; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10008439 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10008439
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptiontranscription factor MYB24-like
Genome locationChr10:23148617..23149945
RNA-Seq ExpressionHG10008439
SyntenyHG10008439
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044676 - MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587655.1 Transcription factor MYB2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-11980Show/hide
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        DG RRHFD EQNSTSSESMDISQVSDPFSDVPSW N G E  AA+F+YP+GDS  QLT W+DDDDSFGGCLWNFDGLWQF
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XP_004137543.1 transcription factor MYB62 [Cucumis sativus]1.7e-12985Show/hide
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        DG RRHF  EQNSTSSES++ISQVSDPFSDVPSW+ GGGETAAANFEY +GDS LQ TDWIDDDDSF GCLWNFDGLWQF
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XP_008453409.1 PREDICTED: transcription factor MYB24-like [Cucumis melo]2.0e-12584.17Show/hide
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        MAS CK  S SPSPS SGSSS  EDDQ SEVRRGPWSVDEDSLLIHS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKPEV+RGNLSPQEQLLILDL
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        HSRWGNRWSKIAQ+LPGRTDNEIKNYWRT+VQKQA++LNI TNSPEFKD+INR WIPRL+HQIN+     SSSPPP  TA T PTPQ SDSDSLP   DG
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        NRRHF  EQNSTSSES++ISQVSDPFSDVPSW++GGGETAAANFEY  GDS LQ TDWIDDDDSF GCLWNFDGLWQF
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XP_023531056.1 transcription factor JAMYB-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-11879.57Show/hide
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        MAS CKSQS S S S SSSV ED+Q + +RRGPW+VDEDSLL+HS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKP+V RGNLSPQEQLLILDLHS
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        RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQA++LNI+TNS EFK++INRFWIPRLV QINESS   SSS SSPPP      RP  QLSD+D+LPA  D
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        G RRHFD EQNSTSSESMDISQVSDPFSDVPSW N G E  A +F+YP+GDS   LT W+DDDDSFGGCLWNFDGLWQF
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XP_038901337.1 transcription factor MYB62-like [Benincasa hispida]3.5e-13083.1Show/hide
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        MAS CK+++PS S+              SGSS V EDDQ SEVRRGPWSVDEDSLLIHS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKP+VKRGN
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Query:  LSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQL
        LSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQA+VLNIN NSPEFKD+I+R WIPRL+HQINE   SSSSSPPP TTAAT PTPQL
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        SDSDS+PA  DGNRRHFDKE+NSTSSESMDISQVSDP SDVPSW++GGG+T AANF+YP+GDSGLQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BWZ6 transcription factor MYB24-like9.7e-12684.17Show/hide
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        MAS CK  S SPSPS SGSSS  EDDQ SEVRRGPWSVDEDSLLIHS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKPEV+RGNLSPQEQLLILDL
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        HSRWGNRWSKIAQ+LPGRTDNEIKNYWRT+VQKQA++LNI TNSPEFKD+INR WIPRL+HQIN+     SSSPPP  TA T PTPQ SDSDSLP   DG
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        NRRHF  EQNSTSSES++ISQVSDPFSDVPSW++GGGETAAANFEY  GDS LQ TDWIDDDDSF GCLWNFDGLWQF
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A0A5D3DYB4 Transcription factor MYB24-like9.7e-12684.17Show/hide
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        MAS CK  S SPSPS SGSSS  EDDQ SEVRRGPWSVDEDSLLIHS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKPEV+RGNLSPQEQLLILDL
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        HSRWGNRWSKIAQ+LPGRTDNEIKNYWRT+VQKQA++LNI TNSPEFKD+INR WIPRL+HQIN+     SSSPPP  TA T PTPQ SDSDSLP   DG
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        NRRHF  EQNSTSSES++ISQVSDPFSDVPSW++GGGETAAANFEY  GDS LQ TDWIDDDDSF GCLWNFDGLWQF
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A0A6J1C0P4 transcription factor JAMYB-like3.4e-8665.33Show/hide
Query:  KSQSPSPSESGSSSVNEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNR
        KSQ+ S S   SS+V EDDQI  +RRGPW+ DEDSLLI S+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKP+VKRG+LSP EQLLILDLH RWGNR
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Query:  WSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDK
        WSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QA++LNI+TNSPEFKD+INRFWIPRLV QI+E SS+SS   PPS+++++  +PQLSDSD             +K
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Query:  EQNSTSSESMDISQVSDP--FSD-VPSWHNGGGETAAANFEYPLGDSGLQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF
             ++E  +    SDP  FSD VPSW++GGG     +F+YP+G    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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A0A6J1EF71 transcription factor JAMYB-like2.6e-11879.08Show/hide
Query:  MASHCKSQSPSPSESG--SSSVNEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDL
        MAS CKSQS S S+S   SSSV ED Q + +RRGPW+VDEDSLL+HS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKP+VKRGNLSPQEQLLILDL
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Query:  HSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSS----PPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPA
        HSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQA++LNI+TNS EFK++INRFWIPRLV QINESS+S SSS    PPP      RP  QLSD+D+LPA
Subjt:  HSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSS----PPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPA

Query:  GGDGNRRHFDKEQNSTSSESMDISQVSDPFSDVPSWHNGGGETAAANFEYPLGDSGLQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF
          DG RRHFD EQNSTSSESMDISQVSDPFSDVPSW N G E  AA+F+YP+GDS   LT W+DDDDSFGGCLWNFDGLWQF
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A0A6J1I942 transcription factor MYB62-like1.4e-11377.78Show/hide
Query:  MASHCKSQSPSPSESGSSSVNEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHS
        MAS CK+Q  S S S SSSV ED+Q + +RRGPW+VDEDSLL+HS+SVHGEGRWNLLAIRSGL+RTGKSCRLRWLNYLKP+VKRGNLSPQEQLLILDLHS
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Query:  RWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESS---SSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGD
        RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQA++LNI+TNS EFK++IN FWIPRLVHQINESS   SSS SSPPP      R   QLSD+D+LPA  D
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Query:  GNRRHFDKEQNSTSSESMDISQVSDPFSDVPSWHNGGGETAAANFEYPLGDSGLQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF
        G  RHFD EQNSTSSES+DISQVSDPFSDVPSW N   E  AA FEYP+G+S   LT W+DDDD+FGGCLWNFDGLWQF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10MB4 Transcription factor MYB28.6e-5560Show/hide
Query:  SSVNEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRT
        +S  E+    ++RRGPW+V+ED LL++ ++ HGEGRWN LA  +GLKRTGKSCRLRWLNYL+P+++RGN++PQEQLLIL+LHSRWGNRWSKIAQ LPGRT
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Query:  DNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLS
        DNEIKNYWRTRVQK A+ L  + NS +FKDV+   W+PRLV +I  +++         T      TP LS
Subjt:  DNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLS

Q2QZJ8 Transcription factor JAMYB2.5e-5462.42Show/hide
Query:  SQSPSPSESGSSSVNEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRW
        S  P P E   ++       +E+RRGPW+VDED  LI+ +S HGEGRWN LA  +GLKRTGKSCRLRWLNYL+P+VKRGN + +EQLLILDLHSRWGNRW
Subjt:  SQSPSPSESGSSSVNEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRW

Query:  SKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSS
        SKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQK A+ LN + NS  FKD +   W+PRL  +I+  + +   S
Subjt:  SKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSS

Q9C9G7 Transcription factor MYB622.5e-5454.4Show/hide
Query:  EDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEI
        ++ +  E+RRGPW+++ED+LL + +  +GEGRWN +A  +GLKRTGKSCRLRWLNYLKP+++RGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKIAQ LPGRTDNEI
Subjt:  EDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEI

Query:  KNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSES
        KNYWRTRVQKQAR LNI +NS +F D +  FW+PRL+ ++ ++SS++++   P               DSL    D +   F     S+S+ +
Subjt:  KNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSES

Q9FGY3 Transcription factor MYB785.2e-5263.82Show/hide
Query:  EVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRT
        +VRRGPW+V+ED  LI+ ++ HGEGRWN LA  + LKRTGKSCRLRWLNYL+P+V+RGN++ +EQLLIL+LH+RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRT
Subjt:  EVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRT

Query:  RVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAA
        RVQK A+ L  + NS +FKD +   W+PRLV +I  +S  S S     TT++
Subjt:  RVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAA

Q9LDE1 Transcription factor MYB1085.2e-5257.74Show/hide
Query:  ESGSSSVNED-DQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQE
        E G S  N + +   +++RGPW+ +ED  L++ ++ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+P+V+RGN++ +EQLLIL+LHSRWGNRWSKIAQ 
Subjt:  ESGSSSVNED-DQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQE

Query:  LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAAT
        LPGRTDNEIKNYWRTRVQK A+ L  + NS +FKD +   W+PRLV +I  +S+SS+++   +TT  T
Subjt:  LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAAT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G25340.1 myb domain protein 1161.9e-5745.62Show/hide
Query:  NEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNE
        N +++ +E R+GPW+++ED+LL + +S +GEGRWNLLA  SGLKR GKSCRLRWLNYLKP++KRGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKI++ LPGRTDN+
Subjt:  NEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNE

Query:  IKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSESMDISQV
        IKNYWRTRVQKQAR LNI++NS +F +V+  FW PRL+++I ++S +++        A     P L DS  L            ++   T S+ MD S +
Subjt:  IKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSESMDISQV

Query:  SDPFSDVPSWHNGGGETAAANF---------EYPLGDSG---------LQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF
            S   S   GG     +           EY +   G           + D   +DD     +WN D +WQF
Subjt:  SDPFSDVPSWHNGGGETAAANF---------EYPLGDSG---------LQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF

AT1G25340.2 myb domain protein 1167.5e-5444.16Show/hide
Query:  NEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNE
        N +++ +E R+GPW+++ED+LL + +S +GEGRWNLLA     K +GKSCRLRWLNYLKP++KRGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKI++ LPGRTDN+
Subjt:  NEDDQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQELPGRTDNE

Query:  IKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSESMDISQV
        IKNYWRTRVQKQAR LNI++NS +F +V+  FW PRL+++I ++S +++        A     P L DS  L            ++   T S+ MD S +
Subjt:  IKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSESMDISQV

Query:  SDPFSDVPSWHNGGGETAAANF---------EYPLGDSG---------LQLTDWIDDDDSFGGCLWNFDGLWQF
            S   S   GG     +           EY +   G           + D   +DD     +WN D +WQF
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AT1G48000.1 myb domain protein 1122.6e-5456.57Show/hide
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        E+RRGPW+V+ED  L+  +S+HGEGRWN L+  +GL RTGKSCRLRWLNYL+P+++RG++S QEQ +IL+LHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRT
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        RVQK A++L  + NS +FKD I   W+PRL+ +I   +S   +S+   P  ++    T   S S+++ +   GGD
Subjt:  RVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQI--NESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPA---GGD

AT1G68320.1 myb domain protein 621.8e-5554.4Show/hide
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        ++ +  E+RRGPW+++ED+LL + +  +GEGRWN +A  +GLKRTGKSCRLRWLNYLKP+++RGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKIAQ LPGRTDNEI
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Query:  KNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSES
        KNYWRTRVQKQAR LNI +NS +F D +  FW+PRL+ ++ ++SS++++   P               DSL    D +   F     S+S+ +
Subjt:  KNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSES

AT3G06490.1 myb domain protein 1083.7e-5357.74Show/hide
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        E G S  N + +   +++RGPW+ +ED  L++ ++ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+P+V+RGN++ +EQLLIL+LHSRWGNRWSKIAQ 
Subjt:  ESGSSSVNED-DQISEVRRGPWSVDEDSLLIHSVSVHGEGRWNLLAIRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPEVKRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQE

Query:  LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAAT
        LPGRTDNEIKNYWRTRVQK A+ L  + NS +FKD +   W+PRLV +I  +S+SS+++   +TT  T
Subjt:  LPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAAT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCATTGCAAGAGCCAGAGCCCGAGCCCGAGCGAGAGCGGGTCGTCGAGTGTTAATGAAGACGACCAAATTAGTGAGGTTAGAAGAGGGCCATGGAGTGTTGA
TGAAGATTCTCTTCTTATTCATTCTGTTTCTGTTCATGGTGAAGGGCGATGGAATTTGCTTGCTATTCGTTCAGGGCTTAAAAGGACAGGGAAGAGTTGCAGATTGAGAT
GGCTTAATTATCTAAAACCTGAAGTGAAGAGAGGAAATCTTTCTCCTCAAGAACAGCTTTTGATTCTCGACCTTCATTCCAGATGGGGCAATAGGTGGTCAAAGATTGCA
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CGTTATCAACCGCTTTTGGATCCCCAGATTGGTCCACCAAATAAACGAATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCGCCGTCGACCACGGCGGCGACTCGCCCAACCC
CTCAACTTTCCGATTCAGACTCGCTGCCGGCAGGCGGCGATGGGAACCGTCGCCATTTCGACAAGGAGCAAAATAGCACCAGTTCGGAATCTATGGATATCTCTCAGGTC
TCCGATCCATTCTCCGATGTCCCATCTTGGCACAACGGCGGCGGAGAGACGGCGGCGGCGAATTTTGAATACCCATTAGGGGATTCCGGGTTGCAATTAACGGATTGGAT
TGACGACGACGATTCTTTTGGCGGCTGCTTATGGAACTTTGACGGATTGTGGCAATTCTAA
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ATGGCTTCTCATTGCAAGAGCCAGAGCCCGAGCCCGAGCGAGAGCGGGTCGTCGAGTGTTAATGAAGACGACCAAATTAGTGAGGTTAGAAGAGGGCCATGGAGTGTTGA
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GGCTTAATTATCTAAAACCTGAAGTGAAGAGAGGAAATCTTTCTCCTCAAGAACAGCTTTTGATTCTCGACCTTCATTCCAGATGGGGCAATAGGTGGTCAAAGATTGCA
CAAGAATTACCGGGAAGAACGGACAATGAAATAAAAAATTATTGGAGGACGAGAGTGCAAAAACAAGCAAGGGTTCTTAACATCAACACCAACAGCCCAGAATTTAAAGA
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TGACGACGACGATTCTTTTGGCGGCTGCTTATGGAACTTTGACGGATTGTGGCAATTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QELPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARVLNINTNSPEFKDVINRFWIPRLVHQINESSSSSSSSPPPSTTAATRPTPQLSDSDSLPAGGDGNRRHFDKEQNSTSSESMDISQV
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