; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10008253 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10008253
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionF-box protein PP2-B10-like
Genome locationChr10:21270649..21271064
RNA-Seq ExpressionHG10008253
SyntenyHG10008253
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058299.1 F-box protein PP2-B10-like [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        EDEEIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PV IDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

TYK11855.1 F-box protein PP2-B10-like [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        EDEEIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PV IDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

XP_008453628.1 PREDICTED: F-box protein PP2-B10-like [Cucumis melo]2.4e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        EDEEIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PV IDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

XP_011656739.1 F-box protein PP2-B10 [Cucumis sativus]1.1e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        ED+EIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PVLIDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

XP_038880073.1 F-box protein PP2-B10-like [Benincasa hispida]1.1e-3577.06Show/hide
Query:  METEDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKV
        METE EE GDLSFMPEGVIANLLS T+PIDAC  +AVS IFNAAAQSDFVWDRFLPTD +VLI+QRKS    VDPIS+SKKEIFFSLCN+PVLIDDGNK 
Subjt:  METEDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKV

Query:  AGVGSVVGK
          +    GK
Subjt:  AGVGSVVGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LUI2 F-box domain-containing protein5.1e-3471.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        ED+EIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PVLIDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

A0A1S3BXH9 F-box protein PP2-B10-like1.1e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        EDEEIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PV IDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

A0A5A7UXP9 F-box protein PP2-B10-like1.1e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        EDEEIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PV IDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

A0A5D3CJZ0 F-box protein PP2-B10-like1.1e-3371.7Show/hide
Query:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV
        EDEEIGDLSF+PEGVIAN+LS T+PIDAC +AAVS +FNAAAQSDFVWDRFLP DW+VLIS RKS     DP+S+SKK+IFFSLCN+PV IDD NK   +
Subjt:  EDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGV

Query:  GSVVGK
            GK
Subjt:  GSVVGK

A0A6J1BZ47 F-box protein PP2-B10-like isoform X12.4e-3169.7Show/hide
Query:  TEDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVA
        TE EEI D S +PEGVIAN+LSLT P DACRS+ VS  F+AAAQSD VWDRFLPTDW  LI +RK  D N+DPIS+SKKEIFFSLC++P+L DDG K++
Subjt:  TEDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B151.4e-1546.88Show/hide
Query:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        +PE  +A +LS T+P D   SAAVS +F  A  SDFVW++FLPTD+  +IS R +D H    I +SKKE++  LC S +LID+G K+  +  + GK
Subjt:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

Q3E6P4 F-box protein At2g022404.2e-1744.79Show/hide
Query:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        +PE  I+N++S TSP DAC +A+VS  F +A  SD VWD+FLP ++E L+S+ +        +  SKKE++F+LC++PVLI+DG K   +    GK
Subjt:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

Q9C7K0 F-box protein VBF2.3e-1546.46Show/hide
Query:  LSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        +  +PE  IAN+L+ TSP DA  S+ VS +F  A  SDFVW++FLP+D++ LISQ  S DH+ +   +SKKEI+  LC+S +LID+  K+  +    GK
Subjt:  LSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

Q9FV02 F-box protein SKIP39.1e-2048.48Show/hide
Query:  LSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        L  +PEG I+N++S TSP DAC +AAVS IF +A +SD VW++FLPTD+E LI+  +        + +SKKE++FSLCN P+LI+DG     +    GK
Subjt:  LSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

Q9ZVR5 Putative F-box protein PP2-B23.6e-1644.19Show/hide
Query:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNK
        +PE  I+N++S TSP DAC +A+VS  F +A  SD VWD+FLP+D+  L+   +        + +SKKE++F++C++PVL++DG K
Subjt:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B159.6e-1746.88Show/hide
Query:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        +PE  +A +LS T+P D   SAAVS +F  A  SDFVW++FLPTD+  +IS R +D H    I +SKKE++  LC S +LID+G K+  +  + GK
Subjt:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

AT1G56250.1 phloem protein 2-B141.6e-1646.46Show/hide
Query:  LSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        +  +PE  IAN+L+ TSP DA  S+ VS +F  A  SDFVW++FLP+D++ LISQ  S DH+ +   +SKKEI+  LC+S +LID+  K+  +    GK
Subjt:  LSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

AT2G02240.1 F-box family protein3.0e-1844.79Show/hide
Query:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK
        +PE  I+N++S TSP DAC +A+VS  F +A  SD VWD+FLP ++E L+S+ +        +  SKKE++F+LC++PVLI+DG K   +    GK
Subjt:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGK

AT2G02250.1 phloem protein 2-B22.5e-1744.19Show/hide
Query:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNK
        +PE  I+N++S TSP DAC +A+VS  F +A  SD VWD+FLP+D+  L+   +        + +SKKE++F++C++PVL++DG K
Subjt:  MPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNK

AT2G02340.1 phloem protein 2-B83.7e-1643.48Show/hide
Query:  IGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNK
        + +L  +PE  ++ ++S TSP DAC  A+VS  F +A +SD VW++F+P ++E LISQ ++          SKKE++F+LC+  VLIDDG K
Subjt:  IGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACAGAGGACGAAGAAATTGGCGATTTATCTTTTATGCCCGAAGGAGTAATAGCCAACCTCTTATCTCTCACAAGTCCAATCGATGCCTGCAGGTCGGCGGCGGT
TTCCCCAATATTTAATGCGGCGGCGCAGTCGGATTTTGTATGGGACAGGTTCCTGCCTACCGATTGGGAAGTTTTGATTTCTCAGAGGAAATCTGATGATCACAATGTTG
ATCCAATTTCCACTTCGAAGAAGGAGATCTTTTTCTCCCTTTGCAACAGCCCGGTGCTAATTGACGACGGCAACAAGGTGGCCGGAGTTGGATCAGTGGTCGGCAAACAC
AACTCTGACTCCACCCCTGCCATCATCGGAAGTTGCCTTCCGAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACAGAGGACGAAGAAATTGGCGATTTATCTTTTATGCCCGAAGGAGTAATAGCCAACCTCTTATCTCTCACAAGTCCAATCGATGCCTGCAGGTCGGCGGCGGT
TTCCCCAATATTTAATGCGGCGGCGCAGTCGGATTTTGTATGGGACAGGTTCCTGCCTACCGATTGGGAAGTTTTGATTTCTCAGAGGAAATCTGATGATCACAATGTTG
ATCCAATTTCCACTTCGAAGAAGGAGATCTTTTTCTCCCTTTGCAACAGCCCGGTGCTAATTGACGACGGCAACAAGGTGGCCGGAGTTGGATCAGTGGTCGGCAAACAC
AACTCTGACTCCACCCCTGCCATCATCGGAAGTTGCCTTCCGAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METEDEEIGDLSFMPEGVIANLLSLTSPIDACRSAAVSPIFNAAAQSDFVWDRFLPTDWEVLISQRKSDDHNVDPISTSKKEIFFSLCNSPVLIDDGNKVAGVGSVVGKH
NSDSTPAIIGSCLPN