.0e-0437.06Show/hide
Query:  PLAPIELRSPA-PTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLP----TPTEP--DETPTEP-HPSTPIKPL-PLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLI
        P+AP++  SP  P  P  P +P+EP  TP+EP+ P    TP EP    TP EP  P  P+ P+ P+AP+ P+ P  P+E + P A + P  P T    ++
Subjt:  PLAPIELRSPA-PTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLP----TPTEP--DETPTEP-HPSTPIKPL-PLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLI

Query:  PPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLP
        P T  +P+ P TP+EP +P  P  P+  ++  T    + P+ P
Subjt:  PPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLP

XP_014529333.1 chaperone HSP70 [Blastocystis sp. subtype 4]1.0e-0437.8Show/hide
Query:  PSYEP-IPLAPIELRSP----APTQPRSPSPIEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHL
        PS EP IPL P     P     PT+P  P+P +P    + P LPTP +P   PTEP   TP +P+ L P++P IP+ P+   +P+   +P LPPT  E  
Subjt:  PSYEP-IPLAPIELRSP----APTQPRSPSPIEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHL

Query:  IPPTSTKPLIP------------PTPIEPFLPP----IPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPSTIQ
          PT  +P++P            PTP +P LPP    IPT P P+L  +     +PP +P+  Q
Subjt:  IPPTSTKPLIP------------PTPIEPFLPP----IPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPSTIQ

XP_031676261.1 uncharacterized protein LOC116371495 [Oncorhynchus kisutch]1.0e-0438.46Show/hide
Query:  DPSYEPIPLAPIELRSPAPTQP-RSPSPIEP--DETPIEPLL-------PTPTEPDETPTEPHP-STPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLP
        +P  EP P  P  L  P PT+P   P+P EP  + TP EPLL       PTP EP   PT P P   P  P P+   +P++   P E +L     EP L 
Subjt:  DPSYEPIPLAPIELRSPAPTQP-RSPSPIEP--DETPIEPLL-------PTPTEPDETPTEPHP-STPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLP

Query:  PTSTEHLIPPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPL-------------PLLSASTKPFVIPPLLPSTIQ-----HLELLSVPQ
        PT  E L+  T  +PL+ PTP EP L   PTEPL             PLL  + +P++  PLL  T++     H E  S PQ
Subjt:  PTSTEHLIPPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPL-------------PLLSASTKPFVIPPLLPSTIQ-----HLELLSVPQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1T5GTQ3 Uncharacterized protein (Fragment)7.1e-0434.93Show/hide
Query:  DPSYEPIPLAPIELRSPA-PTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLP-TPTEPDETPTEPHPSTPIKPL-PLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHL
        +P     P+ P+E  +P  P  P +P +P+EP  TP+EP+ P  P  P E  T   P TP++P+ P+AP+ P+ P  P+E + P A + P  P T  E +
Subjt:  DPSYEPIPLAPIELRSPA-PTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLP-TPTEPDETPTEPHPSTPIKPL-PLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHL

Query:  IPPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPST
         P T  +P++P  P+ P  P  P EP+  ++  T    + P+ P T
Subjt:  IPPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPST

A0A1T5H7M2 Uncharacterized protein (Fragment)2.4e-0437.06Show/hide
Query:  PLAPIELRSPA-PTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLP----TPTEP--DETPTEP-HPSTPIKPL-PLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLI
        P+AP++  SP  P  P  P +P+EP  TP+EP+ P    TP EP    TP EP  P  P+ P+ P+AP+ P+ P  P+E + P A + P  P T    ++
Subjt:  PLAPIELRSPA-PTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLP----TPTEP--DETPTEP-HPSTPIKPL-PLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLI

Query:  PPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLP
        P T  +P+ P TP+EP +P  P  P+  ++  T    + P+ P
Subjt:  PPTSTKPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLP

A0A2G8T0Z3 Uncharacterized protein7.1e-0440.32Show/hide
Query:  IPLAPIELRSPAPTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLPTPTEPDE-----TPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPT
        +PL P+E   P P +P  P  P+EP   P+EPL P P EP E      P EP P  P+ P  + P+ P++P  P   ++P   +EP  PP     L+PPT
Subjt:  IPLAPIELRSPAPTQPRSP-SPIEPDETPIEPLLPTPTEPDE-----TPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPT

Query:  STKPLIPPTPIE-PFLPPIPTEPL
          + L+PP+PIE P +P +P  PL
Subjt:  STKPLIPPTPIE-PFLPPIPTEPL

A0A2N9WTM6 Autotransporter domain-containing protein2.2e-0548.36Show/hide
Query:  EPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIE-PDETPIEPLLPTPTE-PDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPTST
        EP P APIE   PAP +P  P+PIE P   P+EP  P P E P   P EP P  P++P P AP++P  P APIE   P A IEP  PP +     PP   
Subjt:  EPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIE-PDETPIEPLLPTPTE-PDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPTST

Query:  KPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLP
        +P  PP PIEP  P +PT P+P
Subjt:  KPLIPPTPIEPFLPPIPTEPLP

A0A7D7LFS1 FecR domain-containing protein5.4e-0440.54Show/hide
Query:  DPSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIEPDETPIEPLLPTPTEPDE----TPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHL
        D   EP P+ PIE     P +P   +PIEP  TP+ P+ PTP  P E    TP E  P TPI+P P+ PI+P  P  PIE   P+  IE     T+    
Subjt:  DPSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIEPDETPIEPLLPTPTEPDE----TPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHL

Query:  IPPTSTKPL--IPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPST
        I PT   P+   P TPIEP  P  P EP P+    T P       P T
Subjt:  IPPTSTKPL--IPPTPIEPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G22120.1 cell wall-plasma membrane linker protein9.2e-0435.06Show/hide
Query:  PSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSP-----------IEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKP---LPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPF
        P+ +P P  P  ++ P P  P  P P             P  TP  P  P P+ P    T+P PSTP  P    P  P  P  P+    ++ P     P 
Subjt:  PSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSP-----------IEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKP---LPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPF

Query:  L-PPTSTEHLI-PPTSTKPLI-PPTPIEPFL-PPIPTEPLPLLSASTKPFVIPP
        + PPT T  ++ PPT T P+I PPTP  P + PP PT P+      T P V PP
Subjt:  L-PPTSTEHLI-PPTSTKPLI-PPTPIEPFL-PPIPTEPLPLLSASTKPFVIPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGATGCTAAGAAGCAGTATAGGGACACTCAAGTTGAGGAACGACCCGTTTACAAACCCAATGATATTGAGGGGAGCCCATCAGAATCACGTACATCACAGGACGG
TGAGGATGCTCATAGTCATTTTGGTGACTACAAGACTCACGAACATGAGTCTCAGGAGCACAAGACTTATGATCTTGAGACTCACCAACTGAGAGTTGTCCATTCGGAGC
CCACGAGGGGCGTAGGTATTCGTAGATCACTCAAGAACTTAGACGATAGGGGCAATGGTGTATTGAATGACGATGTCGAGAACATTCAATGTGATTTAGATGAAGATGAC
CCTAGTTATGAGCCCATTCCTCTAGCACCTATTGAGCTCCGTTCTCCAGCACCCACCCAGCCCCGTTCTCCATCACCCATCGAGCCTGACGAAACACCCATCGAGCCACT
TTTGCCAACACCCACCGAACCTGATGAAACACCCACTGAGCCCCATCCGTCAACACCCATCAAGCCTCTTCCTCTAGCACCCATTAAGCCCATTATTCCTTCGGCACCCA
TTGAGCTCATTCTTCCTTCAGCACTCATTGAGCCCTTTCTTCCTCCAACATCCACCGAGCACCTTATTCCTCCAACATCCACCAAGCCCCTTATTCCTCCAACACCCATT
GAGCCCTTTCTTCCTCCAATACCCACCGAACCCCTACCTCTTCTTTCAGCATCCACAAAGCCTTTCGTGATACCACCTCTGCTCCCATCAACCATACAACATCTTGAGCT
ACTCTCGGTTCCACAATTATTCAAGAGGTTGAAAATTAATGTTAGGGGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTGATGCTAAGAAGCAGTATAGGGACACTCAAGTTGAGGAACGACCCGTTTACAAACCCAATGATATTGAGGGGAGCCCATCAGAATCACGTACATCACAGGACGG
TGAGGATGCTCATAGTCATTTTGGTGACTACAAGACTCACGAACATGAGTCTCAGGAGCACAAGACTTATGATCTTGAGACTCACCAACTGAGAGTTGTCCATTCGGAGC
CCACGAGGGGCGTAGGTATTCGTAGATCACTCAAGAACTTAGACGATAGGGGCAATGGTGTATTGAATGACGATGTCGAGAACATTCAATGTGATTTAGATGAAGATGAC
CCTAGTTATGAGCCCATTCCTCTAGCACCTATTGAGCTCCGTTCTCCAGCACCCACCCAGCCCCGTTCTCCATCACCCATCGAGCCTGACGAAACACCCATCGAGCCACT
TTTGCCAACACCCACCGAACCTGATGAAACACCCACTGAGCCCCATCCGTCAACACCCATCAAGCCTCTTCCTCTAGCACCCATTAAGCCCATTATTCCTTCGGCACCCA
TTGAGCTCATTCTTCCTTCAGCACTCATTGAGCCCTTTCTTCCTCCAACATCCACCGAGCACCTTATTCCTCCAACATCCACCAAGCCCCTTATTCCTCCAACACCCATT
GAGCCCTTTCTTCCTCCAATACCCACCGAACCCCTACCTCTTCTTTCAGCATCCACAAAGCCTTTCGTGATACCACCTCTGCTCCCATCAACCATACAACATCTTGAGCT
ACTCTCGGTTCCACAATTATTCAAGAGGTTGAAAATTAATGTTAGGGGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSDAKKQYRDTQVEERPVYKPNDIEGSPSESRTSQDGEDAHSHFGDYKTHEHESQEHKTYDLETHQLRVVHSEPTRGVGIRRSLKNLDDRGNGVLNDDVENIQCDLDEDD
PSYEPIPLAPIELRSPAPTQPRSPSPIEPDETPIEPLLPTPTEPDETPTEPHPSTPIKPLPLAPIKPIIPSAPIELILPSALIEPFLPPTSTEHLIPPTSTKPLIPPTPI
EPFLPPIPTEPLPLLSASTKPFVIPPLLPSTIQHLELLSVPQLFKRLKINVRG